緑膿菌における排出ポンプおよび毒性因子遺伝子の分子検出 (Pseudomonas)
調査の概要
状態
条件
詳細な説明
PA感染の病因は多因子性であり、スルホンアミド、テトラサイクリン、トリメトプリムなどの一部の抗菌剤に対する細菌の固有の耐性、およびアミノグリコシドなどの主要なクラスの抗生物質に対する耐性を獲得または急速に発達させる能力によって、しばしば複雑になります。 、キノロン、B-ラクタム、およびポリミキシン (Bassetti et al., 2018)。
侵入直後の抗生物質の細胞外への排出、抗生物質を不活性化する酵素の産生、および細胞壁を横切る透過性の減少を媒介する流出システムは、抗菌薬耐性を発達させるために PA によって使用されるいくつかのメカニズムです (Meletis & Bagkeri、 2013)。
PA は、病因と感染の重症度の決定に重要な役割を果たす多数の病原性因子を持っています。 これらの病原性因子は、単独で、または互いに相乗的に作用して、組織の損傷、壊死、および細胞死を引き起こします。 PA の病原性因子の中で、病原性の主要な決定要因は、III 型分泌システム (T3SS) とクオラムセンシング (細胞間シグナル伝達システム) です。 T3SS はインジェクチソームとしても知られる針状の複合体で、細菌が ExoS、ExoT、ExoU、ExoY などのさまざまなエフェクタータンパク質を膜を越えて宿主細胞に送達できるようにし、宿主細胞の機能を変化させ、細菌の生存率を高めます。レート (Horna G および、Ruiz J、2021 年)。 この研究では、臨床分離株からの緑膿菌における排出遺伝子といくつかの毒性因子の存在によって引き起こされる抗生物質耐性の有病率を評価することを目的としました。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前：Noha S Shafik, lecturer
- 電話番号：+20 01067261504
- メール：Nohasaber@med.sohag.edu.eg
研究連絡先のバックアップ
- 名前：Nesma A Mohammed, lecturer
- 電話番号：+20 01006780725
- メール：Nesmaaateef@med.sohag.edu.eg
研究場所
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Sohag、エジプト
- 募集
- Sohag University
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コンタクト：
- Noha S Shafik, Lecturer
- 電話番号：01067261504
- メール：nohasaber@med.sohag.edu.eg
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コンタクト：
- Nesma A Mohamed, Lecturer
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
この研究は、緑膿菌によって引き起こされる可能性のある感染症に罹患しているすべての患者に対して実施されます。
サンプル (膿、尿、血液、痰、耳垢) は、ソハグ大学病院のさまざまな部門から収集されます。
臨床データは次のように取得されます。
- 発熱、喀痰、傷からの膿、尿路症状、上気道感染症の症状、外耳炎の症状などの臨床症状に関するデータ。
説明
包含基準:
- 緑膿菌による感染症に罹患しているすべての患者
除外基準:
- 緑膿菌以外の微生物を有すると診断されたサンプル。
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：ケースコントロール
- 時間の展望：断面図
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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緑膿菌感染症の患者
すべての患者は、緑膿菌によって引き起こされる可能性のある感染症に苦しんでいます。 臨床データは次のように取得されます。
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サンプルは、プレーティングアウト技術を使用してセトリミド寒天に接種されます。
セトリミド寒天上のコロニーをスライド ガラスに広げ、グラム染色で染色します。
抗生物質感受性試験は、CLSIに従ってディスク拡散法によって行われます
従来の PCR による遺伝子といくつかの病原性遺伝子を排出するための分子検出
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緑膿菌以外の感染症の患者
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サンプルは、プレーティングアウト技術を使用してセトリミド寒天に接種されます。
セトリミド寒天上のコロニーをスライド ガラスに広げ、グラム染色で染色します。
抗生物質感受性試験は、CLSIに従ってディスク拡散法によって行われます
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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培養および自動システム技術を使用した緑膿菌の分離と同定
時間枠：2022 年 12 月 1 日から 2023 年 2 月 1 日まで
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シトラミド寒天培地での培養、グラムによる染色、オキシダーゼ試験、糖発酵試験などの生化学反応、および vitek2 システムを使用した自動識別などのさまざまな実験技術を使用して、Sohag 大学病院から収集されたさまざまな臨床サンプル中の緑膿菌の識別
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2022 年 12 月 1 日から 2023 年 2 月 1 日まで
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Modified Kerby -Disc Diffusion法を用いた最近の抗生物質感受性パターンの同定
時間枠：2022 年 12 月 1 日から 2023 年 2 月 1 日まで
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ミュラーヒントン寒天を含むピットディッシュに接種物を広げることによるディスク拡散法によるさまざまな抗生物質を使用した最近の抗生物質感受性パターンの決定、次に抗生物質を含むさまざまなディスクを1.5 cmの距離に置き、37℃で24時間インキュベートします。
CSLI 2022 のガイドラインに従って、阻害ゾーンの直径を測定して、各抗生物質の MIC を決定します。
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2022 年 12 月 1 日から 2023 年 2 月 1 日まで
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PCRを用いたいくつかの病原性因子と排出遺伝子の分子同定
時間枠：2023 年 2 月 1 日から 2023 年 3 月 30 日まで
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従来の PCR による特定のプライマーを使用した、いくつかの病原性因子および流出遺伝子の分子検出。
以下の遺伝子のプライマーを exoS、exoU、toxA、mex A、mex B として使用します。最初に DNA の抽出を行い、続いてサーマルサイクラーを使用した増幅法を行います。
増幅された DNA の検出は、臭化エチジウムで染色された Agrose ゲル電気泳動を使用して行われます。
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2023 年 2 月 1 日から 2023 年 3 月 30 日まで
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協力者と研究者
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捜査官
- スタディチェア：Mohamed H Alrawy、Faculty of medicine, Sohag university
- スタディチェア：Ebtisam M Gad、Faculty of medicine, Sohag university
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その他の研究ID番号
- Soh-Med-22-11-18
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