免疫チェックポイント遮断に対する肺毒性のバイオマーカーを特定するための単一細胞アプローチ
この前向き非介入探索的モノセントリック研究の主な目的は、がん治療誘発性肺炎を経験しているがん患者からの気管支肺胞洗浄液 (BAL) の免疫細胞組成を単一細胞スケールで特徴付けることです。 これらのメカニズムの洞察は、推定される診断バイオマーカーと治療標的に直接つながる可能性があります。
臨床的に関連性の高い 2 つ目の仮説は、血液サンプルの単一細胞プロファイリングにより、ICB 毒性の循環バイオマーカーが明らかになり、非侵襲的診断が可能になるというものです。
調査の概要
詳細な説明
調査員は、サンプルごとに最大 5,000 個の単一細胞に単一細胞 RNA および TCR シーケンシングを適用します。 さらに、細胞表面タンパク質の発現を転写情報と統合することができます。 Seurat を含むさまざまなバイオインフォマティクス パイプラインを使用して、さまざまな細胞クラスターを特定し、マーカー遺伝子発現によって、既知の細胞タイプ、細胞サブタイプ、または表現型に割り当てます。 たとえば、これにより、PD-1/PD-L1 発現 T 細胞、細胞傷害性 T 細胞、免疫抑制性骨髄細胞などの存在量をモニタリングすることが可能になります。 とりわけ、単一細胞レベルでの次のパラメーターが関連します。
- 確立された免疫細胞タイプの組成と相対的存在量 (例: T 細胞 (CD4+、CD8+ および調節サブセット)、NK 細胞、B 細胞、MDSC、マクロファージ、好中球、樹状細胞)。 これらの免疫細胞サブタイプのそれぞれのトランスクリプトーム データが分析され、特定の表現型の状態を定義する特定の遺伝子発現プログラムの特徴付けが可能になります。
- 単一細胞トランスクリプトミクスによって同定されたすべての間質細胞サブタイプの構成。
- 各細胞タイプおよび細胞サブタイプ（または細胞状態）の遺伝子調節ネットワークが確立され、マスター転写調節因子が特定されます。 個々の T 細胞と T 細胞サブクラスターは、インターフェロンの活性化、高い増殖率と転写率、およびグランザイムの発現増加に基づいて分類されます。これらはすべて、T 細胞の活性化を示しています。
血液サンプルは、同様の単一細胞実験手順にかけられます。 まず、末梢血単核細胞 (PBMC) は、Ficoll 密度勾配遠心法を使用して分離されます。 CITE-seq と組み合わせた単一細胞トランスクリプトーム解析は、5000 PBMC で実行されます。 細胞組成は、BAL 流体細胞の処理に使用されるのと同じバイオインフォマティクス パイプラインを使用して決定されます。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前：Els Wauters, MD, PhD
- 電話番号：+3216340942
- メール：els.wauters@uzleuven.be
研究場所
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Flemish Brabant
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Leuven、Flemish Brabant、ベルギー、3000
- 募集
- Universitaire Ziekenhuizen Leuven
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コンタクト：
- Els Wauters, MD, PhD
- 電話番号：016340942
- メール：els.wauters@uzleuven.be
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 大人 M/F/X (>= 18 歳)
- ガイドラインに従って治療を受けている、または受けていた患者
- -BALを使用した気管支鏡検査を受けている患者、癌治療誘発性肺炎の可能性
- 他の臨床試験には含まれていません
- 署名済みのインフォームド コンセント フォーム
除外基準:
• この研究でさらに処理するのに適していない収集資料 (例: 品質の悪い）。 この決定は、単一細胞分析を専門とするラボ技術者および/またはバイオインフォマティシャンと相談して行われます。
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：コホート
- 時間の展望：見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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ICI肺炎
ICI肺炎を経験しているがん患者
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ICI、標準治療として投与
他の名前：
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放射線治療誘発性肺炎
RT肺炎を経験しているがん患者
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RT、標準治療として投与
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TKI誘発性肺炎
TKI誘発性肺炎を経験しているがん患者
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標準治療として投与されるTKI
他の名前：
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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ICI-/RT-/TKI 誘発性肺炎 BAL 液に存在する、scRNA-seq によって決定される免疫細胞の割合
時間枠：組み入れ日から試験完了まで、平均2年
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ICI-/RT-/TKI 誘発性肺炎の BAL 液に存在する免疫細胞サブタイプのパーセンテージを特定し、統計的に比較することにより、i) どの免疫プロセスがこれらの有害事象を引き起こしているかを理解することを目指しています ii) 推定分子バイオマーカーを特定します iii) 推定治療法を特定しますターゲット
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組み入れ日から試験完了まで、平均2年
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ScRNA-seqによって決定されるように、ICI-/RT-/TKI誘発性肺炎を識別するBAL液中の差次的に発現する遺伝子
時間枠：組み入れ日から試験完了まで、平均2年
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ICI、RT、および TKI 誘発性肺炎の BAL 液で示差的に発現する遺伝子を特定することにより、i) どの免疫プロセスがこれらの有害事象を引き起こしているかを理解すること、ii) 推定分子バイオマーカーを特定すること、iii) 推定治療標的を特定することを目指しています。
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組み入れ日から試験完了まで、平均2年
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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ICI-/RT-/TKI 誘発性肺炎末梢血単核細胞に存在する、scRNA-seq によって決定される免疫細胞の割合
時間枠：組み入れ日から試験完了まで、平均2年
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ICI/RT/TKI誘発性肺炎末梢血単核細胞に存在する免疫細胞サブタイプのパーセンテージを特定し、統計学的に比較することにより、i) どの免疫プロセスがこれらの有害事象を引き起こしているかを理解することを目指しています ii) 推定分子バイオマーカーを特定します iii) 特定します推定治療標的
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組み入れ日から試験完了まで、平均2年
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ICI-/RT-/TKI 誘発性肺炎を識別する、scRNA-seq によって決定されるように、PBMC で示差的に発現する遺伝子
時間枠：組み入れ日から試験完了まで、平均2年
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ICI、RT、TKI 誘発性肺炎 PBMC で発現差のある遺伝子を特定することにより、i) どの免疫プロセスがこれらの有害事象を促進するかを理解すること、ii) 推定分子バイオマーカーを特定すること、iii) 推定治療標的を特定することを目指しています。
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組み入れ日から試験完了まで、平均2年
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協力者と研究者
協力者
捜査官
- 主任研究者：Els Wauters, MD, PhD、University Hospitals - KU Leuven
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
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