Sequenzierung des gesamten Genoms auf der Neugeborenen-Intensivstation

1,0 Ziele

1.1 Studienziele Das Ziel dieses Forschungsprojekts besteht darin, das Potenzial für die Anwendung der Gesamtgenomsequenzierung (WGS) als diagnostisches Instrument auf der Intensivstation für Neugeborene zu bewerten. Neugeborene, die auf der Neugeborenen-Intensivstation (NICU) behandelt werden müssen, leiden häufig an genetischen Defekten, deren Art schwer zu diagnostizieren ist. Den Forschern sind derzeit mehr als 5000 Gene bekannt, in denen Mutationen Krankheiten verursachen können, die Neugeborene betreffen können. Daher ist es schwierig zu bestimmen, welches Gen für die Krankheit eines neuen Neugeborenen verantwortlich ist. Viele dieser Krankheiten können jedoch wirksam behandelt werden, wenn sie rechtzeitig diagnostiziert werden. Die Forscher schlagen vor, neue Sequenzierungsinstrumente in Verbindung mit schnellen Analysetools zu verwenden, um NICU-Patienten zusammen mit beiden Elternteilen zu sequenzieren, um festzustellen, ob ein Patient eine De-novo-Mutation oder zusammengesetzte heterozygote Varianten in einem der bekannten Krankheitsgene trägt. In diesem Fall wird die Mutation in einem hauseigenen CLIA-Labor bestätigt und die Ergebnisse innerhalb von 72 Stunden den behandelnden Neonatologen zur Verfügung gestellt, um Behandlungsentscheidungen zu treffen.

1.2 Primäre Studienendpunkte

Das Hauptziel dieses Protokolls wird eine Beurteilung des Ausmaßes sein, in dem WGS die Diagnose von auf der neonatologischen Intensivstation aufgenommenen Patienten verbessert. Die Forscher schlagen vor, im Laufe dieses Projekts eine Sequenzierung bei etwa 50 Patienten durchzuführen. Die Forscher werden fortlaufend die Erfolgsquote bei der Identifizierung klinisch verwertbarer genetischer Defekte bei den ausgewählten Patienten bewerten, insbesondere da dies die anfänglichen Auswahlkriterien beeinflussen würde, die bei der Aufnahme des Patienten verwendet werden. Diese Informationen werden nützlich sein, um festzustellen, ob solche Sequenzierungsbemühungen das Ergebnis von NICU-Patienten verbessern können und welche Patientengruppe am wahrscheinlichsten von dem Verfahren profitieren wird.

1.3 Sekundäre Studienendpunkte

Ein zweites Ziel wird eine Bewertung der Wirksamkeit der gezielten Sequenzierung des gesamten Exoms oder einer Gruppe von 5000 Genen bei der Identifizierung der genetischen Defekte sein, die durch die Sequenzierung des gesamten Genoms aufgedeckt werden, sowie der relativen finanziellen und zeitlichen Kosten der verschiedenen Ansätze. Dies könnte zu einer deutlich effizienteren und kostengünstigeren Methode führen als die derzeit an anderer Stelle beschriebene.

Schließlich schlagen die Forscher vor, die Daten zu nutzen, um mit der Entwicklung einer Kosten-Nutzen-Analyse von WGS auf der neonatologischen Intensivstation zu beginnen. Die Forscher werden beurteilen, inwieweit WGS eine Diagnose gestellt hat, die sich von der ursprünglich von den Neonatologen vorgeschlagenen unterscheidet, und inwieweit diese Änderung der Diagnose das Behandlungsschema verändert hat. Sollte die neue Diagnose tatsächlich zu einer Änderung der Behandlung führen, würden die Forscher anhand historischer Daten beurteilen, inwieweit sich diese geänderte Behandlung auf die Anzahl der Tage auswirkte, die der Patient auf der neonatologischen Intensivstation blieb. Die Forscher können dann die Kosteneinsparungen/-verluste abschätzen, indem die Anzahl der eingesparten Tage auf der Intensivstation multipliziert mit den Kosten pro Tag des Aufenthaltes auf der Intensivstation im Vergleich zu den Kosten für die Durchführung der Sequenzierung für die gesamte Kohorte sequenzierter Patienten wird. Obwohl dies nicht so streng ist wie eine randomisierte klinische Studie, würde es doch darauf hinweisen, ob es sich hierbei um eine Methodik handelt, die es wert ist, eingehender untersucht zu werden.