Mikrobiota-elemzés a JAK-gátlóval kezelt rheumatoid arthritises betegek kimenetelének előrejelzésére (MARAJA)

A személyre szabott orvoslás, amelyben minden páciens az ideális, személyre szabott kezelést és rendet kapja, nagy ígéretet jelent a betegellátás javításában. A korábbi vizsgálatok azonban nem tudták megállapítani a betegséget módosító antireumatikus gyógyszerekre (DMARD) adott válasz validált előrejelzőit rheumatoid arthritisben (RA) szenvedő betegeknél. A JAK-inhibitorok a DMARD-ok új osztálya, amely nagy hatékonysággal még jobb is lehet, mint az anti-TNF gyógyszerek. Mivel vannak vegyszerek, ezek előállítási költsége jóval olcsóbb, mint a biológiai terápiáké, és a következő években valószínűleg központi szerepet kapnak majd a betegellátásban. Jelenleg három áll rendelkezésre: az upadacitinib (UPA) tofacitinib és a baricitinib. Tanulmányunk az UPA-ra fog összpontosítani. A klinikai kimenetelek főként i) a gyógyszer metabolizmusát és koncentrációját befolyásoló tényezőktől, valamint ii) a gyógyszer célpontja és a beteg betegségében szerepet játszó gyulladási útvonalak közötti megfelelőségtől függenek. Az emberek több billió baktériumot hordoznak a bélrendszerükben, amelyekről ma már ismert, hogy kulcsszereplői az egészségnek és a betegségeknek. Ezek a csírák sok enzimet tartalmaznak, és erősen modulálják az emberi enzimek expresszióját. A bélmikrobióta valóban képes közvetlenül metabolizálni az orális gyógyszereket, és szabályozni a citokróm P450 3A4 (CYP3A4), a TOFA-t metabolizáló fő enzim expresszióját. Egy előzetes egérkísérletben kimutattuk, hogy a bél-mikrobióta összetételének módosítása megváltoztatja a JAKi-hatásokat a jelátviteli útvonalakon. Ezért úgy gondoljuk, hogy a bél-mikrobiota összetételét és az immunaktiválás markereit tartalmazó modellek előrejelzik az UPA-val kezelt RA-s betegek klinikai kimenetelét.

Fő és másodlagos célkitűzések: Prediktív modellek felépítése UPA-val kezelt RA-s betegek klinikai kimenetelére (hatékonyság és biztonság) mikrobiota elemzés és immunaktivációs markerek alapján.

Módszertan:

Ebben a multicentrikus longitudinális prospektív vizsgálatban 60 RA-ban szenvedő, metotrexátra nem reagáló beteget vonnak be. A vizsgált klinikai eredmények az EULAR-reakció hiánya 3 hónapon belül, az EULAR reuma elleni európai liga meghatározása szerint (elsődleges kimenetel), az alacsony betegségaktivitás elérése 6 hónap után vagy az incidens nemkívánatos események (másodlagos kimenetelek). A bél mikrobiotáját a kiinduláskor és az M3-at a felolvasztott székletmintákból értékelik. A DNS-t QIAamp DNS széklet minikészlettel (Qiagen) tisztítják, és Qubit és TapeStation 4200 (Agilent) segítségével minősítik. A könyvtárat a bakteriális 16S rRNS génekből származó V1-V2 és V3-V4 régiók amplifikálásával állítják elő, és q-PCR-rel minősítik, az amplikonokat pedig a MiSeq (Illumina) segítségével szekvenálják. A kezdeti bioinformatikai elemzés és taxonómia a QIIME2 szoftverrel történik. Az immunaktivációt a JAK-STAT útvonal aktiválásával értékeljük a JAK STAT jelátviteli útvonal RT² profiler PCR Array (Qiagen) segítségével, amely 84 gén expresszióját profilálja a Jak és Stat által közvetített jelátvitelhez kapcsolódóan. Az UPA-koncentrációkat folyadékkromatográfiás-tandem tömegspektrometriával (LC-MS/MS) kell értékelni az alapvonalon és 3 hónap múlva. A mikrobiomot, a JAK STAT jelátviteli útvonal génexpresszióját és a klinikai adatokat tartalmazó statisztikai osztályozókat (neurális hálózati algoritmus, lineáris és kvadratikus diszkriminancia analízis, támogató vektorgép, véletlenszerű erdők, zsugorodási módszerek vagy legközelebbi szomszédok) használjuk az UPA klinikai adataival kapcsolatos profilok meghatározására. reagálás és biztonság. Azokat a betegeket, akik idő előtt (3 hónap előtt) abbahagyják az UPA-t nemkívánatos események vagy a nyomon követés elvesztése miatt, nem reagálónak tekintik.