Expresión y silenciamiento epigenético de microARN para predecir la respuesta terapéutica y el pronóstico de HNSCC HPV-negativo
20 de mayo de 2025 actualizado por: New Mexico Cancer Research Alliance
INST 1008: Expresión y silenciamiento epigenético de microARN para predecir la respuesta terapéutica y el pronóstico del carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello (HNSCC) VPH negativo
Se llevará a cabo un estudio epidemiológico molecular de dos partes para evaluar exhaustivamente la asociación entre la expresión de miR y la metilación del promotor de miR y la respuesta a la terapia y el pronóstico en pacientes primarios con HNSCC negativos para VPH.
La Parte 1 será una colección prospectiva de 25 pares de tejido mucoso normal distante del tumor fresco en pacientes con HNSCC.
En última instancia, se utilizarán 15 pares de tumor-mucosa negativos para VPH para el trabajo de descubrimiento en la identificación de miR cuya expresión está regulada hacia arriba o hacia abajo en los tumores.
La Parte 2 probará la asociación entre la expresión de miR y la metilación del promotor de miR, y la respuesta terapéutica y la supervivencia en todos los casos quirúrgicos archivados de HNSCC HPV-negativos en el Hospital de la Universidad de Nuevo México (UNMH) recopilados después de 1990.
Descripción general del estudio
Estado
Terminado
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
* Parte 1, Colección prospectiva de pares normales distantes de tumor fresco
Los investigadores recolectarán prospectivamente 25 pares de tejido mucoso normal distante del tumor HNSCC fresco.
* Parte 2, Estudio retrospectivo de epidemiología molecular de la asociación de miR con respuesta terapéutica y pronóstico en HNSCC.
Los investigadores evaluarán exhaustivamente la asociación entre la expresión de miR y la metilación del promotor de miR, y la respuesta a la terapia y la supervivencia en todos los casos de HNSCC quirúrgico con VPH negativo en UNMH recopilados después de 1990. Se excluirán los casos de labios y nasofaríngeos no queratinizantes, ya que son etiológicamente distintos y están relacionados con el SCC cutáneo o con la infección por el virus EB, respectivamente. No se excluirán casos por motivos de género, edad, raza o etnia.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Estimado)
25
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Ubicaciones de estudio
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New Mexico
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Albuquerque, New Mexico, Estados Unidos, 87106
- University of New Mexico - Cancer Center
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Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
18 años y mayores (Adulto, Adulto Mayor)
Acepta Voluntarios Saludables
No
Método de muestreo
Muestra no probabilística
Población de estudio
Pacientes con HNSCC conocido o sospechado
Descripción
Criterios de inclusión:
Pacientes con un diagnóstico conocido o sospechado de HNSCC
- Puede incluirse cualquier sitio primario, excepto el SCC nasofaríngeo no queratinizante o el SCC labial.
- Los pacientes están programados para biopsias diagnósticas por sospecha de HNSCC o para cirugía terapéutica por HNSCC.
- Los pacientes son vírgenes a la radiación en la cabeza y el cuello, antes de las biopsias de investigación.
- Los pacientes no han recibido quimioterapia para el diagnóstico de HNSCC, antes de las biopsias de investigación.
- Edad > 18 años.
- Estado funcional del Grupo Oncológico Cooperativo del Este (ECOG) de 0-2.
- Los pacientes firman un consentimiento informado, aceptando la biopsia de tumor fresco, así como la biopsia de mucosa normal a distancia para los fines de la investigación descrita. Las biopsias de investigación se sumarán a la cirugía planificada. En los casos en que se planifique la resección del tumor, se entregará una parte representativa del tumor para fines de investigación.
Criterio de exclusión:
- Carcinoma nasofaríngeo no queratinizante
- Carcinoma de células escamosas del labio
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Identificar microARN específicos de tumor (miR) cuya expresión aumenta o disminuye más de 2 veces en tumor fresco frente a mucosa normal distante de pacientes con carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello (HNSCC) negativo para el virus del papiloma humano (VPH)
Periodo de tiempo: El tiempo que sea necesario para recolectar 15 pares de muestras de mucosa y tumor negativas para VPH y completar la secuenciación, hasta 10 años
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La secuenciación SOLiD de pares normales distantes de tumor fresco descubrirá miRs cuya expresión está alterada en tumores HNSCC.
La secuenciación SOLiD proporcionará datos completamente cuantitativos para la expresión de miR conocidos y novedosos.
Debido a que los tumores relacionados con el VPH comprenden aproximadamente el 20 % de todos los HNSCC y son biológicamente distintos de los tumores negativos al VPH asociados clásicamente con el tabaco y el alcohol, en este experimento de descubrimiento solo se utilizará el HNSCC sin sobreexpresión de p16.
Esta restricción aumentará la homogeneidad de las muestras y la potencia para detectar miRs asociados con la etiología del HNSCC HPV-negativo.
Los miR identificados se validarán mediante el ensayo qPCR en los pares normales de tumor y en líneas celulares HNSCC negativas para p16 (n> 15).
Además, los miR que anteriormente se informó que estaban desregulados en HNSCC estarán sujetos a una validación similar, incluso si no se identificaron durante la fase de descubrimiento de secuenciación de SOLiD.
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El tiempo que sea necesario para recolectar 15 pares de muestras de mucosa y tumor negativas para VPH y completar la secuenciación, hasta 10 años
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Identificar miRs cuya expresión reducida en HNSCC VPH-negativo se debe a la metilación del promotor
Periodo de tiempo: El tiempo que sea necesario para completar la secuenciación y analizar los resultados, hasta 5 años
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Los miR con expresión reducida en tejido tumoral identificados en el Resultado 1 se analizarán en busca de promotores ricos en CpG mediante la verificación de la base de datos de UCSC.
El estado de metilación de los promotores de miR ricos en CpG se examinará mediante el ensayo COBRA en pares tumorales frente a normales (n = 15) y en líneas celulares HNSCC negativas para p16 (n> 15).
La heterogeneidad del estado de metilación en el promotor rico en CpG se caracterizará mediante secuenciación con bisulfato usando el producto COBRA PCR.
El silenciamiento de miR por metilación del promotor se examinará comparando los niveles medios de expresión de miR entre las categorías de metilación para los pares de tumor normal y para las líneas celulares HNSCC.
Este es principalmente un estudio descriptivo.
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El tiempo que sea necesario para completar la secuenciación y analizar los resultados, hasta 5 años
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Definir la asociación estadística entre la expresión de miR específicos del tumor, la metilación de miR y la respuesta terapéutica y el pronóstico del HNSCC VPH negativo utilizando registros médicos de pacientes
Periodo de tiempo: El tiempo que sea necesario para recopilar y analizar información de registros médicos, hasta 5 años
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La respuesta terapéutica y el pronóstico del HNSCC negativo para VPH se recopilarán de dos fuentes: el expediente del caso del paciente del Registro de Tumores de Nuevo México (NMTR) y del expediente médico de UNMH del paciente.
qRT PCR se diseñará para cuantificar la expresión de miR en el ARN extraído de los tejidos fijados en formalina e incluidos en parafina (FFPE).
Se diseñará una PCR específica de metilación (MSP) para facilitar la tipificación de metilo a gran escala en todas las muestras clínicas retrospectivas.
El análisis primario se realizará en HNSCC HPV-negativo.
Se realizará un análisis secundario para incluir todos los HNSCC, con y sin sobreexpresión de p16.
El estado de sobreexpresión de p16 se ajustará en el análisis secundario.
La asociación entre el estado de expresión de miR (alto o bajo) y el estado de metilación de miR (sí o no), y la SLP y la SG del paciente se examinarán mediante diagramas de supervivencia de Kaplan-Meier y la prueba de rango logarítmico.
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El tiempo que sea necesario para recopilar y analizar información de registros médicos, hasta 5 años
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Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
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Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Garth Olson, MD, University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
17 de diciembre de 2010
Finalización primaria (Actual)
13 de febrero de 2020
Finalización del estudio (Actual)
14 de marzo de 2023
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
8 de mayo de 2019
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
14 de mayo de 2019
Publicado por primera vez (Actual)
16 de mayo de 2019
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
22 de mayo de 2025
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
20 de mayo de 2025
Última verificación
1 de mayo de 2025
Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- INST 1008
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
NO
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
No
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
No
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