JAK阻害剤で治療された関節リウマチ患者の転帰を予測するための微生物叢分析 (MARAJA)

個々の患者が理想的なパーソナライズされた治療とレジメンを受ける個別化医療は、患者のケアを改善する大きな可能性を秘めています。 ただし、以前の研究では、関節リウマチ (RA) 患者における疾患修飾性抗リウマチ薬 (DMARD) に対する応答の有効な予測因子を確立できませんでした。 JAK 阻害剤は、抗 TNF 薬よりも優れている可能性のある優れた有効性を備えた新しいクラスの DMARD です。 化学物質があるため、その製造コストは生物学的療法よりもはるかに安く、おそらく今後数年間で患者のケアの中心になるでしょう. 現在、ウパダシチニブ（UPA）、トファシチニブ、バリシチニブの 3 種類が利用可能です。 私たちの研究はUPAに焦点を当てます。 臨床転帰は主に、i) 薬物の代謝と濃度に影響を与える要因、および ii) 薬物標的と患者の疾患に関与する炎症経路との間の妥当性に依存します。 人間は何兆もの細菌を腸内に持ち込んでおり、現在ではそれらが健康と病気の主役であることが知られています。 これらの細菌は多くの酵素を保有しており、人間の酵素の発現を強力に調節します。 実際、腸内微生物叢は、経口薬を直接代謝し、TOFA を代謝する主要な酵素であるシトクロム P450 3A4 (CYP3A4) の発現を制御することができます。 予備的なマウス実験で、腸内細菌叢の組成を変更すると、シグナル伝達経路に対する JAKi の効果が変化することが示されました。 したがって、免疫活性化のマーカーと一緒に腸内微生物叢の組成を含むモデルは、UPAで治療されたRA患者の臨床転帰を予測すると考えています。

主な目的と副次的な目的: 微生物叢の分析と免疫活性化マーカーに基づいて、UPA で治療された RA 患者の臨床転帰 (有効性と安全性) の予測モデルを構築すること。

方法論:

この多施設縦断的前向き研究には、メトトレキサートに対する反応が不十分な RA 患者 60 人が含まれます。 研究された臨床転帰は、リウマチEULARに対するヨーロッパリーグによって定義された3か月でのEULAR無反応（主要転帰）、6か月での低疾患活動性の達成、または偶発的な有害事象（二次転帰）です。 腸内微生物叢は、解凍した糞便サンプルからベースラインおよび M3 で評価されます。 QIAamp DNA スツール ミニ キット (Qiagen) を使用して DNA を精製し、Qubit および TapeStation 4200 (Agilent) を使用して適格性を確認します。 ライブラリーは、細菌の 16S rRNA 遺伝子からの V1-V2 および V3-V4 領域の増幅によって調製され、q-PCR によって認定され、アンプリコンは MiSeq (Illumina) によって配列決定されます。 QIIME2ソフトウェアを使用して、最初のバイオインフォマティクス分析と分類法を実施します。 免疫活性化は、JAK STAT シグナル伝達経路 RT² プロファイラー PCR Array (Qiagen) による JAK-STAT 経路活性化によって評価されます。これは、Jak および Stat を介したシグナル伝達に関連する 84 の遺伝子の発現をプロファイルします。 UPA濃度は、ベースラインと3か月で液体クロマトグラフィー-タンデム質量分析（LC-MS / MS）によって評価されます。 マイクロバイオーム、JAK STAT シグナル伝達経路の遺伝子発現および臨床データを組み込んだ統計分類子 (ニューラル ネットワーク アルゴリズム、線形および二次判別分析、サポート ベクター マシン、ランダム フォレスト、収縮法、または最近傍法) を使用して、UPA 臨床に関連するプロファイルを決定します。レスポンスと安全性。 有害事象またはフォローアップの喪失のためにUPAを時期尚早に（3か月前に）中止する患者は、非応答者と見なされます。