Expressão e silenciamento epigenético de microRNA para prever resposta terapêutica e prognóstico de HNSCC negativo para HPV
20 de maio de 2025 atualizado por: New Mexico Cancer Research Alliance
INST 1008: Expressão e Silenciamento Epigenético de MicroRNA para Prever a Resposta Terapêutica e Prognóstico de Carcinoma Espinocelular de Cabeça e Pescoço (HNSCC) negativo para HPV
Um estudo epidemiológico molecular em duas partes será conduzido para avaliar de forma abrangente a associação entre a expressão de miR e a metilação do promotor de miR e a resposta à terapia e prognóstico em pacientes HNSCC primários, negativos para HPV.
A parte 1 será uma coleção prospectiva de 25 pares de tecido mucoso normal distante do tumor fresco em pacientes com HNSCC.
Por fim, 15 pares de tumor-mucosa HPV-negativos serão utilizados para o trabalho de descoberta na identificação de miRs cuja expressão é regulada para cima ou para baixo em tumores.
A Parte 2 testará a associação entre a expressão de miR e a metilação do promotor de miR, e a resposta terapêutica e sobrevida em todos os casos cirúrgicos arquivados de HNSCC HPV-negativo no Hospital da Universidade do Novo México (UNMH) coletados após 1990.
Visão geral do estudo
Status
Concluído
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
* Parte 1, Coleta Prospectiva de Pares Novos de Tumor-Normais Distantes
Os investigadores irão coletar prospectivamente 25 pares de tecido mucoso normal distante do tumor HNSCC fresco.
* Parte 2, Estudo Retrospectivo de Epidemiologia Molecular da Associação de miRs com Resposta Terapêutica e Prognóstico em HNSCC.
Os investigadores testarão exaustivamente a associação entre a expressão do miR e a metilação do promotor do miR, e a resposta à terapia e sobrevida em todos os casos de HNSCC cirúrgico HPV-negativo na UNMH coletados após 1990. Casos labiais e nasofaríngeos não queratinizados serão excluídos por serem etiologicamente distintos e relacionados a CEC cutâneo ou infecção pelo vírus da EB, respectivamente. Nenhum caso será excluído devido a gênero, idade, raça ou etnia.
Tipo de estudo
Observacional
Inscrição (Estimado)
25
Contactos e Locais
Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.
Locais de estudo
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New Mexico
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Albuquerque, New Mexico, Estados Unidos, 87106
- University of New Mexico - Cancer Center
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Critérios de participação
Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
18 anos e mais velhos (Adulto, Adulto mais velho)
Aceita Voluntários Saudáveis
Não
Método de amostragem
Amostra Não Probabilística
População do estudo
Pacientes com HNSCC conhecido ou suspeito
Descrição
Critério de inclusão:
Pacientes com diagnóstico conhecido ou suspeito de HNSCC
- Qualquer sítio primário pode ser incluído, exceto CCE nasofaríngeo não queratinizado ou CEC labial.
- Os pacientes são planejados para biópsias diagnósticas para suspeita de HNSCC ou para cirurgia terapêutica para HNSCC.
- Os pacientes são virgens de radiação na cabeça e pescoço, antes das biópsias de pesquisa.
- Os pacientes não receberam quimioterapia para o diagnóstico de HNSCC, antes das biópsias de pesquisa.
- Idade > 18 anos.
- Status de desempenho do Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) de 0-2.
- Os pacientes assinam um consentimento informado, concordando com a biópsia do tumor a fresco, bem como com a biópsia da mucosa normal à distância para fins da pesquisa descrita. Biópsias de pesquisa serão adicionadas à cirurgia planejada. Nos casos em que a ressecção do tumor é planejada, uma parte representativa do tumor será submetida para fins de pesquisa.
Critério de exclusão:
- Carcinoma não queratinizante de nasofaringe
- Carcinoma Espinocelular de Lábio
Plano de estudo
Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Identificar microRNAs específicos do tumor (miRs) cuja expressão aumenta ou diminui em mais de 2 vezes em tumor fresco versus mucosa normal distante de pacientes com carcinoma de células escamosas de cabeça e pescoço (HNSCC) negativo para papilomavírus humano (HPV)
Prazo: O tempo necessário para coletar 15 pares de amostras de tumor-mucosa HPV-negativas e sequenciamento completo, até 10 anos
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O sequenciamento SOLID de novos pares normais distantes do tumor descobrirá miRs cuja expressão é alterada em tumores HNSCC.
O sequenciamento SOLiD fornecerá dados totalmente quantitativos para a expressão de miRs conhecidos e novos.
Como os tumores relacionados ao HPV compreendem aproximadamente 20% de todos os HNSCC e são biologicamente distintos dos tumores negativos para o HPV classicamente associados ao tabaco e ao álcool, apenas o HNSCC sem superexpressão de p16 será usado neste experimento de descoberta.
Essa restrição aumentará a homogeneidade das amostras e o poder de detecção de miRs associados à etiologia do HNSCC HPV-negativo.
Os miRs identificados serão validados por meio de ensaio de qPCR nos pares tumor-normal e em linhagens celulares HNSCC p16-negativas (n>15).
Além disso, miRs previamente relatados como desregulados em HNSCC serão submetidos a validação semelhante, mesmo que não sejam identificados durante a fase de descoberta de sequenciamento SOLiD.
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O tempo necessário para coletar 15 pares de amostras de tumor-mucosa HPV-negativas e sequenciamento completo, até 10 anos
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Identificar miRs cuja expressão reduzida em HNSCC negativo para HPV é devido à metilação do promotor
Prazo: O tempo necessário para concluir o sequenciamento e analisar os resultados, até 5 anos
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miRs com expressão reduzida em tecido tumoral identificado no Resultado 1 serão examinados para promotores ricos em CpG, verificando o banco de dados UCSC.
O estado de metilação dos promotores ricos em CpG de miRs será examinado pelo ensaio COBRA em pares tumorais vs. normais (n=15) e em linhagens de células HNSCC p16-negativas (n>15).
A heterogeneidade do status de metilação através do promotor rico em CpG será caracterizada por sequenciamento de bissulfato usando o produto COBRA PCR.
O silenciamento de miRs pela metilação do promotor será examinado comparando os níveis médios de expressão de miR entre as categorias de metilação para os pares tumor-normais e para as linhagens de células HNSCC.
Este é um estudo essencialmente descritivo.
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O tempo necessário para concluir o sequenciamento e analisar os resultados, até 5 anos
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Definir a associação estatística entre a expressão de miRs específicos do tumor, metilação de miR e a resposta terapêutica e prognóstico de HNSCC HPV-negativo usando registros médicos de pacientes
Prazo: Pelo tempo necessário para coletar e analisar informações de prontuários, até 5 anos
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A resposta terapêutica e o prognóstico de HNSCC negativo para HPV serão coletados de duas fontes: o arquivo do caso do paciente do Registro de Tumores do Novo México (NMTR) e do prontuário médico do UNMH do paciente.
qRT PCR será projetado para quantificar a expressão de miR em RNA extraído de tecidos fixados em formalina e embebidos em parafina (FFPE).
Uma PCR específica de metilação (MSP) será projetada para facilitar a tipagem de metil em larga escala em todas as amostras clínicas retrospectivas.
A análise primária será realizada em HNSCC HPV-negativo.
Uma análise secundária será realizada para incluir todos os HNSCC, com e sem superexpressão de p16.
O status de superexpressão de p16 será ajustado na análise secundária.
A associação entre o estado de expressão do miR (alto ou baixo) e o estado de metilação do miR (sim ou não), e PFS e OS do paciente será examinada usando gráficos de sobrevivência de Kaplan-Meier e o teste de log-rank.
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Pelo tempo necessário para coletar e analisar informações de prontuários, até 5 anos
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Colaboradores e Investigadores
É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.
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Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Garth Olson, MD, University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
Datas de registro do estudo
Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
17 de dezembro de 2010
Conclusão Primária (Real)
13 de fevereiro de 2020
Conclusão do estudo (Real)
14 de março de 2023
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
8 de maio de 2019
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
14 de maio de 2019
Primeira postagem (Real)
16 de maio de 2019
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
22 de maio de 2025
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
20 de maio de 2025
Última verificação
1 de maio de 2025
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- INST 1008
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
NÃO
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Não
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
Não
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