푸에르토리코에서 전립선암의 진단, 예후 및 모니터링을 위한 Sentinel™ PCC4 분석의 평가

Sentinel™ PCC4 Assay는 442개의 small non-coding RNA 코호트 발현을 기반으로 진행성 질병의 위험을 평가하는 새로운 분자 분류 기술입니다.

연구가 시작될 때 miR Scientific은 푸에르토리코(San Juan Bautista 병원)의 모든 참여 의사와 전화 회의를 예약하여 연구, 테스트의 기초를 설명하고 이 Sentinel™ PCC4 Assay 간의 차이점을 설명합니다. 및 전립선암에 대한 위험 평가에 일반적으로 사용되는 계산기(CAPRA 및/또는 D'Amico 위험 계산기 및 비뇨기과 의사가 일상적으로 사용하는 기타 위험 평가 방법론).

포함/제외 기준을 충족하는 최초 50명의 환자 각각에 대해 임상 데이터(CRF 양식 참조) 및 Sentinel™ 결과가 수집된 후 miR Scientific의 CSO 및/또는 의료 책임자는 참여 의사는 Sentinel™ PCC4 Assay와 CAPRA 및 기타 위험 평가 계산기의 결과를 비교하고, 테스트의 상대적 장단점을 논의하고, Sentinel™ Assay의 성능 및 불일치(있는 경우)에 관한 질문에 답변합니다. 시험 결과. 임상 데이터와 Sentinel Score는 특정 바코드와 연관되어 있지만 이러한 데이터는 완전히 익명화되어 특정 환자와 연관될 수 없다는 점에 유의해야 합니다. PHI 기밀성을 유지하는 것 외에도 Sentinel™ PCC4 점수와 관련된 정보가 이러한 환자에 대한 현재 치료 표준에 영향을 미치지 않도록 합니다.

각 세션이 끝날 때 참여 의사는 테스트 결과와 관련된 교육 및 정보의 품질을 평가하기 위해 고안된 설문지를 작성합니다(부록 1 참조). 이 프로세스는 처음 200명의 환자에 대해 등록된 50명의 신규 환자마다 반복되고 350명의 환자에 대한 데이터가 사용 가능해지면 다시 반복됩니다. 500명의 환자 코호트에 대한 전체 데이터 세트의 분석도 연구 완료 시 제공되며 최종 설문지가 작성됩니다.

코어 바늘 생검을 수행한 전립선암이 의심되는 남성에서 전립선암 환자를 식별하기 위한 miR Sentinel™ PCC4 분석의 성능을 검증하기 위해 miR Sentinel™ PCC4 결과는 저위험, 중간 위험 및 고위험 전립선암(조직병리학적 등급 그룹 1, 2 또는 3-5)은 CAPRA 점수의 결과와 비교됩니다. 민감도, 특이도, 양성 및 음성 예측값(PPV, NPV)이 설정됩니다.

이 임상적 유용성 연구는 관찰 및 검증 연구입니다. 전립선암이 의심되고 아래 나열된 포함/제외 기준을 충족하는 환자는 코어-바늘 생검 전에 사무실 방문 중에 소변 샘플을 제공하기 위해 등록됩니다. 각 생검 결과를 포함하는 병리학적 등급 그룹 시스템은 참여 센터의 병리학자에 의해 암 없음, CAPRA 저위험, 중간 위험 또는 고위험으로 그룹화됩니다.

miR Sentinel™ PCC4 Assay의 성능은 미래 환자의 질병 상태를 전립선암 또는 전립선암 없음으로 분류하고 전립선암 환자를 저위험(명목상 등급 그룹 1), 중간 위험 전립선암으로 분류합니다. 명목상 그룹 2) 또는 고위험 전립선암(명목상 그룹 3-5)이 설정됩니다. 테스트 보고서는 등록된 피험자와 관련된 임상 보고서를 가지고 있는 컨설팅 비뇨기과 전문의에게 제공됩니다.

코어 바늘 생검과 Sentinel™ PCC4 분석 사이의 불일치는 Wang et al. (2020), 아래 표 참조. 연구 시작 시 비뇨기과 전문의는 Sentinel™ PCC4 분석의 해석에 대해 브리핑을 받고 이후 Sentinel™ PCC4와 SOC(PSA +/- DRE 및/또는 병리학 보고서), 검증된 설문지를 사용합니다(첨부된 기기 부록 1 참조). 프로젝트와 관련된 비뇨기과 전문의가 Sentinel™ PCC4 플랫폼을 이해할 수 있도록 환자의 50% 이상(> 25명)이 확증 코어 시술을 받았다는 점을 감안하여 처음 50명의 환자가 누적되었을 때 비교 결과 검토가 진행됩니다. 바늘 생검, 그리고 200명의 환자가 누적될 때까지, 그리고 350명 및 500명의 환자가 누적될 때까지 추가 50명의 환자마다(생검 환자의 비율에 관계없이) 다시 한 번 시험 등록을 완료합니다. 조사 도구는 Sentinel™ PCC4 Assay에 대한 친숙함이 위험 평가에 자신감을 불어넣는지 여부를 결정하기 위해 각 검토 후 관리됩니다.

통계 분석:

정의. 일반 표기법 P (A | B) = P(A , B)/P(B)는 이벤트 B가 발생한 경우 이벤트 A의 확률입니다. 이벤트 B가 있는 모든 사람을 포함하는 모집단의 환자 하위 그룹 중에서 이벤트 A의 확률(유병률)입니다.

1. 민감도 = P(선별 검사 + | 진정한 질병).
2. 특이성 = P(선별 테스트 - | 진정으로 질병 없음).
3. PPV = P(진정한 질병 | 스크리닝 테스트 +).
4. NPV = P(진정한 질병 없음 | 스크리닝 테스트 -).

샘플 크기 추정. 제안된 전향적 연구는 코어 바늘 생검이 지시된 전립선암이 의심되는 환자의 대표 샘플에 대한 miR Sentinel™ PCC4 분석의 성능을 확립하는 데 도움이 될 것입니다. miR Sentinel™ PCC4 Assay는 위에서 설명한 소급 데이터에 대해 교육을 받았습니다.

현재 제안된 연구는 SOC의 일환으로 임상 검사를 위해 전립선암 의심으로 비뇨기과 클리닉을 방문하고 생검 전에 사무실 방문 중에 소변 샘플을 제공한 500명의 피험자를 등록하는 것을 목표로 합니다.

최소 100명의 등록 참가자가 있는 하위 그룹의 경우 해당 하위 그룹에 대한 PCC4 분석의 관찰된(경험적) 민감도가 95%인 경우 실제 모집단 민감도에 대한 단측 상위 95% 신뢰 구간은 90% 이상이 됩니다. .

이 전향적 연구는 총 500명의 참가자 중 첫 번째가 등록되거나 최소 100명의 참가자가 네 그룹 각각에 등록될 때까지 참가자를 계속 등록할 것입니다. NEPC; 등급 그룹 1; 등급 그룹 2; 등급 그룹 3 이상.

통계적 방법론. 아래에 요약된 바와 같이, 이 임상 연구는 전립선암이 의심되는 임상 정밀 검사를 위해 비뇨기과 클리닉을 방문하는 환자를 등록할 것입니다. 이 연구는 장래의 전립선암 환자를 식별하고 전립선암 환자의 위험을 분류하기 위해 독점 분류 알고리즘의 사용을 기반으로 하는 Sentinel™ PCC4 분석의 특성을 평가할 것입니다.

독점적인 분류 알고리즘은 전립선암 환자를 식별하고 1-α로 표시되는 미리 지정된 수준 이상에서 고위험 전립선암을 식별하기 위해 감도를 제어합니다. 예를 들어, 이 설계에서 가정된 값은 α=0.05이므로 민감도는 모집단에서 95% 이상입니다. α 값은 분석의 위음성률을 나타냅니다.

감도를 제어하기 위해 Sentinel™ PCC4 Assay의 컷오프를 계산하는 방법을 설명하기 위해 훈련 데이터 세트의 각 참가자에 대해 Sentinel™ PCC4 Assay 결과는 훈련 데이터 세트의 나머지 구성원과 현재 참가자의 sncRNA만 사용하여 계산됩니다. 순서; 즉, 교육 데이터 세트의 각 참가자의 실제 질병 상태는 눈이 멀게 되어 미래 환자의 분류 설정을 모방합니다. 그런 다음 miR Sentinel™ PCC4 분석에 사용된 조정 매개변수를 계산하여 전립선암 및 고급 전립선암이 있는 교육 데이터 세트의 참가자에 대한 경험적 민감도가 상위 단측 95% 신뢰 구간을 제공하는 값과 일치하도록 합니다. 적어도 1-α의 미래 환자에 대한 해당 인구 민감도에 대해.

훈련 데이터 세트에서 선험적으로 결정된 Sentinel™ PCC4 분석에 대한 이러한 컷오프를 사용하여 예상 환자에 대한 해당 상위 95% 신뢰 구간과 함께 민감도, 특이성, 양성 및 음성 예측 값의 해당 값이 계산됩니다. 참가자의 sncRNA 서열만 사용하는 각 생검 결과가 눈가림된 이 제안된 연구에서 축적된 데이터. 이러한 오류율은 질병 상태를 알 수 없는 미래 환자의 분류를 나타냅니다.

생검에서 그룹 레이블을 가리는 누적된 예상 데이터의 통계 분석은 예상 데이터 세트에서 생검에 의해 잘못 표시된 환자 비율의 추정치를 제공할 것입니다. 예를 들어, 생검에 의해 전립선암이 없는 것으로 라벨링되고 맹검된 miR Sentinel™ PCC4 분석 결과가 전립선암을 나타내는 환자는 코어-니들 생검에 의해 잠재적으로 위음성(생검 라벨 음성)인 환자일 수 있습니다. 이 불일치 및 기타의 검증은 후속 데이터 분석 섹션에서 아래에 설명되어 있습니다. "전립선 생검 쇠퇴" 피험자 코호트에서 축적된 예상 데이터의 2차 분석을 위해 저위험, 중간 위험 및 고위험 전립선암의 Sentinel™ PCC4 분류의 임상적 영향은 1차 연구 목표 #2 및 비뇨기과 의사 피드백.

후속 데이터 분석. 표준 임상 치료의 일부로 음성 생검을 가진 참가자에 대한 후속 생검이 예정되어 있는 경우 후속 Sentinel Assay 및 생검 결과는 결과 분석에 대한 임상적 사실로 간주됩니다.