A Sentinel™ PCC4 teszt értékelése a prosztatarák diagnosztizálására, prognózisára és monitorozására Puerto Ricóban

A Sentinel™ PCC4 Assay egy új molekuláris osztályozási technológia, amely 442 kisméretű, nem kódoló RNS-ből álló kohorsz expressziója alapján becslést ad az előrehaladott betegség kockázatáról.

A vizsgálat kezdetén a miR Scientific telekonferencia-hívást ütemez az összes résztvevő Puerto Rico-i (San Juan Bautista Kórház) orvossal, hogy felvázolja a vizsgálatot, a teszt alapját, és elmagyarázza a Sentinel™ PCC4 Assay közötti különbségeket. és a prosztatarák kockázatértékelésénél általánosan használt számológépek (a CAPRA és/vagy a D'Amico kockázatkalkulátorok és bármely más kockázatértékelési módszer, amelyet az uro-onkológusok rutinszerűen alkalmaznak).

Miután a klinikai adatok (lásd a CRF űrlapot) és a Sentinel™ eredmény összeállításra kerültek az első 50 beteg közül, akik megfelelnek a felvételi/kizárási kritériumoknak, a CSO és/vagy a miR Scientific egészségügyi igazgatója egy vagy több telekonferencia-hívást vezet le a a résztvevő orvosok, hogy összehasonlítsák a Sentinel™ PCC4 Assay és a CAPRA és más kockázatértékelési kalkulátorok eredményeit, megvitassák a tesztek relatív erősségeit és gyengeségeit, és válaszoljanak a Sentinel™ Assay teljesítményével kapcsolatos kérdésekre, valamint a tesztek közötti eltérésekre (ha vannak). vizsgálati eredmények. Fontos megjegyezni, hogy bár a klinikai adatok és a Sentinel Score meghatározott vonalkódokhoz kapcsolódnak, ezek az adatok teljesen anonimizáltak, és nem társíthatók meghatározott betegekhez. Amellett, hogy megőrzi a PHI titkosságát, ez azt is biztosítja, hogy a Sentinel™ PCC4 Score-ra vonatkozó információk ne befolyásolják ezen betegek ellátásának jelenlegi színvonalát.

Minden ülés végén a résztvevő orvosok kitöltenek egy kérdőívet, amelynek célja a képzés minőségének és a vizsgálati eredménnyel kapcsolatos információk értékelése (lásd 1. melléklet). Ezt a folyamatot minden 50 új betegnél meg kell ismételni az első 200 beteg esetében, majd újra, miután a 350 betegre vonatkozó adatok elérhetővé válnak. A vizsgálat befejezésekor bemutatásra kerül az 500 betegből álló kohorsz teljes adatsorának elemzése, valamint egy végső kérdőív is.

A miR Sentinel™ PCC4 Assay teljesítményének validálása érdekében prosztatarák gyanús férfiaknál prosztatarákos betegek azonosítására, akiknél magtű-biopsziát végeznek, a miR Sentinel™ PCC4 alacsony, közepes és magas kockázatú. prosztatarák (kórszövettani 1., 2. vagy 3-5. fokozatú csoport) esetén a CAPRA-pontszám eredményeivel kell összehasonlítani. Az érzékenység, specificitás, pozitív és negatív prediktív értékek (PPV, NPV) kerülnek megállapításra.

Ez a klinikai hasznossági vizsgálat megfigyeléses, validációs vizsgálat. Azokat a betegeket, akiknél prosztatarák gyanúja merül fel, és megfelel az alább felsorolt ​​beválasztási/kizárási kritériumoknak, vizeletmintát vesznek fel az irodai látogatásuk során a magtű-biopszia előtt. A Pathological Grade Group rendszert, beleértve az egyes biopsziák eredményeit is, a résztvevő központok patológusai csoportosítják a rák nélküli, alacsony, közepes vagy magas kockázatú CAPRA-t.

A miR Sentinel™ PCC4 Assay teljesítménye a jövőbeli betegek betegségi állapotának besorolására, hogy vagy prosztatarák, vagy nem prosztatarák, és prosztatarákos betegek esetében alacsony kockázatú (névlegesen 1. fokozatú), közepes kockázatú prosztatarák ( névlegesen Grade Group 2) vagy magas kockázatú prosztatarák (névlegesen Grade Group 3-5) kerül megállapításra. A vizsgálati jelentéseket átadják a konzultáló urológusoknak, akik a beiratkozott alanyokkal kapcsolatos klinikai jelentéssel is rendelkeznek.

A tűmag-biopsziák és a Sentinel™ PCC4 Assay közötti eltéréseket jól dokumentálják Wang és mtsai. (2020), lásd az alábbi táblázatot. A vizsgálat elején az urológusokat tájékoztatják a Sentinel™ PCC4 Assay értelmezéséről, majd felkérik őket, hogy hasonlítsák össze és állítsák össze a Sentinel™ PCC4 és az SOC (PSA +/- DRE és/vagy) által szolgáltatott információkat. patológiai jelentés), validált kérdőív segítségével (lásd a mellékelt 1. műszermellékletet). Annak biztosítása érdekében, hogy a projekthez kapcsolódó urológusok megértsék a Sentinel™ PCC4 platformot, az összehasonlító eredmények áttekintésére kerül sor, amikor az első 50 beteg összegyűlt, mivel a betegek több mint 50%-a (> 25 beteg) átesett a megerősítő magon. tűbiopszia, és ismét minden további 50 betegre (függetlenül a biopsziás betegek százalékos arányától), amíg 200 beteg nem halmozódik fel, és amikor 350 és 500 beteg gyűlik össze, akkor a vizsgálat befejeződik a beiratkozása. A felmérési műszert minden egyes áttekintés után beadják annak megállapítására, hogy a Sentinel™ PCC4 Assay ismerete növeli-e a kockázatértékelésbe vetett bizalmat.

Statisztikai analízis:

Definíciók. A P (A | B) = P(A , B)/P(B) általános jelölés az A esemény valószínűsége, feltéve, hogy a B esemény bekövetkezett; ez az A esemény valószínűsége (prevalenciája) a betegek alcsoportjában egy olyan populációban, amely magában foglalja mindazokat, akiknek B eseménye van.

1. Érzékenység = P (szűrővizsgálat + | valóban betegség).
2. Specificitás = P (szűrővizsgálat - | valóban nincs betegség).
3. PPV = P (valóban betegség | szűrővizsgálat +).
4. NPV = P (tényleg nincs betegség | szűrővizsgálat -).

A minta méretének becslése. A javasolt prospektív vizsgálat célja a miR Sentinel™ PCC4 Assay teljesítményének megállapítása a prosztatarák bármilyen gyanújával rendelkező betegek reprezentatív mintáján, akiknél magtű biopsziát rendelnek el. A miR Sentinel™ PCC4 Assay a fent leírtak szerint retrospektív adatokon alapul.

A jelenlegi javasolt vizsgálat célja 500 olyan alany bevonása, akik prosztatarák gyanúja miatt kerestek fel urológiai klinikákat klinikai vizsgálat céljából az SOC részeként, és akik vizeletmintát adtak a biopszia előtti irodai látogatás során.

Bármely alcsoportnál, ahol legalább 100 résztvevő vesz részt, ha a PCC4 Assay megfigyelt (empirikus) érzékenysége az adott alcsoportra vonatkozóan 95%, akkor a valódi populációs érzékenység egyoldalú felső 95%-os konfidencia intervalluma 90% vagy nagyobb lesz. .

Ez a prospektív vizsgálat addig folytatja a résztvevők felvételét, amíg az 500 résztvevő közül az elsőt be nem írják, vagy a négy csoport mindegyikébe legalább 100 résztvevőt be nem vonnak: NEPC; évfolyam 1. csoport; évfolyam 2. csoport; osztályos csoport 3 és magasabb.

Statisztikai módszertan. Az alábbiakban ismertetettek szerint ebbe a klinikai vizsgálatba olyan betegeket vonnak be, akik urológiai klinikákra látogatnak klinikai vizsgálatra a prosztatarák gyanúja alapján. A tanulmány értékelni fogja a Sentinel™ PCC4 Assay tulajdonságait, amely egy szabadalmaztatott osztályozási algoritmuson alapul a jövőbeni prosztatarákos betegek azonosítására és a prosztatarákos betegek kockázatának osztályozására.

Az alkalmazott szabadalmaztatott osztályozási algoritmus szabályozza az érzékenységet mind a prosztatarákban szenvedő betegek azonosítására, mind a magas kockázatú prosztatarák azonosítására egy előre meghatározott szinten vagy azt meghaladóan, amelyet 1-α-val jelölünk; például az ebben a tervezésben feltételezett érték α=0,05, így az érzékenység legalább 95%-os a populációban. Ne feledje, hogy az α értéke a vizsgálat álnegatív arányát jelenti.

Annak leírására, hogy a Sentinel™ PCC4 Assay küszöbértékeit hogyan számítják ki az érzékenység szabályozására, a képzési adatkészlet minden résztvevője esetében a Sentinel™ PCC4 Assay eredményét a képzési adatkészlet többi tagjának és csak az aktuális résztvevő sncRNS-ének felhasználásával számítják ki. sorrend; vagyis a képzési adathalmaz minden résztvevőjének valódi betegségi állapota vak lesz, ezáltal utánozva a jövőbeli páciensek besorolásának beállítását. A miR Sentinel™ PCC4 Assay-ben használt hangolási paramétereket ezután úgy számítják ki, hogy a képzési adatkészletben résztvevők empirikus érzékenysége prosztatarákos és magas fokú prosztatarákos betegeknél megfeleljen annak az értéknek, amely egy felső egyoldalú 95%-os konfidencia intervallumot biztosít. a megfelelő populációs érzékenységre egy jövőbeli beteg esetében legalább 1-α.

Ezekkel a Sentinel™ PCC4 Assay küszöbértékeivel, amelyeket eleve meghatároztak a betanítási adatkészletből, a megfelelő szenzitivitás, specificitás, pozitív és negatív prediktív értékek, valamint a megfelelő felső 95%-os konfidencia intervallumok kiszámításra kerülnek a leendő páciensen. ebben a javasolt vizsgálatban felhalmozott adatok, minden egyes biopsziás eredmény vakítása mellett, ami csak a résztvevő sncRNS-szekvenciáját használja. Vegye figyelembe, hogy ezek a hibaarányok egy ismeretlen betegségstátuszú jövőbeli páciens besorolására vonatkoznak.

A felhalmozott prospektív adatok statisztikai elemzése, amely elvakítja a biopsziából származó csoportcímkét, becslést ad azoknak a betegeknek az arányáról, akiket a biopszia rosszul jelölt meg a leendő adatkészletben. Például azok a betegek, akiknek biopsziával nem prosztatarákja van, és akiknek a miR Sentinel™ PCC4 vizsgálat elvakult eredménye prosztatarákra utal, lehet, hogy a magtű biopszia alapján tévesen negatív (biopsziás címke negatív). Ennek az eltérésnek és másoknak az érvényesítésével az alábbiakban a nyomon követési adatelemzés részben foglalkozunk. A "prosztata biopszia hanyatlása" vizsgálati alany kohorszában felhalmozott prospektív adatok másodlagos elemzéséhez a Sentinel™ PCC4 alacsony kockázatú, közepes kockázatú és magas kockázatú prosztatarák osztályozásának klinikai hatását értékelni kell az általa megállapított teljesítményadatok alapján. 2. elsődleges vizsgálati célkitűzés és uro-onkológus visszajelzés.

Nyomon követési adatelemzés. Ha a negatív biopsziával rendelkező résztvevők számára a szokásos klinikai ellátás részeként nyomon követési biopsziát terveznek, akkor az őrszemvizsgálat és a biopszia eredményei az eredményelemzés klinikai igazságának minősülnek.