Wykrywanie molekularne genów pompy efluksowej i czynników wirulencji u Pseudomonas aeruginosa (Pseudomonas)
Przegląd badań
Status
Warunki
Szczegółowy opis
Patogeneza zakażeń PA jest wieloczynnikowa i często komplikuje ją wrodzona oporność bakterii na niektóre środki przeciwdrobnoustrojowe, takie jak sulfonamidy, tetracykliny i trimetoprim, a także jej zdolność do nabywania lub szybkiego rozwijania oporności na główne grupy antybiotyków, takie jak aminoglikozydy , chinolony, B-laktamy i polimyksyny (Bassetti i in., 2018).
Systemy wypływu, które pośredniczą w wydalaniu antybiotyków z komórki wkrótce po wejściu, wytwarzanie enzymów inaktywujących antybiotyki oraz zmniejszenie przepuszczalności przez ścianę komórkową to niektóre mechanizmy wykorzystywane przez PA do rozwoju oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe (Meletis i Bagkeri, 2013).
PA posiada dużą liczbę czynników wirulencji, które odgrywają istotną rolę w patogenezie i określaniu ciężkości zakażenia. Te czynniki wirulencji działają samodzielnie lub w synergii ze sobą, powodując uszkodzenie tkanki, martwicę i śmierć komórki. Wśród czynników wirulencji PA głównymi determinantami wirulencji są system wydzielniczy typu III (T3SS) i wykrywanie kworum (system sygnalizacji między komórkami). T3SS to podobny do igły kompleks, znany również jako injectosom, który umożliwia bakteriom dostarczanie różnych białek efektorowych, takich jak ExoS, ExoT, ExoU i ExoY, przez błonę do komórki gospodarza, zmieniając funkcje komórki gospodarza i zwiększając przeżywalność bakterii stawki ( Horna G i Ruiz J, 2021). W tym badaniu naszym celem była ocena częstości występowania oporności na antybiotyki spowodowanej obecnością genów Efflux i niektórych czynników wirulencji u Pseudomonas aeruginosa z izolatów klinicznych.
Typ studiów
Zapisy (Oczekiwany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Noha S Shafik, lecturer
- Numer telefonu: +20 01067261504
- E-mail: Nohasaber@med.sohag.edu.eg
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Nesma A Mohammed, lecturer
- Numer telefonu: +20 01006780725
- E-mail: Nesmaaateef@med.sohag.edu.eg
Lokalizacje studiów
-
-
-
Sohag, Egipt
- Rekrutacyjny
- Sohag University
-
Kontakt:
- Noha S Shafik, Lecturer
- Numer telefonu: 01067261504
- E-mail: nohasaber@med.sohag.edu.eg
-
Kontakt:
- Nesma A Mohamed, Lecturer
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Badanie to zostanie przeprowadzone na wszystkich pacjentach cierpiących na infekcje, które mogą być spowodowane przez Pseudomonas aeruginosa.
Próbki (ropa, mocz, krew, plwocina, wydzielina z uszu) zostaną pobrane z różnych oddziałów szpitala uniwersyteckiego Sohag.
Dane kliniczne zostaną uzyskane jako:
- Dane dotyczące objawów klinicznych, w tym gorączki, odkrztuszania, ropy z ran, objawów ze strony układu moczowego, objawów infekcji górnych dróg oddechowych oraz objawów zapalenia ucha zewnętrznego.
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Wszyscy pacjenci cierpiący na infekcje, które mogą być spowodowane przez Pseudomonas aeruginosa
Kryteria wyłączenia:
- Próbki, w których zdiagnozowano organizmy inne niż Pseudomonas aeruginosa.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kontrola przypadków
- Perspektywy czasowe: Przekrojowe
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Pacjenci z zakażeniami Pseudomonas aeruginosa
Wszyscy pacjenci cierpią na infekcje, które mogą być spowodowane przez Pseudomonas aeruginosa. Dane kliniczne zostaną uzyskane jako:
|
Próbki zostaną posiane na agarze z cetrymidem przy użyciu techniki wysiewu.
kolonie na agarze z cetrymidem zostaną rozłożone na szkiełku podstawowym i wybarwione metodą Grama
Badanie wrażliwości na antybiotyki zostanie przeprowadzone metodą dyfuzyjno-krążkową zgodnie z CLSI
Wykrywanie molekularne genów wypływowych i niektórych genów wirulencji za pomocą konwencjonalnej PCR
|
|
Pacjenci z zakażeniami innymi niż Pseudomonas aeruginosa
|
Próbki zostaną posiane na agarze z cetrymidem przy użyciu techniki wysiewu.
kolonie na agarze z cetrymidem zostaną rozłożone na szkiełku podstawowym i wybarwione metodą Grama
Badanie wrażliwości na antybiotyki zostanie przeprowadzone metodą dyfuzyjno-krążkową zgodnie z CLSI
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Izolacja i identyfikacja Pseudomonas aeruginosa przy użyciu technik hodowli i systemów automatycznych
Ramy czasowe: 1 grudnia 2022 do 1 lutego 2023
|
identyfikacja Pseudomonas aeruginosa w różnych próbkach klinicznych pobranych ze szpitala Sohag University przy użyciu różnych technik laboratoryjnych, takich jak hodowla na agarze z cytrynianem, barwienie Grama, reakcje biochemiczne, takie jak test oksydazy, test fermentacji cukru i automatyczna identyfikacja za pomocą systemu vitek2
|
1 grudnia 2022 do 1 lutego 2023
|
|
Identyfikacja aktualnego wzorca wrażliwości na antybiotyki przy użyciu zmodyfikowanej metody Kerby-Disc Diffusion
Ramy czasowe: 1 grudnia 2022 do 1 lutego 2023
|
Określenie aktualnego wzorca wrażliwości na antybiotyki przy użyciu różnych antybiotyków metodą dyfuzyjno-krążkową poprzez rozprowadzenie inokulum w płytce wgłębnej zawierającej agar Mullera Hintona, następnie różne krążki zawierające antybiotyki umieszcza się w odległości 1,5 cm, a następnie inkubuje w temperaturze 37°C przez 24 godziny.
Średnica strefy zahamowania jest mierzona w celu określenia MIC dla każdego antybiotyku zgodnie z wytycznymi CSLI 2022.
|
1 grudnia 2022 do 1 lutego 2023
|
|
Molekularna identyfikacja niektórych czynników wirulencji i genów wypływowych za pomocą PCR
Ramy czasowe: Od 1 lutego 2023 r. do 30 marca 2023 r
|
Wykrywanie molekularne niektórych czynników wirulencji i genów wypływowych przy użyciu specyficznych starterów metodą konwencjonalnego PCR.
startery następujących genów zostaną użyte jako exoS,exoU, toxA, mex A, mex B. Najpierw zostanie wykonana ekstrakcja DNA, a następnie technika amplifikacji przy użyciu termocyklera.
Detekcja zamplifikowanego DNA zostanie przeprowadzona za pomocą elektroforezy w żelu Agrose barwionym bromkiem etydyny.
|
Od 1 lutego 2023 r. do 30 marca 2023 r
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Śledczy
- Krzesło do nauki: Mohamed H Alrawy, Faculty of medicine, Sohag university
- Krzesło do nauki: Ebtisam M Gad, Faculty of medicine, Sohag university
Publikacje i pomocne linki
Przydatne linki
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Oczekiwany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- Soh-Med-22-11-18
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .