면역 체크포인트 차단에 대한 폐 독성의 바이오마커를 식별하기 위한 단일 세포 접근법
이 전향적 비간섭 탐색적 단일 중심 연구의 주요 목표는 단일 세포 규모에서 암 치료로 유발된 폐렴을 경험하는 암 환자의 기관지 폐포 세척액(BAL)의 면역 세포 구성을 특성화하는 것입니다. 이러한 기계적 통찰력은 추정 진단 바이오마커 및 치료 표적으로 직접 이어질 수 있습니다.
임상적으로 매우 관련성이 높은 두 번째 가설은 혈액 샘플의 단일 세포 프로파일링이 ICB 독성의 순환 바이오마커를 밝혀 비침습적 진단을 실현할 수 있다는 것입니다.
연구 개요
상세 설명
연구자들은 샘플당 최대 5,000개의 단일 세포에 단일 세포 RNA 및 TCR 시퀀싱을 적용할 것입니다. 또한, 세포 표면 단백질 발현은 전사 정보와 통합될 수 있습니다. Seurat를 포함한 다양한 생물 정보학 파이프라인은 마커 유전자 발현을 통해 알려진 세포 유형, 세포 하위 유형 또는 표현형에 할당되는 다양한 세포 클러스터를 식별하는 데 사용될 것입니다. 예를 들어 PD-1/PD-L1 발현 T 세포, 세포 독성 T 세포, 면역 억제 골수 세포 등의 풍부함을 모니터링할 수 있습니다. 단일 세포 수준에서 다음 매개변수가 관련됩니다.
- 확립된 면역 세포 유형(예: T 세포(CD4+, CD8+ 및 조절 서브세트), NK 세포, B 세포, MDSC, 대식세포, 호중구, 수지상 세포). 이러한 각 면역 세포 아형에 대한 전사 데이터를 분석하여 특정 표현형 상태를 정의하는 특정 유전자 발현 프로그램의 특성을 규명할 수 있습니다.
- 단일 세포 transcriptomics에 의해 확인된 모든 간질 세포 하위 유형의 구성.
- 각 세포 유형 및 세포 하위 유형(또는 세포 상태)에 대한 유전자 조절 네트워크가 설정되고 마스터 전사 조절자가 식별됩니다. 개별 T 세포 및 T 세포 서브클러스터는 모두 T 세포 활성화를 나타내는 인터페론 활성화, 높은 증식 및 전사율, 증가된 그랜자임 발현에 기초하여 분류될 것입니다.
혈액 샘플은 유사한 단일 세포 실험 절차를 거치게 됩니다. 먼저, Ficoll 밀도 구배 원심분리를 사용하여 말초 혈액 단핵 세포(PBMC)를 분리합니다. CITE-seq와 함께 단일 세포 전사체 분석은 5000 PBMC에서 수행됩니다. 세포 구성은 BAL 유체 세포를 처리하는 데 사용되는 것과 동일한 생물정보학 파이프라인을 사용하여 결정됩니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Els Wauters, MD, PhD
- 전화번호: +3216340942
- 이메일: els.wauters@uzleuven.be
연구 장소
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Flemish Brabant
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Leuven, Flemish Brabant, 벨기에, 3000
- 모병
- Universitaire Ziekenhuizen Leuven
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연락하다:
- Els Wauters, MD, PhD
- 전화번호: 016340942
- 이메일: els.wauters@uzleuven.be
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 성인 M/F/X(>= 18세)
- 가이드라인에 따라 치료를 받았거나 받았던 환자
- 암 치료 유발성 폐렴 가능성에 대해 BAL로 기관지경 검사를 받는 환자
- 다른 임상 시험에 포함되지 않음
- 서명된 동의서 양식
제외 기준:
• 이 연구에서 추가 처리에 적합하지 않은 수집된 자료(예: 나쁜 품질). 이 결정은 단일 세포 분석을 전문으로 하는 연구실 기술자 및/또는 생물 정보학자와 상의하여 이루어집니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 보병대
- 시간 관점: 유망한
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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ICI-폐렴
ICI-폐렴을 겪고 있는 암 환자
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ICI, 표준 치료로 투여
다른 이름들:
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방사선 요법으로 인한 폐렴
RT-폐렴을 겪고 있는 암 환자
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표준 치료로 시행되는 RT
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TKI에 의한 폐렴
TKI 유발성 폐렴을 경험한 암 환자
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TKI, 표준 치료로 투여
다른 이름들:
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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ICI-/RT-/TKI-유도성 폐렴 BAL 유체에 존재하는 scRNA-seq에 의해 결정된 면역 세포 비율
기간: 포함일부터 연구 완료까지, 평균 2년
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ICI-/RT-/TKI-유도성 폐렴 BAL 유체에 존재하는 면역 세포 아형의 백분율을 확인하고 통계적으로 비교함으로써 우리는 i) 어떤 면역 과정이 이러한 부작용을 유발하는지 이해하는 것을 목표로 합니다. ii) 추정되는 분자 바이오마커를 식별합니다. iii) 추정되는 치료법을 식별합니다. 대상
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포함일부터 연구 완료까지, 평균 2년
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ICI-/RT-/TKI-유도성 폐렴을 구별하는 scRNA-seq에 의해 결정된 바와 같이 BAL 유체에서 차별적으로 발현된 유전자
기간: 포함일부터 연구 완료까지, 평균 2년
|
ICI- vs. RT- vs. TKI-유도성 폐렴 BAL 유체에서 차별적으로 발현된 유전자를 확인함으로써 우리는 i) 어떤 면역 과정이 이러한 부작용을 유발하는지 이해 ii) 추정 분자 바이오마커 식별 iii) 추정 치료 표적 식별을 목표로 합니다.
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포함일부터 연구 완료까지, 평균 2년
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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ICI-/RT-/TKI-유발성 폐렴 말초 혈액 단핵 세포에 존재하는, scRNA-seq에 의해 결정된 면역 세포 비율
기간: 포함일부터 연구 완료까지, 평균 2년
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ICI-/RT-/TKI 유발 폐렴 말초 혈액 단핵 세포에 존재하는 면역 세포 아형의 백분율을 식별하고 통계적으로 비교함으로써 우리는 i) 어떤 면역 과정이 이러한 부작용을 유발하는지 이해 ii) 추정되는 분자 바이오마커 식별 iii) 식별 추정되는 치료 표적
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포함일부터 연구 완료까지, 평균 2년
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ICI-/RT-/TKI-유도성 폐렴을 구별하는 scRNA-seq에 의해 결정된 바와 같이 PBMC에서 차별적으로 발현된 유전자
기간: 포함일부터 연구 완료까지, 평균 2년
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ICI- 대 RT- 대 TKI-유도성 폐렴 PBMC에서 차등적으로 발현되는 유전자를 확인함으로써 우리는 i) 어떤 면역 과정이 이러한 부작용을 유발하는지 이해 ii) 추정 분자 바이오마커 식별 iii) 추정 치료 표적 식별을 목표로 합니다.
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포함일부터 연구 완료까지, 평균 2년
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공동 작업자 및 조사자
협력자
수사관
- 수석 연구원: Els Wauters, MD, PhD, University Hospitals - KU Leuven
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- S63357
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
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