Mikrobiota-Analyse zur Vorhersage der Ergebnisse von Patienten mit rheumatoider Arthritis, die mit JAK-Inhibitoren behandelt wurden (MARAJA)

Die personalisierte Medizin, bei der jeder Patient die ideale personalisierte Behandlung und Therapie erhält, ist vielversprechend, um die Patientenversorgung zu verbessern. Frühere Studien konnten jedoch keine validierten Prädiktoren für das Ansprechen auf krankheitsmodifizierende Antirheumatika (DMARDs) bei Patienten mit rheumatoider Arthritis (RA) etablieren. JAK-Inhibitoren sind eine neue Klasse von DMARDs mit großer Wirksamkeit, die Anti-TNF-Medikamenten sogar überlegen sein könnten. Da es Chemikalien gibt, sind ihre Produktionskosten viel billiger als bei biologischen Therapien, und sie werden in den kommenden Jahren wahrscheinlich im Mittelpunkt der Patientenversorgung stehen. Derzeit sind drei verfügbar: Upadacitinib (UPA), Tofacitinib und Baricitinib. Unsere Studie konzentriert sich auf UPA. Klinische Ergebnisse hängen hauptsächlich von i) Faktoren ab, die den Arzneimittelstoffwechsel und die Arzneimittelkonzentrationen beeinflussen, und ii) der Angemessenheit zwischen dem Arzneimittelziel und den an der Erkrankung des Patienten beteiligten Entzündungswegen. Menschen tragen in ihrem Darm Billionen von Keimen, von denen heute bekannt ist, dass sie Schlüsselakteure bei Gesundheit und Krankheit sind. Diese Keime besitzen viele Enzyme und modulieren stark die menschliche Enzymexpression. Die Darmmikrobiota kann in der Tat orale Arzneimittel direkt metabolisieren und die Expression des Cytochrom P450 3A4 (CYP3A4), des wichtigsten Enzyms, das TOFA metabolisiert, kontrollieren. Wir haben in einem vorläufigen Mausexperiment gezeigt, dass die Veränderung der Darm-Mikrobiota-Zusammensetzung JAKi-Effekte auf Signalwege verändert. Wir glauben daher, dass Modelle, die die Darm-Mikrobiota-Zusammensetzung zusammen mit Markern der Immunaktivierung umfassen, klinische Ergebnisse bei mit UPA behandelten RA-Patienten vorhersagen werden.

Haupt- und Nebenziele: Erstellung von Vorhersagemodellen für klinische Ergebnisse (Wirksamkeit und Sicherheit) von RA-Patienten, die mit UPA behandelt werden, basierend auf Mikrobiota-Analysen und Markern für die Immunaktivierung.

Methodik:

Diese multizentrische prospektive Längsschnittstudie wird 60 Patienten mit RA und unzureichendem Ansprechen auf Methotrexat umfassen. Die untersuchten klinischen Ergebnisse sind EULAR Non-Response nach 3 Monaten gemäß der Definition der European League Against Rheumatism EULAR (primäres Ergebnis), das Erreichen einer Aktivität mit geringer Krankheit nach 6 Monaten oder unerwünschte Ereignisse (sekundäre Ergebnisse). Die Darmmikrobiota wird zu Studienbeginn und M3 aus aufgetauten Stuhlproben bewertet. DNA wird mit dem QIAamp DNA Stool Mini Kit (Qiagen) gereinigt und mit Qubit und TapeStation 4200 (Agilent) qualifiziert. Die Bibliothek wird durch Amplifikation der V1-V2- und V3-V4-Regionen aus den bakteriellen 16S-rRNA-Genen hergestellt und durch q-PCR qualifiziert, und die Amplikons werden durch MiSeq (Illumina) sequenziert. Erste bioinformatische Analysen und Taxonomien werden mit der Software QIIME2 durchgeführt. Die Immunaktivierung wird durch die Aktivierung des JAK-STAT-Signalwegs durch das RT²-Profiler-PCR-Array des JAK-STAT-Signalwegs (Qiagen) bewertet, das die Expression von 84 Genen im Zusammenhang mit der Jak- und Stat-vermittelten Signalübertragung profiliert. UPA-Konzentrationen werden durch Flüssigchromatographie-Tandem-Massenspektrometrie (LC-MS/MS) zu Beginn und nach 3 Monaten bewertet. Statistische Klassifikatoren (neuronaler Netzwerkalgorithmus, lineare und quadratische Diskriminanzanalyse, Support Vector Machine, Random Forests, Shrinkage Methods oder Nearest Neighbors), die das Mikrobiom, die Genexpression des JAK STAT-Signalwegs und klinische Daten enthalten, werden verwendet, um Profile zu bestimmen, die mit der UPA-Klinik verbunden sind Reaktion und Sicherheit. Patienten, die UPA vorzeitig (vor 3 Monaten) wegen unerwünschter Ereignisse oder fehlender Nachbeobachtung beenden, werden als Non-Responder betrachtet.