En enkeltcellet tilgang til at identificere biomarkører for lungetoksicitet for immunkontrolpunktblokade
Hovedmålet med denne prospektive ikke-interventionelle eksplorative monocentriske undersøgelse er at karakterisere immuncellesammensætningen af bronchoalveolær lavage (BAL) væske fra cancerpatienter, der oplever cancerterapi-induceret pneumonitis på en enkeltcellet skala. Disse mekanistiske indsigter kan direkte føre til formodede diagnostiske biomarkører og terapeutiske mål.
En anden yderst klinisk relevant hypotese er, at enkeltcelleprofilering af blodprøver vil afsløre cirkulerende biomarkører for ICB-toksicitet, hvilket gør ikke-invasiv diagnose mulig.
Studieoversigt
Status
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Efterforskerne vil anvende enkeltcelle RNA- og TCR-sekventering på op til 5.000 enkeltceller pr. prøve. Derudover kan celleoverfladeproteinekspression integreres med den transkriptionelle information. Forskellige bioinformatiske pipelines, herunder Seurat, vil blive brugt til at identificere forskellige celleklynger, som gennem markørgenekspression vil blive tildelt kendte celletyper, cellulære subtyper eller fænotyper. For eksempel vil dette gøre det muligt at overvåge mængden af PD-1/PD-L1-udtrykkende T-celler, cytotoksiske T-celler, immunsuppressive myeloidceller osv. Følgende parametre på enkeltcelleniveau vil blandt andet være relevante:
- Sammensætningen og den relative mængde af etablerede immuncelletyper (f. T-celler (CD4+, CD8+ og regulatoriske undergrupper), NK-celler, B-celler, MDSC'er, makrofager, neutrofiler, dendritiske celler). Transkriptomiske data for hver af disse immuncelleundertyper vil blive analyseret, hvilket muliggør karakterisering af specifikke genekspressionsprogrammer, der definerer specifikke fænotypiske tilstande.
- Sammensætning af alle stromale cellulære subtyper identificeret ved enkeltcellet transkriptomik.
- Et genregulerende netværk for hver celletype og cellulær subtype (eller celletilstand) vil blive etableret, og master transkriptionelle regulatorer vil blive identificeret. Individuelle T-celler og T-celle-subclusters vil blive klassificeret baseret på interferonaktivering, høje proliferations- og transkriptionshastigheder og øget granzymekspression, som alle er indikative for T-celleaktivering.
Blodprøver vil blive udsat for lignende enkeltcellede eksperimentelle procedurer. Først isoleres perifere blodmononukleære celler (PBMC) ved hjælp af Ficoll-densitetsgradientcentrifugering. Enkeltcellet transkriptomanalyse i kombination med CITE-seq vil blive udført på 5000 PBMC. Cellulær sammensætning vil blive bestemt ved hjælp af de samme bioinformatiske rørledninger, som bruges til at behandle BAL-væskecellerne.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Els Wauters, MD, PhD
- Telefonnummer: +3216340942
- E-mail: els.wauters@uzleuven.be
Studiesteder
-
-
Flemish Brabant
-
Leuven, Flemish Brabant, Belgien, 3000
- Rekruttering
- Universitaire Ziekenhuizen Leuven
-
Kontakt:
- Els Wauters, MD, PhD
- Telefonnummer: 016340942
- E-mail: els.wauters@uzleuven.be
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Voksen M/K/X (>= 18 år)
- Patienter, der modtager eller har modtaget behandling efter retningslinjer
- Patienter, der gennemgår bronkoskopi med BAL, for mulig kræftbehandlingsinduceret pneumonitis
- Ikke inkluderet i andre kliniske forsøg
- Underskrevet informeret samtykkeformular
Ekskluderingskriterier:
• Indsamlet materiale, der ikke er egnet til videre bearbejdning i denne undersøgelse (f.eks. dårlig kvalitet). Denne beslutning vil blive truffet i samråd med en laborant og/eller bioinformatiker med speciale i enkeltcelleanalyse.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
ICI-pneumonitis
Kræftpatienter, der oplever ICI-pneumonitis
|
ICI, administreret som standardbehandling
Andre navne:
|
|
Strålebehandling induceret pneumonitis
Kræftpatienter, der oplever RT-pneumonitis
|
RT, administreret som standardbehandling
|
|
TKI-induceret pneumonitis
Kræftpatienter, der oplever TKI-induceret pneumonitis
|
TKI, administreret som standardbehandling
Andre navne:
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Immuncelleforhold, som bestemt ved scRNA-seq, til stede i ICI-/RT-/TKI-induceret pneumonitis BAL væske
Tidsramme: Fra optagelsesdato til studieafslutning i gennemsnit 2 år
|
Ved at identificere og statistisk sammenligne procenterne af immuncelleundertyper, der er til stede i ICI-/RT-/TKI-induceret pneumonitis BAL-væske, sigter vi mod at i) forstå hvilke immunprocesser der driver disse uønskede hændelser ii) identificere formodede molekylære biomarkører iii) identificere formodet terapeutisk mål
|
Fra optagelsesdato til studieafslutning i gennemsnit 2 år
|
|
Differentielt udtrykte gener i BAL-væske, som bestemt af scRNA-seq, der skelner mellem ICI-/RT-/TKI-induceret pneumonitis
Tidsramme: Fra optagelsesdato til studieafslutning i gennemsnit 2 år
|
Ved at identificere differentielt udtrykte gener i ICI- vs. RT- vs. TKI-induceret pneumonitis BAL-væske, sigter vi mod at i) forstå hvilke immunprocesser der driver disse uønskede hændelser ii) identificere formodede molekylære biomarkører iii) identificere formodede terapeutiske mål
|
Fra optagelsesdato til studieafslutning i gennemsnit 2 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Immuncelleforhold, som bestemt ved scRNA-seq, til stede i ICI-/RT-/TKI-induceret pneumonitis mononukleære blodceller i perifert blod
Tidsramme: Fra optagelsesdato til studieafslutning i gennemsnit 2 år
|
Ved at identificere og statistisk sammenligne procenterne af immuncelleundertyper, der er til stede i ICI-/RT-/TKI-induceret pneumonitis mononukleære blodceller fra perifert blod, sigter vi mod at i) forstå hvilke immunprocesser der driver disse uønskede hændelser ii) identificere formodede molekylære biomarkører iii) identificere formodede terapeutiske mål
|
Fra optagelsesdato til studieafslutning i gennemsnit 2 år
|
|
Differentielt udtrykte gener i PBMC, som bestemt af scRNA-seq, der skelner mellem ICI-/RT-/TKI-induceret pneumonitis
Tidsramme: Fra optagelsesdato til studieafslutning i gennemsnit 2 år
|
Ved at identificere differentielt udtrykte gener i ICI- vs. RT- vs. TKI-induceret pneumonitis PBMC, sigter vi mod at i) forstå hvilke immunprocesser der driver disse uønskede hændelser ii) identificere formodede molekylære biomarkører iii) identificere formodede terapeutiske mål
|
Fra optagelsesdato til studieafslutning i gennemsnit 2 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Els Wauters, MD, PhD, University Hospitals - KU Leuven
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Anslået)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- S63357
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .