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Rilevazione molecolare dei geni della pompa di efflusso e dei fattori di virulenza in Pseudomonas aeruginosa (Pseudomonas)

11 aprile 2023 aggiornato da: Noha Saber Shafik, Sohag University
Pseudomonas aeruginosa (PA) è un bastoncino gram-negativo aerobico, non fermentante, ubiquitario, ampiamente associato alla polmonite nosocomiale e può portare a malattie gravi con esiti infausti, in particolare nelle persone in condizioni critiche, a causa della capacità di alcuni ceppi di causare lesioni epiteliali polmonari. danno e diffusione nella circolazione. 2 Nell'unità di terapia intensiva, l'infezione PA è classificata tra le prime cinque cause di infezioni del flusso sanguigno, polmonari, del sito chirurgico, del tratto urinario e dei tessuti molli.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

La patogenesi delle infezioni da PA è multifattoriale ed è spesso complicata dalla resistenza intrinseca del batterio ad alcuni agenti antimicrobici come sulfamidici, tetracicline e trimetoprim, nonché dalla sua capacità di acquisire o sviluppare rapidamente resistenza alle principali classi di antibiotici come gli aminoglicosidi , chinoloni, B-lattamici e polimixine (Bassetti et al., 2018).

I sistemi di efflusso, che mediano l'espulsione degli antibiotici fuori dalla cellula poco dopo l'ingresso, la produzione di enzimi per inattivare gli antibiotici e la diminuzione della permeabilità attraverso la parete cellulare sono alcuni meccanismi utilizzati dalla PA per sviluppare la resistenza antimicrobica (Meletis & Bagkeri, 2013).

La PA possiede un gran numero di fattori di virulenza che svolgono un ruolo significativo nella patogenesi e nella determinazione della gravità dell'infezione. Questi fattori di virulenza agiscono da soli o in sinergia tra loro causando danno tissutale, necrosi e morte cellulare. Tra i fattori di virulenza della PA, i principali determinanti della virulenza sono il sistema di secrezione di tipo III (T3SS) e il quorum sensing (sistema di segnalazione cellula-cellula). Il T3SS è un complesso aghiforme, noto anche come iniettisoma, che consente a un batterio di fornire diverse proteine ​​effettrici come ExoS, ExoT, ExoU ed ExoY attraverso la membrana in una cellula ospite, alterando le funzioni della cellula ospite e aumentando la sopravvivenza batterica tariffe ( Horna G e, Ruiz J, 2021). In questo studio, abbiamo mirato a valutare la prevalenza della resistenza agli antibiotici causata dalla presenza di geni Eflux e alcuni fattori di virulenza in Pseudomonas aeruginosa da isolati clinici.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Anticipato)

75

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Luoghi di studio

      • Sohag, Egitto
        • Reclutamento
        • Sohag University
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Nesma A Mohamed, Lecturer

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 4 settimane a 80 anni (Bambino, Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

No

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Questo studio sarà condotto su tutti i pazienti affetti da infezioni che possono essere causate da pseudomonas aeruginosa.

I campioni (pus, urina, sangue, espettorato, secrezione auricolare) saranno raccolti da diversi dipartimenti dell'ospedale universitario di Sohag.

I dati clinici saranno ottenuti come:

- Dati sulle manifestazioni cliniche tra cui febbre, espettorazione, pus da ferite, sintomi urinari, sintomi di infezioni del tratto respiratorio superiore e sintomi di otite esterna.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Tutti i pazienti affetti da infezioni che possono essere causate da pseudomonas aeruginosa

Criteri di esclusione:

  • Campioni con diagnosi di microrganismi diversi da pseudomonas aeruginosa.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Caso di controllo
  • Prospettive temporali: Trasversale

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Pazienti con infezioni da pseudomonas aeruginosa

Tutti i pazienti soffrono di infezioni che possono essere causate da pseudomonas aeruginosa.

I dati clinici saranno ottenuti come:

  • Dati sulle manifestazioni cliniche tra cui febbre, espettorazione, pus da ferite, sintomi urinari, sintomi di infezioni del tratto respiratorio superiore e sintomi di otite esterna.
  • I campioni saranno coltivati ​​su cetrimide agar.
  • I test di sensibilità agli antibiotici saranno eseguiti con il metodo della diffusione del disco secondo CLSI.
  • Rilevazione molecolare dei geni di efflusso e di alcuni geni di virulenza mediante PCR.
I campioni saranno inoculati su cetrimide agar utilizzando la tecnica del plating out.
le colonie su cetrimide agar saranno disposte su vetrino e colorate con colorazione di Gram
I test di sensibilità agli antibiotici saranno eseguiti con il metodo della diffusione del disco secondo CLSI
Rilevazione molecolare dei geni di efflusso e di alcuni geni di virulenza mediante PCR convenzionale
Pazienti con infezioni diverse da pseudomonas aeruginosa
  • Dati sulle manifestazioni cliniche tra cui febbre, espettorazione, pus da ferite, sintomi urinari, sintomi di infezioni del tratto respiratorio superiore e sintomi di otite esterna.
  • I campioni saranno coltivati ​​su diversi terreni di coltura e identificati automaticamente dal sistema Vitek.
I campioni saranno inoculati su cetrimide agar utilizzando la tecnica del plating out.
le colonie su cetrimide agar saranno disposte su vetrino e colorate con colorazione di Gram
I test di sensibilità agli antibiotici saranno eseguiti con il metodo della diffusione del disco secondo CLSI

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Isolamento e identificazione di pseudomonas aeruginosa mediante tecniche di coltura e sistemi automatizzati
Lasso di tempo: Dal 1 dicembre 2022 al 1 febbraio 2023
identificazione di pseudomonas aeruginosa in diversi campioni clinici raccolti dall'ospedale universitario di Sohag utilizzando diverse tecniche di laboratorio come coltura su agar citramide, colorazione con Gram, reazioni biochimiche come test dell'ossidasi, test di fermentazione dello zucchero e identificazione automatica utilizzando il sistema vitek2
Dal 1 dicembre 2022 al 1 febbraio 2023
Identificazione del pattern di sensibilità agli antibiotici recente utilizzando il metodo Modified Kerby -Disc Diffusion
Lasso di tempo: Dal 1 dicembre 2022 al 1 febbraio 2023
Determinazione del modello recente di sensibilità agli antibiotici utilizzando diversi antibiotici mediante metodo di diffusione del disco diffondendo l'inoculo in una capsula di pitry contenente Muller Hinton Agar, quindi diversi dischi contenenti antibiotici vengono posti a una distanza di 1,5 cm, quindi incubati a 37°C per 24 ore. Il diametro della zona di inibizione viene misurato per determinare la MIC per ciascun antibiotico secondo le linee guida del CSLI 2022.
Dal 1 dicembre 2022 al 1 febbraio 2023
Identificazione molecolare di alcuni fattori di virulenza e geni di efflusso mediante PCR
Lasso di tempo: Dal 1 febbraio 2023 al 30 marzo 2023
Rilevazione molecolare di alcuni fattori di virulenza e geni di efflusso mediante primer specifici mediante PCR convenzionale. primer dei seguenti geni saranno usati come exoS,exoU, toxA, mex A, mex B. L'estrazione del DNA sarà fatta prima, seguita dalla tecnica di amplificazione usando il termociclatore. Il rilevamento del DNA amplificato sarà effettuato mediante elettroforesi su gel di Agrose colorato con bromuro di etidio.
Dal 1 febbraio 2023 al 30 marzo 2023

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Cattedra di studio: Mohamed H Alrawy, Faculty of Medicine, Sohag University
  • Cattedra di studio: Ebtisam M Gad, Faculty of Medicine, Sohag University

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Collegamenti utili

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

1 dicembre 2022

Completamento primario (Effettivo)

30 marzo 2023

Completamento dello studio (Anticipato)

1 maggio 2023

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

19 novembre 2022

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

29 novembre 2022

Primo Inserito (Effettivo)

8 dicembre 2022

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

12 aprile 2023

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

11 aprile 2023

Ultimo verificato

1 aprile 2023

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Pseudomonas Aeruginosa

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