Une approche unicellulaire pour identifier les biomarqueurs de la toxicité pulmonaire pour le blocage des points de contrôle immunitaire
L'objectif principal de cette étude monocentrique exploratoire prospective non interventionnelle est de caractériser la composition des cellules immunitaires du liquide de lavage bronchoalvéolaire (BAL) de patients cancéreux souffrant de pneumopathie induite par le traitement du cancer à l'échelle d'une seule cellule. Ces connaissances mécanistes peuvent directement conduire à des biomarqueurs diagnostiques putatifs et à des cibles thérapeutiques.
Une deuxième hypothèse hautement pertinente sur le plan clinique est que le profilage unicellulaire d'échantillons de sang révélera des biomarqueurs circulants de la toxicité de l'ICB, rendant possible un diagnostic non invasif.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Les chercheurs appliqueront le séquençage de l'ARN et du TCR unicellulaire sur jusqu'à 5 000 cellules uniques par échantillon. De plus, l'expression des protéines de surface cellulaire peut être intégrée aux informations transcriptionnelles. Divers pipelines bioinformatiques, dont Seurat, seront utilisés pour identifier différents amas cellulaires qui, grâce à l'expression de gènes marqueurs, seront attribués à des types cellulaires, des sous-types cellulaires ou des phénotypes connus. Par exemple, cela permettra de surveiller l'abondance des lymphocytes T exprimant PD-1/PD-L1, des lymphocytes T cytotoxiques, des cellules myéloïdes immunosuppressives, etc. Les paramètres suivants au niveau de la cellule unique seront pertinents, entre autres :
- La composition et l'abondance relative des types de cellules immunitaires établis (par ex. Cellules T (CD4+, CD8+ et sous-ensembles régulateurs), cellules NK, cellules B, MDSC, macrophages, neutrophiles, cellules dendritiques). Les données transcriptomiques pour chacun de ces sous-types de cellules immunitaires seront analysées, permettant la caractérisation de programmes d'expression génique spécifiques qui définissent des états phénotypiques spécifiques.
- Composition de tous les sous-types cellulaires stromaux identifiés par transcriptomique unicellulaire.
- Un réseau de régulation génique pour chaque type cellulaire et sous-type cellulaire (ou état cellulaire) sera établi et des régulateurs maîtres de la transcription seront identifiés. Les lymphocytes T individuels et les sous-groupes de lymphocytes T seront classés en fonction de l'activation de l'interféron, des taux élevés de prolifération et de transcription et de l'expression accrue de granzyme, qui sont tous indicatifs de l'activation des lymphocytes T.
Des échantillons de sang seront soumis à des procédures expérimentales similaires sur cellule unique. Tout d'abord, les cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC) sont isolées à l'aide d'une centrifugation en gradient de densité Ficoll. L'analyse du transcriptome unicellulaire en combinaison avec CITE-seq sera effectuée sur 5000 PBMC. La composition cellulaire sera déterminée à l'aide des mêmes pipelines bioinformatiques que ceux utilisés pour le traitement des cellules fluides BAL.
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Els Wauters, MD, PhD
- Numéro de téléphone: +3216340942
- E-mail: els.wauters@uzleuven.be
Lieux d'étude
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Flemish Brabant
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Leuven, Flemish Brabant, Belgique, 3000
- Recrutement
- Universitaire Ziekenhuizen Leuven
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Contact:
- Els Wauters, MD, PhD
- Numéro de téléphone: 016340942
- E-mail: els.wauters@uzleuven.be
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Adulte H/F/X (>= 18 ans)
- Patients recevant ou ayant reçu un traitement selon les directives
- Patients subissant une bronchoscopie avec BAL, pour une éventuelle pneumonite induite par le traitement du cancer
- Non inclus dans d'autres essais cliniques
- Formulaire de consentement éclairé signé
Critère d'exclusion:
• Le matériel collecté ne convient pas à un traitement ultérieur dans cette étude (par ex. mauvaise qualité). Cette décision sera prise en consultation avec un technicien de laboratoire et/ou un bio-informaticien, spécialisé dans l'analyse unicellulaire.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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ICI-pneumonie
Patients cancéreux souffrant de pneumopathie ICI
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ICI, administré comme traitement de référence
Autres noms:
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Pneumopathie induite par la radiothérapie
Patients cancéreux souffrant de pneumonie à RT
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RT, administrée comme traitement de référence
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Pneumopathie induite par TKI
Patients cancéreux souffrant de pneumonie induite par TKI
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ITK, administré comme traitement de référence
Autres noms:
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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Proportions de cellules immunitaires, telles que déterminées par scRNA-seq, présentes dans le liquide BAL de pneumonie induite par ICI-/RT-/TKI
Délai: De la date d'inclusion jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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En identifiant et en comparant statistiquement les pourcentages de sous-types de cellules immunitaires présents dans le liquide BAL de la pneumonie induite par ICI-/RT-/TKI, nous visons à i) comprendre quels processus immunitaires entraînent ces événements indésirables ii) identifier les biomarqueurs moléculaires putatifs iii) identifier les thérapeutiques putatives cibles
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De la date d'inclusion jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Gènes différentiellement exprimés dans le liquide BAL, tels que déterminés par scRNA-seq, discriminant la pneumonite induite par ICI-/RT-/TKI
Délai: De la date d'inclusion jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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En identifiant les gènes exprimés de manière différentielle dans le liquide BAL de pneumonie induite par ICI vs RT vs TKI, nous visons à i) comprendre quels processus immunitaires entraînent ces événements indésirables ii) identifier des biomarqueurs moléculaires putatifs iii) identifier des cibles thérapeutiques putatives
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De la date d'inclusion jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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Proportions de cellules immunitaires, telles que déterminées par scRNA-seq, présentes dans les cellules mononucléaires du sang périphérique induites par ICI-/RT-/TKI
Délai: De la date d'inclusion jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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En identifiant et en comparant statistiquement les pourcentages de sous-types de cellules immunitaires présents dans les cellules mononucléaires du sang périphérique de la pneumopathie induite par ICI-/RT-/TKI, nous visons à i) comprendre quels processus immunitaires entraînent ces événements indésirables ii) identifier les biomarqueurs moléculaires putatifs iii) identifier cibles thérapeutiques putatives
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De la date d'inclusion jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Gènes différentiellement exprimés dans les PBMC, tels que déterminés par scRNA-seq, discriminant la pneumonite induite par ICI-/RT-/TKI
Délai: De la date d'inclusion jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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En identifiant les gènes exprimés de manière différentielle dans les PBMC de pneumonie induite par ICI- vs RT- vs TKI, nous visons à i) comprendre quels processus immunitaires sont à l'origine de ces événements indésirables ii) identifier des biomarqueurs moléculaires putatifs iii) identifier des cibles thérapeutiques putatives
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De la date d'inclusion jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Els Wauters, MD, PhD, University Hospitals - KU Leuven
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Infections
- Infections des voies respiratoires
- Maladies des voies respiratoires
- Maladies pulmonaires
- Pneumonie
- Maladies pulmonaires interstitielles
- Mécanismes moléculaires de l'action pharmacologique
- Agents antinéoplasiques
- Agents antinéoplasiques immunologiques
- Durvalumab
- Pembrolizumab
- Inhibiteurs de point de contrôle immunitaire
Autres numéros d'identification d'étude
- S63357
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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