Одноклеточный подход к идентификации биомаркеров легочной токсичности для блокады контрольных точек иммунитета
Основная цель этого проспективного неинтервенционного исследовательского моноцентрического исследования состоит в том, чтобы охарактеризовать состав иммунных клеток жидкости бронхоальвеолярного лаважа (БАЛ) у онкологических больных, страдающих пневмонитом, вызванным терапией рака, в масштабе одной клетки. Эти механистические идеи могут напрямую привести к предполагаемым диагностическим биомаркерам и терапевтическим целям.
Вторая весьма клинически значимая гипотеза заключается в том, что профилирование отдельных клеток в образцах крови выявит циркулирующие биомаркеры токсичности ICB, что сделает возможной неинвазивную диагностику.
Обзор исследования
Статус
Подробное описание
Исследователи будут применять секвенирование РНК и TCR отдельных клеток до 5000 отдельных клеток на образец. Кроме того, экспрессия белков клеточной поверхности может быть интегрирована с транскрипционной информацией. Различные конвейеры биоинформатики, включая Seurat, будут использоваться для идентификации различных клеточных кластеров, которые посредством экспрессии маркерного гена будут отнесены к известным типам клеток, клеточным подтипам или фенотипам. Например, это позволит отслеживать количество Т-клеток, экспрессирующих PD-1/PD-L1, цитотоксических Т-клеток, иммуносупрессивных миелоидных клеток и т. д. Следующие параметры на уровне одной ячейки будут иметь значение, среди прочего:
- Состав и относительная распространенность установленных типов иммунных клеток (например, Т-клетки (CD4+, CD8+ и регуляторные субпопуляции), NK-клетки, В-клетки, MDSC, макрофаги, нейтрофилы, дендритные клетки). Транскриптомные данные для каждого из этих подтипов иммунных клеток будут проанализированы, что позволит охарактеризовать конкретные программы экспрессии генов, которые определяют конкретные фенотипические состояния.
- Состав всех стромальных клеточных подтипов, идентифицированных с помощью транскриптомики одиночных клеток.
- Будет создана генная регуляторная сеть для каждого клеточного типа и клеточного подтипа (или состояния клетки), и будут идентифицированы основные регуляторы транскрипции. Отдельные Т-клетки и субкластеры Т-клеток будут классифицироваться на основе активации интерферона, высокой скорости пролиферации и транскрипции и повышенной экспрессии гранзимов, которые все указывают на активацию Т-клеток.
Образцы крови будут подвергнуты аналогичным экспериментальным процедурам с отдельными клетками. Во-первых, мононуклеарные клетки периферической крови (PBMC) выделяют с помощью центрифугирования в градиенте плотности фиколла. Анализ транскриптома отдельных клеток в сочетании с CITE-seq будет выполняться на 5000 PBMC. Клеточный состав будет определяться с использованием тех же биоинформационных конвейеров, которые используются для обработки клеток жидкости БАЛ.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Els Wauters, MD, PhD
- Номер телефона: +3216340942
- Электронная почта: els.wauters@uzleuven.be
Места учебы
-
-
Flemish Brabant
-
Leuven, Flemish Brabant, Бельгия, 3000
- Рекрутинг
- Universitaire Ziekenhuizen Leuven
-
Контакт:
- Els Wauters, MD, PhD
- Номер телефона: 016340942
- Электронная почта: els.wauters@uzleuven.be
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Взрослый M/F/X (>= 18 лет)
- Пациенты, получающие или получавшие лечение в соответствии с рекомендациями
- Пациенты, перенесшие бронхоскопию с БАЛ, для возможного пневмонита, вызванного лечением рака
- Не включено в другие клинические испытания
- Подписанная форма информированного согласия
Критерий исключения:
• Собранный материал не подходит для дальнейшей обработки в этом исследовании (например, плохое качество). Это решение будет принято после консультации с лаборантом и/или биоинформатиком, специализирующимся на анализе одиночных клеток.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Когорта
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
ИКИ-пневмонит
Онкологические больные с ИКИ-пневмонитом
|
ICI, вводимая в качестве стандартного лечения
Другие имена:
|
|
Пневмонит, вызванный лучевой терапией
Онкологические больные с RT-пневмонитом
|
ЛТ, назначаемая в качестве стандартного лечения
|
|
ИТК-индуцированный пневмонит
Онкологические больные с пневмонитом, вызванным ИТК
|
ИТК в качестве стандартного лечения
Другие имена:
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Пропорции иммунных клеток, определенные с помощью scRNA-seq, присутствуют в БАЛ, вызванном ICI-/RT-/TKI-индуцированным пневмонитом
Временное ограничение: С момента включения до завершения исследования, в среднем 2 года
|
Определяя и статистически сравнивая процент подтипов иммунных клеток, присутствующих в жидкости ЖБАЛ, вызванной ICI-/RT-/TKI-индуцированным пневмонитом, мы стремимся: i) понять, какие иммунные процессы вызывают эти побочные эффекты, ii) определить предполагаемые молекулярные биомаркеры, iii) определить предполагаемые терапевтические цели
|
С момента включения до завершения исследования, в среднем 2 года
|
|
Дифференциально экспрессируемые гены в жидкости БАЛ, как определено с помощью scRNA-seq, различающие пневмонит, индуцированный ICI-/RT-/TKI.
Временное ограничение: С момента включения до завершения исследования, в среднем 2 года
|
Идентифицируя гены с дифференциальной экспрессией в жидкости ЖБАЛ при пневмонии, индуцированном ИКИ, в сравнении с ЛТ и ИТК, мы стремимся: i) понять, какие иммунные процессы вызывают эти нежелательные явления; ii) определить предполагаемые молекулярные биомаркеры; iii) определить предполагаемые терапевтические мишени.
|
С момента включения до завершения исследования, в среднем 2 года
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Пропорции иммунных клеток, определенные с помощью scRNA-seq, присутствуют в мононуклеарных клетках периферической крови, вызванных ICI-/RT-/TKI-пневмонитом
Временное ограничение: С момента включения до завершения исследования, в среднем 2 года
|
Путем определения и статистического сравнения процентного содержания подтипов иммунных клеток, присутствующих в мононуклеарных клетках периферической крови, вызванных ICI-/RT-/TKI-пневмонитом, мы стремимся: i) понять, какие иммунные процессы вызывают эти неблагоприятные события; ii) идентифицировать предполагаемые молекулярные биомаркеры; iii) идентифицировать предполагаемые терапевтические цели
|
С момента включения до завершения исследования, в среднем 2 года
|
|
Дифференциально экспрессируемые гены в PBMC, как определено с помощью scRNA-seq, различающие пневмонит, индуцированный ICI-/RT-/TKI
Временное ограничение: С момента включения до завершения исследования, в среднем 2 года
|
Идентифицируя дифференциально экспрессируемые гены в PBMC пневмонита, индуцированного ICI, RT- и TKI, мы стремимся i) понять, какие иммунные процессы вызывают эти неблагоприятные события, ii) определить предполагаемые молекулярные биомаркеры, iii) определить предполагаемые терапевтические мишени.
|
С момента включения до завершения исследования, в среднем 2 года
|
Соавторы и исследователи
Соавторы
Следователи
- Главный следователь: Els Wauters, MD, PhD, University Hospitals - KU Leuven
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Инфекции
- Инфекции дыхательных путей
- Заболевания дыхательных путей
- Легочные заболевания
- Пневмония
- Заболевания легких, интерстициальные
- Молекулярные механизмы фармакологического действия
- Противоопухолевые агенты
- Противоопухолевые агенты, иммунологические
- Дурвалумаб
- Пембролизумаб
- Ингибиторы иммунных контрольных точек
Другие идентификационные номера исследования
- S63357
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .