Efflux-pumpun ja virulenssitekijöiden geenien molekulaarinen havaitseminen Pseudomonas Aeruginosassa (Pseudomonas)
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
PA-infektioiden patogeneesi on monitekijäinen, ja sitä monimutkaistaa usein bakteerien luontainen vastustuskyky joillekin antimikrobisille aineille, kuten sulfonamideille, tetrasykliineille ja trimetopriimille, sekä sen kyky hankkia tai kehittää nopeasti resistenssi tärkeimmille antibioottiluokille, kuten aminoglykosideille. , kinolonit, B-laktaamit ja polymyksiinit (Bassetti et al., 2018).
Efflux-järjestelmät, jotka välittävät antibioottien karkottamista solusta pian sisääntulon jälkeen, entsyymien tuotantoa antibioottien inaktivoimiseksi ja läpäisevyyden heikkenemistä soluseinän läpi ovat joitakin mekanismeja, joita PA käyttää mikrobilääkeresistenssin kehittämiseen (Meletis & Bagkeri, 2013).
PA:lla on suuri määrä virulenssitekijöitä, joilla on merkittävä rooli patogeneesissä ja infektion vakavuuden määrittämisessä. Nämä virulenssitekijät toimivat yksinään tai synergisesti toistensa kanssa aiheuttaen kudosvaurioita, nekroosia ja solukuolemaa. PA:n virulenssitekijöiden joukossa virulenssin päätekijät ovat tyypin III eritysjärjestelmä (T3SS) ja quorum-sensing (solusta soluun-signalointijärjestelmä). T3SS on neulamainen kompleksi, joka tunnetaan myös nimellä injektiosolu, jonka avulla bakteeri voi kuljettaa erilaisia efektoriproteiineja, kuten ExoS, ExoT, ExoU ja ExoY kalvon läpi isäntäsoluun, mikä muuttaa isäntäsolun toimintoja ja lisää bakteerien eloonjäämistä. hinnat (Horna G ja Ruiz J, 2021). Tässä tutkimuksessa pyrimme arvioimaan kliinisistä isolaateista peräisin olevan Pseudomonas aeruginosan Efflux-geenien ja joidenkin virulenssitekijöiden aiheuttaman antibioottiresistenssin esiintyvyyttä.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Noha S Shafik, lecturer
- Puhelinnumero: +20 01067261504
- Sähköposti: Nohasaber@med.sohag.edu.eg
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Nesma A Mohammed, lecturer
- Puhelinnumero: +20 01006780725
- Sähköposti: Nesmaaateef@med.sohag.edu.eg
Opiskelupaikat
-
-
-
Sohag, Egypti
- Rekrytointi
- Sohag University
-
Ottaa yhteyttä:
- Noha S Shafik, Lecturer
- Puhelinnumero: 01067261504
- Sähköposti: nohasaber@med.sohag.edu.eg
-
Ottaa yhteyttä:
- Nesma A Mohamed, Lecturer
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Tämä tutkimus tehdään kaikille potilaille, jotka kärsivät pseudomonas aeruginosan mahdollisesti aiheuttamista infektioista.
Näytteitä (mätä, virtsa, veri, yskös, korvavuoto) kerätään sohagin yliopistollisen sairaalan eri osastoilta.
Kliiniset tiedot saadaan seuraavasti:
- Tiedot kliinisistä ilmenemismuodoista, mukaan lukien kuume, yskäneritys, haavan mätä, virtsatieoireet, ylähengitystieinfektioiden oireet ja ulkokorvantulehduksen oireet.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Kaikki potilaat, jotka kärsivät infektioista, jotka voivat olla pseudomonas aeruginosan aiheuttamia
Poissulkemiskriteerit:
- Näytteet, joissa on diagnosoitu muita organismeja kuin pseudomonas aeruginosa.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Case-Control
- Aikanäkymät: Poikkileikkaus
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Potilaat, joilla on pseudomonas aeruginosa -infektio
Kaikki potilaat kärsivät infektioista, jotka voivat olla pseudomonas aeruginosan aiheuttamia. Kliiniset tiedot saadaan seuraavasti:
|
Näytteet siirrostetaan setrimidiagarille käyttämällä maljaustekniikkaa.
Setrimidiagarilla olevat pesäkkeet levitetään lasilevylle ja värjätään grammavärjäyksellä
Antibioottiherkkyystesti tehdään levydiffuusiomenetelmällä CLSI:n mukaisesti
Efflux-geenien ja joidenkin virulenssigeenien molekyylin havaitseminen tavanomaisella PCR:llä
|
|
Potilaat, joilla on muita infektioita kuin pseudomonas aeruginosa
|
Näytteet siirrostetaan setrimidiagarille käyttämällä maljaustekniikkaa.
Setrimidiagarilla olevat pesäkkeet levitetään lasilevylle ja värjätään grammavärjäyksellä
Antibioottiherkkyystesti tehdään levydiffuusiomenetelmällä CLSI:n mukaisesti
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Pseudomonas aeruginosan eristäminen ja tunnistaminen viljely- ja automatisoitujen järjestelmätekniikoiden avulla
Aikaikkuna: 1.12.2022–1.2.2023
|
pseudomonas aeruginosan tunnistaminen erilaisista kliinisistä näytteistä, jotka on kerätty Sohagin yliopistosairaalasta eri laboratoriotekniikoilla, kuten viljelmä sitramidiagarilla, värjäys grammalla, biokemialliset reaktiot, kuten oksidaasitesti, sokerifermentointitesti ja automaattinen tunnistus Vitek2-järjestelmän avulla
|
1.12.2022–1.2.2023
|
|
Viimeaikaisen antibioottiherkkyysmallin tunnistaminen Modified Kerby -Disc Diffusion -menetelmällä
Aikaikkuna: 1.12.2022–1.2.2023
|
Viimeaikaisen antibioottiherkkyyskuvion määrittäminen käyttämällä erilaisia antibiootteja levydiffuusiomenetelmällä levittämällä siirroste Muller Hinton Agar -agaria sisältävään pitry-maljaan, sitten asetetaan erilaisia antibiootteja sisältäviä kiekkoja 1,5 cm:n etäisyydelle ja inkuboidaan sitten 37 °C:ssa 24 tuntia.
Estoalueen halkaisija mitataan MIC:n määrittämiseksi kullekin antibiootille CSLI 2022:n ohjeiden mukaisesti.
|
1.12.2022–1.2.2023
|
|
Joidenkin virulenssitekijöiden ja effluksigeenien molekyylitunnistus PCR:llä
Aikaikkuna: 1.2.2023–30.3.2023
|
Joidenkin virulenssitekijöiden ja effluksigeenien molekyylin havaitseminen käyttämällä spesifisiä alukkeita tavanomaisella PCR:llä.
seuraavien geenien alukkeita käytetään exoS:na, exoU:na, toxA:na, mex A:na, mex B:nä. DNA:n uuttaminen tehdään ensin, mitä seuraa monistustekniikka käyttäen lämpösyklilaitetta.
Monistetun DNA:n havaitseminen tehdään käyttäen Agrose-geelielektroforeesia, joka on värjätty etidiumbromidilla.
|
1.2.2023–30.3.2023
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Opintojen puheenjohtaja: Mohamed H Alrawy, Faculty of medicine, Sohag university
- Opintojen puheenjohtaja: Ebtisam M Gad, Faculty of medicine, Sohag university
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- Soh-Med-22-11-18
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .