Een eencellige benadering om biomarkers van pulmonale toxiciteit te identificeren voor blokkering van immuuncheckpoints
Het hoofddoel van deze prospectieve niet-interventionele verkennende monocentrische studie is het karakteriseren van de immuuncelsamenstelling van bronchoalveolaire lavage (BAL) vloeistof van kankerpatiënten die door kankertherapie veroorzaakte pneumonitis ervaren op eencellige schaal. Deze mechanistische inzichten kunnen rechtstreeks leiden tot vermeende diagnostische biomarkers en therapeutische doelen.
Een tweede zeer klinisch relevante hypothese is dat eencellige profilering van bloedmonsters circulerende biomarkers van ICB-toxiciteit zal onthullen, waardoor een niet-invasieve diagnose mogelijk wordt.
Studie Overzicht
Toestand
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
De onderzoekers zullen single cell RNA- en TCR-sequencing toepassen op maximaal 5.000 enkele cellen per monster. Bovendien kan celoppervlakte-eiwitexpressie worden geïntegreerd met de transcriptionele informatie. Verschillende bio-informatica-pijplijnen, waaronder Seurat, zullen worden gebruikt om verschillende celclusters te identificeren, die via merkergenexpressie zullen worden toegewezen aan bekende celtypes, cellulaire subtypes of fenotypes. Dit zal het bijvoorbeeld mogelijk maken om de overvloed aan PD-1/PD-L1 tot expressie brengende T-cellen, cytotoxische T-cellen, immuunonderdrukkende myeloïde cellen enz. De volgende parameters op eencellig niveau zullen onder meer relevant zijn:
- De samenstelling en relatieve overvloed van gevestigde immuunceltypen (bijv. T-cellen (CD4+, CD8+ en regulerende subsets), NK-cellen, B-cellen, MDSC's, macrofagen, neutrofielen, dendritische cellen). Transcriptomische gegevens voor elk van deze subtypes van immuuncellen zullen worden geanalyseerd, wat karakterisering van specifieke genexpressieprogramma's mogelijk maakt die specifieke fenotypische toestanden definiëren.
- Samenstelling van alle stromale cellulaire subtypes geïdentificeerd door single-cell transcriptomics.
- Een genregulerend netwerk voor elk celtype en cellulair subtype (of celtoestand) zal worden opgezet en master-transcriptieregulatoren zullen worden geïdentificeerd. Individuele T-cellen en T-celsubclusters zullen worden geclassificeerd op basis van interferonactivering, hoge proliferatie- en transcriptiesnelheden en verhoogde granzyme-expressie, die allemaal indicatief zijn voor T-celactivering.
Bloedmonsters zullen worden onderworpen aan vergelijkbare eencellige experimentele procedures. Eerst worden perifere mononucleaire bloedcellen (PBMC) geïsoleerd met behulp van Ficoll-dichtheidsgradiëntcentrifugatie. Eencellige transcriptoomanalyse in combinatie met CITE-seq zal worden uitgevoerd op 5000 PBMC. De celsamenstelling zal worden bepaald met behulp van dezelfde bio-informatica-pijplijnen die worden gebruikt voor het verwerken van de BAL-vloeistofcellen.
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Els Wauters, MD, PhD
- Telefoonnummer: +3216340942
- E-mail: els.wauters@uzleuven.be
Studie Locaties
-
-
Flemish Brabant
-
Leuven, Flemish Brabant, België, 3000
- Werving
- Universitaire Ziekenhuizen Leuven
-
Contact:
- Els Wauters, MD, PhD
- Telefoonnummer: 016340942
- E-mail: els.wauters@uzleuven.be
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Volwassen M/V/X (>= 18 jaar)
- Patiënten die volgens de richtlijnen worden of zijn behandeld
- Patiënten die bronchoscopie ondergaan met BAL, voor mogelijke door kankerbehandeling veroorzaakte pneumonitis
- Niet opgenomen in andere klinische onderzoeken
- Ondertekend toestemmingsformulier
Uitsluitingscriteria:
• Verzameld materiaal niet geschikt voor verdere verwerking in dit onderzoek (bijv. slechte kwaliteit). Deze beslissing wordt genomen in overleg met een laborant en/of bio-informaticus, gespecialiseerd in single-cell analyse.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Cohort
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
ICI-pneumonitis
Kankerpatiënten met ICI-pneumonitis
|
ICI, toegediend als standaardbehandeling
Andere namen:
|
|
Door radiotherapie geïnduceerde pneumonitis
Kankerpatiënten die RT-pneumonitis ervaren
|
RT, toegediend als standaardbehandeling
|
|
TKI-geïnduceerde longontsteking
Kankerpatiënten die TKI-geïnduceerde pneumonitis ervaren
|
TKI, toegediend als standaardbehandeling
Andere namen:
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Immuuncelaandelen, zoals bepaald door scRNA-seq, aanwezig in ICI-/RT-/TKI-geïnduceerde pneumonitis BAL-vloeistof
Tijdsspanne: Vanaf de datum van inclusie tot afronding van de studie, gemiddeld 2 jaar
|
Door het identificeren en statistisch vergelijken van de percentages van immuuncelsubtypes aanwezig in ICI-/RT-/TKI-geïnduceerde pneumonitis BAL-vloeistof, streven we ernaar om i) te begrijpen welke immuunprocessen deze bijwerkingen veroorzaken ii) vermeende moleculaire biomarkers te identificeren iii) vermeende therapeutische doelen
|
Vanaf de datum van inclusie tot afronding van de studie, gemiddeld 2 jaar
|
|
Differentieel tot expressie gebrachte genen in BAL-vloeistof, zoals bepaald door scRNA-seq, waarbij ICI-/RT-/TKI-geïnduceerde pneumonitis wordt onderscheiden
Tijdsspanne: Vanaf de datum van inclusie tot afronding van de studie, gemiddeld 2 jaar
|
Door differentieel tot expressie gebrachte genen te identificeren in ICI- vs. RT- vs. TKI-geïnduceerde pneumonitis BAL-vloeistof, willen we i) begrijpen welke immuunprocessen deze bijwerkingen veroorzaken ii) vermeende moleculaire biomarkers identificeren iii) vermeende therapeutische doelen identificeren
|
Vanaf de datum van inclusie tot afronding van de studie, gemiddeld 2 jaar
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Immuuncelaandelen, zoals bepaald door scRNA-seq, aanwezig in ICI-/RT-/TKI-geïnduceerde pneumonitis perifere mononucleaire bloedcellen
Tijdsspanne: Vanaf de datum van inclusie tot afronding van de studie, gemiddeld 2 jaar
|
Door het identificeren en statistisch vergelijken van de percentages van immuuncelsubtypes die aanwezig zijn in ICI-/RT-/TKI-geïnduceerde pneumonitis perifere mononucleaire bloedcellen, willen we i) begrijpen welke immuunprocessen deze bijwerkingen veroorzaken ii) vermeende moleculaire biomarkers identificeren iii) identificeren mogelijke therapeutische doelen
|
Vanaf de datum van inclusie tot afronding van de studie, gemiddeld 2 jaar
|
|
Differentieel tot expressie gebrachte genen in PBMC, zoals bepaald door scRNA-seq, onderscheid makend tussen ICI-/RT-/TKI-geïnduceerde pneumonitis
Tijdsspanne: Vanaf de datum van inclusie tot afronding van de studie, gemiddeld 2 jaar
|
Door differentieel tot expressie gebrachte genen te identificeren in ICI- vs. RT- vs. TKI-geïnduceerde pneumonitis PBMC, willen we i) begrijpen welke immuunprocessen deze bijwerkingen veroorzaken ii) vermeende moleculaire biomarkers identificeren iii) vermeende therapeutische doelen identificeren
|
Vanaf de datum van inclusie tot afronding van de studie, gemiddeld 2 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Medewerkers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Els Wauters, MD, PhD, University Hospitals - KU Leuven
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- S63357
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .