プエルトリコにおける前立腺癌の診断、予後およびモニタリングのための Sentinel™ PCC4 アッセイの評価

Sentinel™ PCC4 アッセイは、442 の小さな非コード RNA のコホートの発現に基づいて、進行性疾患のリスクを評価する新しい分子分類技術です。

研究の開始時に、miR Scientific は、プエルトリコ (サン ファン バウティスタ病院) のすべての参加医師との電話会議をスケジュールして、研究の概要、テストの基礎、およびこの Sentinel™ PCC4 アッセイの違いを説明します。前立腺がんのリスク評価で一般的に使用される計算機 (CAPRA および/または D'Amico リスク計算機、および泌尿器腫瘍医が日常的に利用するその他のリスク評価方法論)。

臨床データ (CRF フォームを参照) と Sentinel™ の結果が、包含/除外基準を満たす最初の 50 人の患者ごとにまとめられた後、miR Scientific の CSO および/またはメディカル ディレクターが 1 回以上の電話会議の議長を務めます。 Sentinel™ PCC4 アッセイと CAPRA およびその他のリスク評価計算機の結果を比較し、テストの相対的な長所と短所について議論し、Sentinel™ アッセイの性能に関する質問に回答し、試験結果。 臨床データと Sentinel スコアは特定のバーコードに関連付けられていますが、これらのデータは完全に匿名化されており、特定の患者に関連付けることはできないことに注意してください。 これにより、PHI の機密性が保たれるだけでなく、Sentinel™ PCC4 スコアに関連する情報がこれらの患者の現在の標準治療に影響を与えないことも保証されます。

各セッションの最後に、参加医師は、トレーニングの質とテスト結果に関する情報を評価するために設計されたアンケートに記入します (付録 1 を参照)。 このプロセスは、最初の 200 人の患者に対して登録された 50 人の新しい患者ごとに繰り返され、350 人の患者のデータが利用可能になった後に再び繰り返されます。 500人の患者コホートの完全なデータセットの分析も、研究の完了時に提示され、最終的なアンケートが実施されます。

コア針生検が実施された前立腺癌の疑いのある男性の前立腺癌患者を特定するための miR Sentinel™ PCC4 アッセイの性能を検証するために、miR Sentinel™ PCC4 は低リスク、中リスク、高リスクの結果を示しました。前立腺がん（組織病理学的グレードグループ1、2、または3〜5）は、CAPRAスコアの結果と比較されます。 感度、特異度、陽性および陰性適中率 (PPV、NPV) が確立されます。

この臨床的有用性研究は、観察的検証研究です。 前立腺癌の疑いがあり、以下にリストされている包含​​/除外基準を満たす患者は、コア針生検の前の来院時に尿サンプルを提供するために登録されます。 各生検の結果を含む病理学的グレードグループシステムは、参加センターの病理学者によって、がんなし、CAPRA低リスク、中リスク、または高リスクのいずれかにグループ化されます。

miR Sentinel™ PCC4 アッセイの性能は、将来の患者の病状を前立腺癌または非前立腺癌のいずれかに分類し、前立腺癌患者を低リスク (名目上はグレード グループ 1)、中リスクの前立腺癌 (名目上グレードグループ 2) または高リスク前立腺癌 (名目上グレードグループ 3-5) が確立されます。 テストレポートは、登録された被験者に関連する臨床レポートも持っている相談泌尿器科医に提供されます。

針生検と Sentinel™ PCC4 Assay の間の不一致は、Wang らによって十分に文書化されています。 (2020)、下の表を参照してください。 研究の開始時に、泌尿器科医は Sentinel™ PCC4 アッセイの解釈について簡単な説明を受け、その後、Sentinel™ PCC4 と SOC (PSA +/- DRE および/または病理学レポート）、検証済みのアンケートを使用する（添付の機器の付録1を参照）。 プロジェクトに関係する泌尿器科医が Sentinel™ PCC4 プラットフォームを確実に理解できるようにするために、患者の 50% 以上 (> 25 人の患者) が確認コアを受けていることを考慮して、最初の 50 人の患者が発生した時点で比較結果のレビューが行われます。針生検、および追加の 50 人の患者ごとに (生検を受けた患者の割合に関係なく) 200 人の患者が発生し、350 人および 500 人の患者が発生した時点で、試験の登録が完了します。 Sentinel™ PCC4 アッセイに慣れていることがリスク評価に自信を与えるかどうかを判断するために、各レビューの後に調査機器が管理されます。

統計分析：

定義。 一般的な表記法 P (A | B) = P(A , B)/P(B) は、イベント B が発生した場合のイベント A の確率です。これは、イベント B を持つすべての人を含む集団の患者のサブグループにおけるイベント A の確率 (有病率) です。

1. 感度 = P (スクリーニング検査 + | 本当に病気)。
2. 特異性 = P (スクリーニング検査 - | 本当に病気がない)。
3. PPV = P (真の疾患 | スクリーニング検査 +)。
4. NPV = P (本当に病気がない | スクリーニング検査 -)。

サンプルサイズの推定。 提案された前向き研究は、コア針生検が注文された前立腺癌の疑いのある患者の代表的なサンプルに対するmiR Sentinel™ PCC4アッセイの性能を確立するのに役立ちます。 miR Sentinel™ PCC4 Assay は、上記のレトロスペクティブ データに基づいてトレーニングされています。

現在提案されている研究は、SOC の一環として臨床精密検査のために前立腺癌の疑いのために泌尿器科クリニックを訪れ、生検前の診療所訪問中に尿サンプルを提供した 500 人の被験者を登録することを目標としています。

登録参加者が 100 人以上のサブグループについて、そのサブグループの PCC4 アッセイの観察された (経験的) 感度が 95% である場合、真の集団感度の片側 95% 信頼区間の上限は 90% 以上になります。 .

この前向き研究は、合計500人の参加者のうち最初の参加者が登録されるか、少なくとも100人の参加者が4つのグループのそれぞれに登録されるまで、参加者を登録し続けます。グレードグループ1;グレードグループ2;グレード3以上。

統計的方法論。 以下に概説するように、この臨床研究では、前立腺がんの疑いに基づいて臨床検査のために泌尿器科クリニックを訪れる患者を登録します。 この研究では、独自の分類アルゴリズムの使用に基づく Sentinel™ PCC4 アッセイの特性を評価して、将来の前立腺がん患者を特定し、前立腺がん患者のリスクを分類します。

採用された独自の分類アルゴリズムは、前立腺がん患者の識別と、1-α で示される事前に指定されたレベル以上の高リスク前立腺がんの識別の両方の感度を制御します。たとえば、この計画で想定されている値は α=0.05 であるため、母集団の感度は少なくとも 95% です。 α の値は、アッセイの偽陰性率を表すことに注意してください。

Sentinel™ PCC4 アッセイのカットオフを計算して感度を制御する方法を説明すると、トレーニング データセットの各参加者について、トレーニング データセットの残りのメンバーと現在の参加者の sncRNA のみを使用して、Sentinel™ PCC4 アッセイの結果が計算されます。順序;つまり、トレーニング データセットの各参加者の実際の病気の状態は盲検化されるため、将来の患者の分類の設定が模倣されます。 次に、miR Sentinel™ PCC4 アッセイで使用される調整パラメーターが計算され、前立腺がんおよび高悪性度前立腺がんのトレーニング データセットの参加者に対する経験的感度が、上側の片側 95% 信頼区間を提供する値に対応します。少なくとも 1-α の将来の患者の対応する集団感度について。

Sentinel™ PCC4 アッセイのこれらのカットオフをトレーニング データセットからアプリオリに決定すると、対応する感度、特異度、陽性および陰性の予測値が、対応する上位 95% 信頼区間と共に、見込み患者について計算されます。この提案された研究で得られたデータは、各生検結果が盲検化されており、参加者の sncRNA シーケンスのみを使用しています。 これらのエラー率は、疾患状態が不明な将来の患者の分類を参照していることに注意してください。

グループラベルを生検から盲目にするために発生した前向きデータの統計分析は、前向きデータセットで生検によって誤って分類された患者の割合の推定値を提供します。 例えば、生検によって前立腺がんではないと分類され、盲検化された miR Sentinel™ PCC4 アッセイの結果が前立腺がんを示している患者は、針生検によって偽陰性である可能性がある患者 (生検標識陰性) である可能性があります。 この不一致およびその他の不一致の検証については、以下のフォローアップ データ分析セクションで説明します。 「前立腺生検の減少」対象コホートで得られた前向きデータの二次分析では、Sentinel™ PCC4 分類の低リスク、中リスク、および高リスクの前立腺癌の臨床的影響が、主な研究目的 #2 と泌尿器腫瘍医のフィードバック。

追跡データ分析。 標準的な臨床ケアの一環として、生検が陰性の参加者に対してフォローアップ生検が予定されている場合、フォローアップのセンチネルアッセイと生検の結果は、結果分析の臨床的真実と見なされます。