Análisis de microbiota para predecir los resultados de pacientes con artritis reumatoide tratados con inhibidor de JAK (MARAJA)

La medicina personalizada en la que cada paciente recibiría el tratamiento y el régimen personalizados ideales es una gran promesa para mejorar la atención del paciente. Sin embargo, estudios previos no lograron establecer predictores validados de respuesta a fármacos antirreumáticos modificadores de la enfermedad (FARME) en pacientes con artritis reumatoide (AR). Los inhibidores de JAK son una nueva clase de FAME con una gran eficacia que podría ser incluso superior a los fármacos anti-TNF. Como existen productos químicos, su coste de producción es mucho más económico que las terapias biológicas y probablemente serán centrales en la atención de los pacientes en los próximos años. Actualmente hay tres disponibles: upadacitinib (UPA), tofacitinib y baricitinib. Nuestro estudio se centrará en UPA. Los resultados clínicos dependen principalmente de i) los factores que influyen en el metabolismo y las concentraciones del fármaco y ii) la adecuación entre el objetivo del fármaco y las vías de inflamación implicadas en la enfermedad del paciente. Los seres humanos llevan en sus intestinos billones de gérmenes, que ahora se sabe que son actores clave en la salud y la enfermedad. Esos gérmenes poseen muchas enzimas y modulan fuertemente la expresión de enzimas humanas. La microbiota intestinal puede, de hecho, metabolizar directamente los fármacos orales y controlar la expresión del citocromo P450 3A4 (CYP3A4), la principal enzima que metaboliza TOFA. Mostramos, en un experimento preliminar con ratones, que la modificación de la composición de la microbiota intestinal cambia los efectos de JAKi en las vías de señalización. Por lo tanto, creemos que los modelos que incluyen la composición de la microbiota intestinal junto con los marcadores de activación inmunitaria predecirán los resultados clínicos en pacientes con AR tratados con UPA.

Objetivos principales y secundarios: Construir modelos predictivos de resultados clínicos (eficacia y seguridad) de pacientes con AR tratados con UPA basados ​​en análisis de microbiota y marcadores de activación inmune.

Metodología:

Este estudio prospectivo longitudinal multicéntrico incluirá a 60 pacientes con AR y respuesta inadecuada al metotrexato. Los resultados clínicos estudiados serán la falta de respuesta a EULAR a los 3 meses según la definición de la liga europea contra el reumatismo EULAR (resultado principal), el logro de una actividad baja de la enfermedad a los 6 meses o eventos adversos incidentes (resultados secundarios). La microbiota intestinal se evaluará al inicio y M3 a partir de muestras fecales descongeladas. El ADN se purificará con el mini kit de heces de ADN QIAamp (Qiagen) y se calificará con Qubit y TapeStation 4200 (Agilent). La biblioteca se preparará mediante la amplificación de las regiones V1-V2 y V3-V4 de los genes bacterianos 16S rRNA y se calificará mediante q-PCR y los amplicones se secuenciarán mediante MiSeq (Illumina). Los análisis bioinformáticos y taxonomías iniciales se realizarán utilizando el software QIIME2. La activación inmunitaria se evaluará a través de la activación de la vía JAK-STAT mediante la matriz de PCR del perfilador RT² de la vía de señalización JAK STAT (Qiagen), que perfila la expresión de 84 genes relacionados con la señalización mediada por Jak y Stat. Las concentraciones de UPA se evaluarán mediante cromatografía líquida-espectrometría de masas en tándem (LC-MS/MS) al inicio del estudio ya los 3 meses. Los clasificadores estadísticos (algoritmo de red neuronal, análisis discriminante lineal y cuadrático, máquina de vectores de soporte, bosques aleatorios, métodos de contracción o vecinos más cercanos) que incorporan microbioma, expresión génica de la vía de señalización JAK STAT y datos clínicos, se utilizarán para determinar los perfiles asociados con la UPA clínica. respuesta y seguridad. Los pacientes que suspendan prematuramente el UPA (antes de los 3 meses) por eventos adversos o pérdida de seguimiento serán considerados como no respondedores.