HPV 陰性 HNSCC の治療反応と予後を予測するための MicroRNA の発現とエピジェネティックなサイレンシング
2025年5月20日 更新者：New Mexico Cancer Research Alliance
INST 1008: HPV 陰性頭頸部扁平上皮癌 (HNSCC) の治療反応と予後を予測するためのマイクロ RNA の発現とエピジェネティックなサイレンシング
原発性HPV陰性HNSCC患者におけるmiR発現とmiRプロモーターのメチル化と治療への反応と予後との関連を包括的に評価するために、2部構成の分子疫学研究が実施される。
パート 1 は、HNSCC 患者における腫瘍から離れた新鮮な正常粘膜組織 25 対の前向きのコレクションです。
最終的には、15 個の HPV 陰性腫瘍-粘膜ペアが、腫瘍内で発現が上方制御または下方制御されている miR を同定する発見研究に利用される予定です。
パート 2 では、1990 年以降に収集された、ニューメキシコ大学病院 (UNMH) で保管されている HPV 陰性 HNSCC のすべての手術症例について、miR 発現と miR プロモーターのメチル化と治療反応と生存との関連性を検証します。
調査の概要
詳細な説明
* パート 1、腫瘍から離れた正常な新鮮なペアの将来的なコレクション
研究者らは、将来的に25対の新鮮なHNSCC腫瘍から離れた正常な粘膜組織を収集する予定である。
* パート 2、HNSCC における miR と治療反応および予後との関連に関する遡及的分子疫学研究。
研究者らは、1990年以降に収集されたUNMHのHPV陰性HNSCC外科手術症例の全症例について、miR発現とmiRプロモーターのメチル化との関連性、治療に対する反応と生存率を包括的に検査する予定である。 唇および非角化性鼻咽頭の症例は、病因学的に異なり、それぞれ皮膚 SCC または EB ウイルス感染に関連しているため、除外されます。 性別、年齢、人種、民族を理由に除外されるケースはありません。
研究の種類
観察的
入学 (推定)
25
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
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New Mexico
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Albuquerque、New Mexico、アメリカ、87106
- University of New Mexico - Cancer Center
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参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
18年歳以上 (大人、高齢者)
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
サンプリング方法
非確率サンプル
調査対象母集団
HNSCCが既知または疑われる患者
説明
包含基準:
HNSCC と診断されている、または疑われる患者
- 非角化性鼻咽頭 SCC または唇 SCC を除く、任意の原発部位を含めることができます。
- 患者は、HNSCC が疑われる場合の診断生検、または HNSCC の治療手術を受けることが計画されています。
- 研究生検に先立って、患者は頭頸部への放射線照射を受けていません。
- 患者は研究生検の前にHNSCCの診断のための化学療法を受けていない。
- 年齢 > 18 歳。
- Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) のパフォーマンス ステータスは 0 ～ 2。
- 患者はインフォームドコンセントに署名し、記載された研究の目的で新鮮な腫瘍生検および遠隔の正常粘膜生検に同意します。 研究生検は、計画された手術に加えて行われます。 腫瘍切除が計画されている場合、腫瘍の代表的な部分が研究目的で提出されます。
除外基準:
- 非角化性上咽頭癌
- 口唇扁平上皮癌
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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ヒトパピローマウイルス (HPV) 陰性の頭頸部扁平上皮癌 (HNSCC) 患者の新鮮腫瘍と遠隔正常粘膜で発現が 2 倍以上増加または減少する腫瘍特異的マイクロ RNA (miR) を特定します。
時間枠：15 個の HPV 陰性腫瘍粘膜サンプルのペアを収集し、シーケンスを完了するために必要な期間、最長 10 年間
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新鮮な腫瘍と離れた正常なペアの SOLiD シーケンスにより、HNSCC 腫瘍で発現が変化している miR が発見されます。
SOLiD シーケンシングは、既知および新規 miR の発現に関する完全な定量的データを提供します。
HPV関連腫瘍は全HNSCCの約20%を占め、古典的にタバコやアルコールに関連するHPV陰性腫瘍とは生物学的に異なるため、この発見実験ではp16過剰発現のないHNSCCのみが使用されます。
この制限により、サンプルの均一性が向上し、HPV 陰性 HNSCC の病因に関連する miR の検出力が向上します。
同定された miR は、腫瘍と正常のペアおよび p16 陰性 HNSCC 細胞株 (n>15) において qPCR アッセイを使用して検証されます。
さらに、HNSCC で調節不全であることが以前に報告されている miR は、SOLiD シーケンス発見段階で特定されなかったとしても、同様の検証を受ける予定です。
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15 個の HPV 陰性腫瘍粘膜サンプルのペアを収集し、シーケンスを完了するために必要な期間、最長 10 年間
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HPV 陰性 HNSCC における発現低下がプロモーターのメチル化による miR の特定
時間枠：シーケンスの完了と結果の分析に必要な期間、最長 5 年間
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結果 1 で特定された腫瘍組織で発現が低下した miR は、UCSC データベースをチェックすることによって CpG リッチ プロモーターについて精査されます。
miR の CpG に富むプロモーターのメチル化状態は、腫瘍対正常のペア (n=15) および p16 陰性 HNSCC 細胞株 (n>15) において COBRA アッセイによって検査されます。
CpG リッチ プロモーター全体にわたるメチル化状態の不均一性は、COBRA PCR 産物を使用した重硫酸塩配列決定によって特徴付けられます。
プロモーターのメチル化による miR のサイレンシングは、腫瘍と正常のペアと HNSCC 細胞株のメチル化カテゴリー間の平均 miR 発現レベルを比較することによって検査されます。
これは主に記述的な研究です。
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シーケンスの完了と結果の分析に必要な期間、最長 5 年間
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患者の医療記録を使用して、腫瘍特異的 miR の発現、miR メチル化、HPV 陰性 HNSCC の治療反応と予後との間の統計的関連性を定義する
時間枠：医療記録からの情報の収集と分析に必要な期間、最長 5 年間
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HPV 陰性 HNSCC の治療反応と予後は、ニューメキシコ腫瘍登録 (NMTR) の患者の症例ファイルと UNMH の患者の医療記録という 2 つの情報源から収集されます。
qRT PCR は、ホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE) 組織から抽出された RNA における miR 発現を定量するように設計されます。
メチル化特異的 PCR (MSP) は、すべての遡及的臨床サンプルにおける大規模なメチル型判定を容易にするように設計されます。
一次分析はHPV陰性HNSCCで実施されます。
二次分析は、p16 過剰発現の有無にかかわらず、すべての HNSCC を含めて実行されます。
p16 の過剰発現ステータスは二次解析で調整されます。
miR 発現状態 (高または低) および miR メチル化状態 (はいまたはいいえ) と患者の PFS および OS との関連性は、カプラン マイヤー生存プロットおよびログランク検定を使用して検査されます。
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医療記録からの情報の収集と分析に必要な期間、最長 5 年間
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
捜査官
- 主任研究者：Garth Olson, MD、University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2010年12月17日
一次修了 (実際)
2020年2月13日
研究の完了 (実際)
2023年3月14日
試験登録日
最初に提出
2019年5月8日
QC基準を満たした最初の提出物
2019年5月14日
最初の投稿 (実際)
2019年5月16日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2025年5月22日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2025年5月20日
最終確認日
2025年5月1日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- INST 1008
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
いいえ
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
いいえ
米国FDA規制機器製品の研究
いいえ
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