Espressione e silenziamento epigenetico del microRNA per la previsione della risposta terapeutica e della prognosi dell'HNSCC negativo all'HPV
20 maggio 2025 aggiornato da: New Mexico Cancer Research Alliance
INST 1008: Espressione e silenziamento epigenetico di microRNA per prevedere la risposta terapeutica e la prognosi del carcinoma a cellule squamose della testa e del collo HPV-negativo (HNSCC)
Verrà condotto uno studio epidemiologico molecolare in due parti per valutare in modo completo l'associazione tra l'espressione di miR e la metilazione del promotore di miR e la risposta alla terapia e la prognosi nei pazienti HNSCC primari HPV-negativi.
La parte 1 sarà una raccolta prospettica di 25 paia di tessuto mucoso normale fresco distante dal tumore in pazienti con HNSCC.
Infine, 15 coppie tumore-mucosa HPV-negative saranno utilizzate per il lavoro di scoperta nell'identificazione di miR la cui espressione è up- o down-regolata nei tumori.
La parte 2 testerà l'associazione tra l'espressione di miR e la metilazione del promotore di miR, la risposta terapeutica e la sopravvivenza in tutti i casi chirurgici archiviati di HNSCC HPV-negativo presso l'University of New Mexico Hospital (UNMH) raccolti dopo il 1990.
Panoramica dello studio
Stato
Completato
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
* Parte 1, Raccolta prospettica di coppie normali distanti dal tumore fresco
Gli investigatori raccoglieranno in modo prospettico 25 paia di tessuto mucoso normale distante dal tumore HNSCC fresco.
* Parte 2, studio retrospettivo di epidemiologia molecolare sull'associazione di miR con risposta terapeutica e prognosi nell'HNSCC.
Gli investigatori testeranno in modo completo l'associazione tra espressione di miR e metilazione del promotore di miR e la risposta alla terapia e la sopravvivenza in tutti i casi di HNSCC chirurgico HPV-negativo presso l'UNMH raccolti dopo il 1990. I casi labiali e rinofaringei non cheratinizzanti saranno esclusi in quanto questi sono eziologicamente distinti e correlati rispettivamente al SCC cutaneo o all'infezione da virus EB. Nessun caso sarà escluso per sesso, età, razza o etnia.
Tipo di studio
Osservativo
Iscrizione (Stimato)
25
Contatti e Sedi
Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.
Luoghi di studio
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New Mexico
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Albuquerque, New Mexico, Stati Uniti, 87106
- University of New Mexico - Cancer Center
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Criteri di partecipazione
I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
18 anni e precedenti (Adulto, Adulto più anziano)
Accetta volontari sani
No
Metodo di campionamento
Campione non probabilistico
Popolazione di studio
Pazienti con HNSCC noto o sospetto
Descrizione
Criterio di inclusione:
Pazienti con diagnosi nota o sospetta di HNSCC
- Può essere inclusa qualsiasi sede primitiva, ad eccezione del SCC rinofaringeo non cheratinizzante o del SCC labiale.
- I pazienti sono programmati per biopsie diagnostiche per sospetto HNSCC o per chirurgia terapeutica per HNSCC.
- I pazienti sono naïve alle radiazioni alla testa e al collo, prima delle biopsie di ricerca.
- I pazienti non hanno ricevuto chemioterapia per la diagnosi di HNSCC, prima delle biopsie di ricerca.
- Età > 18 anni.
- Performance status dell'Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) di 0-2.
- I pazienti firmano un consenso informato, accettando la biopsia del tumore fresco e la biopsia della mucosa normale a distanza per gli scopi della ricerca descritta. Le biopsie di ricerca saranno in aggiunta alla chirurgia programmata. Nei casi in cui è prevista la resezione del tumore, una parte rappresentativa del tumore sarà sottoposta a fini di ricerca.
Criteri di esclusione:
- Carcinoma rinofaringeo non cheratinizzante
- Carcinoma a cellule squamose del labbro
Piano di studio
Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Identificare i microRNA specifici del tumore (miR) la cui espressione aumenta o diminuisce di oltre 2 volte nel tumore fresco rispetto alla mucosa normale distante da pazienti con carcinoma a cellule squamose della testa e del collo (HNSCC) negativo per il papillomavirus umano (HPV)
Lasso di tempo: Per tutto il tempo necessario per raccogliere 15 coppie di campioni tumore-mucosa HPV-negativi e completare il sequenziamento, fino a 10 anni
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Il sequenziamento SOLiD di nuove coppie normali distanti dal tumore scoprirà miR la cui espressione è alterata nei tumori HNSCC.
Il sequenziamento di SOLiD fornirà dati completamente quantitativi per l'espressione di miR noti e nuovi.
Poiché i tumori correlati all'HPV comprendono circa il 20% di tutti gli HNSCC e sono biologicamente distinti dai tumori negativi all'HPV associati classicamente al tabacco e all'alcool, in questo esperimento di scoperta verrà utilizzato solo l'HNSCC senza sovraespressione di p16.
Questa restrizione aumenterà l'omogeneità dei campioni e la capacità di rilevare i miR associati all'eziologia dell'HNSCC HPV-negativo.
I miR identificati saranno validati mediante qPCR nelle coppie tumore-normale e nelle linee cellulari HNSCC p16-negative (n>15).
Inoltre, i miR precedentemente segnalati come disregolati nell'HNSCC saranno sottoposti a validazione simile, anche se non identificati durante la fase di scoperta del sequenziamento SOLiD.
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Per tutto il tempo necessario per raccogliere 15 coppie di campioni tumore-mucosa HPV-negativi e completare il sequenziamento, fino a 10 anni
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Identificare i miR la cui ridotta espressione nell'HNSCC HPV-negativo è dovuta alla metilazione del promotore
Lasso di tempo: Per tutto il tempo necessario per completare il sequenziamento e analizzare i risultati, fino a 5 anni
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i miR con ridotta espressione nel tessuto tumorale identificati nell'Esito 1 saranno esaminati per i promotori ricchi di CpG controllando il database UCSC.
Lo stato di metilazione dei promotori ricchi di CpG dei miR sarà esaminato mediante saggio COBRA in coppie tumorali vs. normali (n=15) e in linee cellulari HNSCC p16-negative (n>15).
L'eterogeneità dello stato di metilazione attraverso il promotore ricco di CpG sarà caratterizzata dal sequenziamento del bisolfato usando il prodotto COBRA PCR.
Il silenziamento dei miR mediante metilazione del promotore sarà esaminato confrontando i livelli medi di espressione di miR tra le categorie di metilazione per le coppie tumore-normale e per le linee cellulari HNSCC.
Questo è principalmente uno studio descrittivo.
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Per tutto il tempo necessario per completare il sequenziamento e analizzare i risultati, fino a 5 anni
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Definire l'associazione statistica tra l'espressione di miR specifici del tumore, la metilazione di miR e la risposta terapeutica e la prognosi dell'HNSCC HPV-negativo utilizzando le cartelle cliniche dei pazienti
Lasso di tempo: Per tutto il tempo necessario per raccogliere e analizzare le informazioni dalle cartelle cliniche, fino a 5 anni
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La risposta terapeutica e la prognosi dell'HNSCC HPV-negativo saranno raccolte da due fonti: la cartella clinica del paziente dal New Mexico Tumor Registry (NMTR) e dalla cartella clinica UNMH del paziente.
qRT PCR sarà progettato per quantificare l'espressione di miR nell'RNA estratto dai tessuti fissati in formalina e inclusi in paraffina (FFPE).
Sarà progettata una PCR specifica per la metilazione (MSP) per facilitare la tipizzazione metilica su larga scala in tutti i campioni clinici retrospettivi.
L'analisi primaria sarà eseguita in HNSCC HPV-negativo.
Verrà condotta un'analisi secondaria per includere tutti gli HNSCC, con e senza sovraespressione di p16.
lo stato di sovraespressione di p16 verrà regolato nell'analisi secondaria.
L'associazione tra stato di espressione di miR (alto o basso) e stato di metilazione di miR (sì o no) e PFS e OS del paziente sarà esaminata utilizzando grafici di sopravvivenza di Kaplan-Meier e log-rank test.
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Per tutto il tempo necessario per raccogliere e analizzare le informazioni dalle cartelle cliniche, fino a 5 anni
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Collaboratori e investigatori
Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.
Collaboratori
Investigatori
- Investigatore principale: Garth Olson, MD, University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
Studiare le date dei record
Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
17 dicembre 2010
Completamento primario (Effettivo)
13 febbraio 2020
Completamento dello studio (Effettivo)
14 marzo 2023
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
8 maggio 2019
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
14 maggio 2019
Primo Inserito (Effettivo)
16 maggio 2019
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
22 maggio 2025
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
20 maggio 2025
Ultimo verificato
1 maggio 2025
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- INST 1008
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?
NO
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
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