新生儿重症监护病房的全基因组测序

1.0 目标

1.1 研究目标 本研究项目的目标是评估将全基因组测序 (WGS) 作为新生儿重症监护病房诊断工具的应用潜力。 需要在新生儿重症监护病房 (NICU) 接受治疗的新生儿通常患有遗传缺陷，其性质难以诊断。 研究人员目前知道有 5000 多个基因发生突变，这些基因的突变可能会导致影响新生儿的疾病，因此要确定哪个基因导致了新的新生儿患者的疾病是一项艰巨的任务。 然而，如果及时诊断，其中许多疾病都可以得到有效治疗。 研究人员建议使用新的测序仪器和快速分析工具对 NICU 患者及其父母进行测序，以确定患者是否携带已知疾病基因之一的新发突变或复合杂合变异。 如果是这样，该突变将在内部 CLIA 实验室得到确认，并在 72 小时内将结果提供给主治新生儿科医生，以告知治疗决策。

1.2 主要研究终点

该协议的主要目标是评估 WGS 在多大程度上改善了对进入 NICU 的患者的诊断。 研究人员建议在该项目的过程中对大约 50 名患者进行测序。 研究人员将持续评估在选定患者中识别临床上可操作的遗传缺陷的成功率，特别是因为这将为用于招募患者的初始选择标准提供信息。 这些信息将有助于确定此类测序工作是否可以改善 NICU 患者的结果，以及哪类患者最有可能从该程序中受益。

1.3 次要研究终点

第二个目标是评估整个外显子组或一组 5000 个基因的靶向测序在识别全基因组测序揭示的遗传缺陷方面的有效性，以及各种方法在金钱和时间上的相对成本。 这可能会产生比目前在其他地方描述的方法更有效和成本效益更高的方法。

最后，研究人员建议使用这些数据开始对 NICU 中的 WGS 进行成本效益分析。 研究人员将评估 WGS 提供的诊断在多大程度上不同于新生儿科医生最初提出的诊断，以及诊断的改变在多大程度上改变了治疗方案。 如果新诊断确实改变了治疗，研究人员将使用历史数据来评估治疗改变对患者留在新生儿重症监护病房的天数的影响程度。 然后，研究人员可以估算成本节省/损失，因为节省的 NICU 天数乘以 NICU 居住的每天成本与对整个测序患者队列执行测序的成本。 虽然这不像随机临床试验那样严格，但它表明这是否是一种值得更深入探索的方法。