Microbiota-analyse om de resultaten te voorspellen van patiënten met reumatoïde artritis behandeld met JAK-remmer (MARAJA)

Gepersonaliseerde geneeskunde waarin elke patiënt de ideale gepersonaliseerde behandeling en regime zou krijgen, is een grote belofte om de zorg voor de patiënt te verbeteren. Eerdere studies konden echter geen gevalideerde voorspellers van respons op disease-modifying anti-reumatic drugs (DMARD's) bij patiënten met reumatoïde artritis (RA) vaststellen. JAK-remmers is een nieuwe klasse DMARD's met een grote werkzaamheid die misschien zelfs superieur is aan anti-TNF-geneesmiddelen. Aangezien er chemicaliën zijn, zijn hun productiekosten veel goedkoper dan die van biologische therapieën en zullen ze de komende jaren waarschijnlijk centraal staan ​​in de zorg voor patiënten. Er zijn er momenteel drie beschikbaar: upadacitinib (UPA) tofacitinib en baricitinib. Ons onderzoek zal zich richten op UPA. Klinische resultaten zijn voornamelijk afhankelijk van i) factoren die het metabolisme en de concentraties van geneesmiddelen beïnvloeden en ii) geschiktheid tussen het doelwit van het geneesmiddel en de ontstekingsroutes die betrokken zijn bij de ziekte van de patiënt. Mensen dragen biljoenen ziektekiemen in hun darmen, waarvan nu bekend is dat ze een sleutelrol spelen in gezondheid en ziekte. Die kiemen bezitten veel enzymen en moduleren de expressie van menselijke enzymen sterk. Darmmicrobiota kan inderdaad orale geneesmiddelen direct metaboliseren en de expressie regelen van cytochroom P450 3A4 (CYP3A4), het belangrijkste enzym dat TOFA metaboliseert. We hebben in een voorlopig muizenexperiment aangetoond dat het wijzigen van de samenstelling van de darmmicrobiota de JAKi-effecten op signaalroutes verandert. We zijn dus van mening dat modellen met inbegrip van de samenstelling van de darmmicrobiota samen met markers van immuunactivatie de klinische resultaten zullen voorspellen bij RA-patiënten die met UPA worden behandeld.

Hoofd- en secundaire doelstellingen: Het bouwen van voorspellende modellen voor klinische uitkomsten (werkzaamheid en veiligheid) van RA-patiënten behandeld met UPA op basis van microbiota-analyse en markers voor immuunactivatie.

Methodiek:

Deze multicentrische longitudinale prospectieve studie omvat 60 patiënten met RA die onvoldoende reageren op methotrexaat. De bestudeerde klinische resultaten zijn EULAR-non-respons na 3 maanden zoals gedefinieerd door de Europese competitie tegen reuma EULAR (primaire uitkomst), het bereiken van een ziektevrije activiteit na 6 maanden of incidentele bijwerkingen (secundaire uitkomsten). Darmmicrobiota zal worden beoordeeld bij baseline en M3 van ontdooide fecale monsters. DNA wordt gezuiverd met behulp van de QIAamp DNA-ontlastingsminikit (Qiagen) en wordt gekwalificeerd met Qubit en TapeStation 4200 (Agilent). Bibliotheek zal worden voorbereid door amplificatie van V1-V2- en V3-V4-regio's van de bacteriële 16S rRNA-genen en zal worden gekwalificeerd door q-PCR en amplicons zullen worden gesequenced door MiSeq (Illumina). Initiële bioinformatische analyse en taxonomieën zullen worden uitgevoerd met behulp van de QIIME2-software. Immuunactivering zal worden beoordeeld door middel van JAK-STAT-pathway-activering door JAK STAT-signaleringsroute RT²-profiler PCR Array (Qiagen) die de expressie van 84 genen die verband houden met Jak- en Stat-gemedieerde signalering, profileert. UPA-concentraties zullen worden beoordeeld door middel van vloeistofchromatografie-tandem massaspectrometrie (LC-MS/MS) bij baseline en na 3 maanden. Statistische classificatoren (neuraal netwerkalgoritme, lineaire en kwadratische discriminantanalyse, ondersteunende vectormachine, willekeurige bossen, krimpmethoden of dichtstbijzijnde buren) die microbioom, genexpressie van JAK STAT-signaalpaden en klinische gegevens bevatten, zullen worden gebruikt om profielen te bepalen die verband houden met UPA klinische respons en veiligheid. Patiënten die voortijdig stoppen met UPA (vóór 3 maanden) vanwege bijwerkingen of verlies van follow-up, worden beschouwd als non-responders.