Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Ekspresjon og epigenetisk demping av mikroRNA for å forutsi terapeutisk respons og prognose av HPV-negativ HNSCC

9. januar 2024 oppdatert av: New Mexico Cancer Care Alliance

INST 1008: Ekspresjon og epigenetisk demping av mikroRNA for å forutsi terapeutisk respons og prognose av HPV-negativt plateepitelkarsinom i hode og hals (HNSCC)

En todelt molekylær epidemiologisk studie vil bli utført for å vurdere sammenhengen mellom miR-ekspresjon og miR-promoter-metylering og responsen på terapi og prognose hos primære, HPV-negative HNSCC-pasienter. Del 1 vil være en prospektiv samling av 25 par friskt tumor-fjernt normalt slimhinnevev hos pasienter med HNSCC. Til syvende og sist vil 15 HPV-negative svulst-slimhinnepar bli brukt til oppdagelsesarbeid for å identifisere miR-er hvis uttrykk er opp- eller nedregulert i svulster. Del 2 vil teste assosiasjonen mellom miR-uttrykk og miR-promoter-metylering, og terapeutisk respons og overlevelse i alle arkiverte kirurgiske tilfeller av HPV-negativ HNSCC ved University of New Mexico Hospital (UNMH) samlet inn etter 1990.

Studieoversikt

Status

Aktiv, ikke rekrutterende

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

* Del 1, Prospektiv samling av friske svulstfjerne normale par

Etterforskerne vil prospektivt samle 25 par friskt HNSCC tumor-fjern normalt slimhinnevev.

* Del 2, Retrospective Molecular Epidemiology Study of Association of miRs with Therapeutic Response and Prognosis in HNSCC.

Etterforskerne vil utførlig teste sammenhengen mellom miR-ekspresjon og miR-promoter-metylering, og responsen på terapi og overlevelse i alle tilfeller av kirurgisk HPV-negativ HNSCC ved UNMH samlet etter 1990. Leppe- og ikke-keratiniserende nasofaryngeale tilfeller vil bli ekskludert da disse er etiologisk forskjellige og relatert til henholdsvis kutan SCC eller EB-virusinfeksjon. Ingen tilfeller vil bli ekskludert på grunn av kjønn, alder, rase eller etnisitet.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Antatt)

25

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

  • Forente stater
    • New Mexico
      • Albuquerque, New Mexico, Forente stater, 87106
        • University of New Mexico - Cancer Center

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år og eldre (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Pasienter med kjent eller mistenkt HNSCC

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Pasienter med en kjent eller mistenkt diagnose av HNSCC

    • Et hvilket som helst primært sted kan inkluderes, bortsett fra ikke-keratiniserende nasofaryngeal SCC eller lip SCC.
    • Pasienter planlegges for diagnostiske biopsier for mistanke om HNSCC, eller for terapeutisk kirurgi for HNSCC.
    • Pasienter er naive for stråling til hode og nakke før forskningsbiopsier.
    • Pasienter har ikke mottatt kjemoterapi for diagnosen HNSCC, før forskningsbiopsier.
  • Alder > 18 år.
  • Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) ytelsesstatus på 0-2.
  • Pasienter signerer et informert samtykke, og godtar ny tumorbiopsi så vel som fjern normal slimhinnebiopsi for formål med beskrevet forskning. Forskningsbiopsier vil komme i tillegg til planlagt operasjon. I tilfeller hvor det planlegges svulstreseksjon vil en representativ del av svulsten sendes inn til forskningsformål.

Ekskluderingskriterier:

  • Ikke-keratiniserende nasofaryngealt karsinom
  • Plateepitelkarsinom i leppene

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Identifiser tumorspesifikke mikroRNAer (miRs) hvis uttrykk øker eller reduseres med over 2 ganger i fersk tumor vs. fjern normal slimhinne fra pasienter med plateepitelkarsinom i hode og nakke (HNSCC) negativt for humant papillomavirus (HPV)
Tidsramme: Så lenge det er nødvendig for å samle 15 HPV-negative tumor-slimhinneprøvepar og fullstendig sekvensering, opptil 10 år
SOLiD-sekvensering av friske tumor-fjerne normale par vil oppdage miRs hvis uttrykk er endret i HNSCC-svulster. SOLiD-sekvensering vil gi fullstendig kvantitative data for uttrykket av kjente og nye miRs. Fordi HPV-relaterte svulster utgjør omtrent 20 % av all HNSCC og er biologisk forskjellige fra HPV-negative svulster som er klassisk assosiert med tobakk og alkohol, vil bare HNSCC uten p16-overekspresjon bli brukt i dette oppdagelseseksperimentet. Denne begrensningen vil øke homogeniteten til prøvene og evnen til å oppdage miRs assosiert med etiologien til HPV-negativ HNSCC. De identifiserte miR-ene vil bli validert ved hjelp av qPCR-analyse i tumornormale parene og i p16-negative HNSCC-cellelinjer (n>15). I tillegg vil miR-er som tidligere er rapportert å være dysregulert i HNSCC, bli utsatt for lignende validering, selv om de ikke blir identifisert under SOLiD-sekvenseringsoppdagelsesfasen.
Så lenge det er nødvendig for å samle 15 HPV-negative tumor-slimhinneprøvepar og fullstendig sekvensering, opptil 10 år
Identifiser miRs hvis reduserte uttrykk i HPV-negative HNSCC skyldes promotormetylering
Tidsramme: Så lenge det er nødvendig for å fullføre sekvensering og analysere resultater, opptil 5 år
miR med redusert uttrykk i tumorvev identifisert under utfall 1 vil bli undersøkt for CpG-rike promotere ved å sjekke UCSC-databasen. Metyleringsstatusen til CpG-rike promotorer av miRs vil bli undersøkt ved COBRA-analyse i tumor vs. normale par (n=15) og i p16-negative HNSCC-cellelinjer (n>15). Heterogeniteten til metyleringsstatus over den CpG-rike promoteren vil bli karakterisert ved bisulfatsekvensering ved bruk av COBRA PCR-produktet. Dempingen av miRs ved promotermetylering vil bli undersøkt ved å sammenligne gjennomsnittlige miR-ekspresjonsnivåer mellom metyleringskategoriene for tumornormale parene og for HNSCC-cellelinjene. Dette er først og fremst en beskrivende studie.
Så lenge det er nødvendig for å fullføre sekvensering og analysere resultater, opptil 5 år
Definer den statistiske assosiasjonen mellom uttrykket av tumorspesifikke miRs, miR-metylering og den terapeutiske responsen og prognosen for HPV-negativ HNSCC ved bruk av pasientjournaler
Tidsramme: Så lenge det er nødvendig for å samle inn og analysere informasjon fra journaler, opptil 5 år
Den terapeutiske responsen og prognosen for HPV-negativ HNSCC vil bli samlet inn fra to kilder: pasientens saksmappe fra New Mexico Tumor Registry (NMTR) og fra pasientens UNMH-journal. qRT PCR vil bli designet for å kvantifisere miR-ekspresjonen i RNA ekstrahert fra det formalinfikserte, parafininnstøpte (FFPE) vevet. En metyleringsspesifikk PCR (MSP) vil bli utformet for å lette storskala metyltyping i alle retrospektive kliniske prøver. Den primære analysen vil bli utført i HPV-negativ HNSCC. En sekundær analyse vil bli utført for å inkludere alle HNSCC, med og uten p16 overekspresjon. p16 overekspresjonsstatus vil bli justert i den sekundære analysen. Sammenhengen mellom miR-ekspresjonsstatus (høy eller lav) og miR-metyleringsstatus (ja eller nei), og pasientens PFS og OS vil bli undersøkt ved bruk av Kaplan-Meier overlevelsesplott og log-rank test.
Så lenge det er nødvendig for å samle inn og analysere informasjon fra journaler, opptil 5 år

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

New Mexico Cancer Care Alliance

Samarbeidspartnere

Lovelace Respiratory Research Institute

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Garth Olson, MD, University of New Mexico Comprehensive Cancer Center

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

17. desember 2010

Primær fullføring (Faktiske)

13. februar 2020

Studiet fullført (Antatt)

31. desember 2026

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

8. mai 2019

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

14. mai 2019

Først lagt ut (Faktiske)

16. mai 2019

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

11. januar 2024

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

9. januar 2024

Sist bekreftet

1. januar 2024

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • INST 1008

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

NEI

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Kliniske studier på Ikke intervensjonell

Søk i lignende forsøk

Sponsorer og samarbeidspartnere

Medisinsk tilstand

Legemiddelintervensjoner

CROs by country

CROs in Guinea

Forhold

Sjeldne sykdommer

Legemiddelintervensjoner

Kosttilskudd

Sponsor / samarbeidspartnere

Steder

3
Abonnere