Молекулярное обнаружение генов эффлюксной помпы и факторов вирулентности у Pseudomonas aeruginosa (Pseudomonas)
Обзор исследования
Статус
Условия
Подробное описание
Патогенез инфекций PA является многофакторным и часто осложняется внутренней устойчивостью бактерий к некоторым противомикробным агентам, таким как сульфаниламиды, тетрациклины и триметоприм, а также их способностью приобретать или быстро развивать устойчивость к основным классам антибиотиков, таким как аминогликозиды. , хинолоны, В-лактамы и полимиксины (Bassetti et al., 2018).
Системы оттока, которые опосредуют изгнание антибиотиков из клетки вскоре после проникновения, производство ферментов для инактивации антибиотиков и снижение проницаемости через клеточную стенку, являются некоторыми механизмами, используемыми PA для развития устойчивости к противомикробным препаратам (Meletis & Bagkeri, 2013).
ПА обладает большим количеством факторов вирулентности, играющих существенную роль в патогенезе и определении тяжести инфекции. Эти факторы вирулентности действуют по отдельности или в синергии друг с другом, вызывая повреждение тканей, некроз и гибель клеток. Среди факторов вирулентности PA основными детерминантами вирулентности являются система секреции типа III (T3SS) и ощущение кворума (система передачи сигналов между клетками). T3SS представляет собой игольчатый комплекс, также известный как инъекционная сома, который позволяет бактериям доставлять различные эффекторные белки, такие как ExoS, ExoT, ExoU и ExoY, через мембрану в клетку-хозяина, изменяя функции клетки-хозяина и повышая выживаемость бактерий. ставки ( Horna G and, Ruiz J, 2021). В этом исследовании мы стремились оценить распространенность устойчивости к антибиотикам, вызванную наличием генов Efflux и некоторых факторов вирулентности у Pseudomonas aeruginosa из клинических изолятов.
Тип исследования
Регистрация (Ожидаемый)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Noha S Shafik, lecturer
- Номер телефона: +20 01067261504
- Электронная почта: Nohasaber@med.sohag.edu.eg
Учебное резервное копирование контактов
- Имя: Nesma A Mohammed, lecturer
- Номер телефона: +20 01006780725
- Электронная почта: Nesmaaateef@med.sohag.edu.eg
Места учебы
-
-
-
Sohag, Египет
- Рекрутинг
- Sohag University
-
Контакт:
- Noha S Shafik, Lecturer
- Номер телефона: 01067261504
- Электронная почта: nohasaber@med.sohag.edu.eg
-
Контакт:
- Nesma A Mohamed, Lecturer
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Это исследование будет проводиться на всех пациентах, страдающих инфекциями, которые могут быть вызваны синегнойной палочкой.
Образцы (гной, моча, кровь, мокрота, выделения из ушей) будут собираться в разных отделениях университетской больницы Сохаг.
Клинические данные будут получены как:
- Данные о клинических проявлениях, включая лихорадку, отхаркивание, гной из ран, симптомы мочеиспускания, симптомы инфекций верхних дыхательных путей и симптомы наружного отита.
Описание
Критерии включения:
- Все пациенты, страдающие инфекциями, которые могут быть вызваны синегнойной палочкой.
Критерий исключения:
- В образцах диагностировано наличие микроорганизмов, отличных от Pseudomonas aeruginosa.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Кейс-контроль
- Временные перспективы: Поперечный разрез
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Пациенты с инфекциями синегнойной палочки
Все больные страдают инфекциями, которые могут быть вызваны синегнойной палочкой. Клинические данные будут получены как:
|
Образцы будут инокулированы на цетримидный агар с использованием техники посева.
колонии на цетримидном агаре распределяются по предметному стеклу и окрашиваются по Граму
Тестирование на чувствительность к антибиотикам будет проводиться диско-диффузионным методом в соответствии с CLSI.
Молекулярное обнаружение генов оттока и некоторых генов вирулентности с помощью традиционной ПЦР
|
|
Пациенты с инфекциями, отличными от Pseudomonas aeruginosa
|
Образцы будут инокулированы на цетримидный агар с использованием техники посева.
колонии на цетримидном агаре распределяются по предметному стеклу и окрашиваются по Граму
Тестирование на чувствительность к антибиотикам будет проводиться диско-диффузионным методом в соответствии с CLSI.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Выделение и идентификация Pseudomonas aeruginosa с использованием методов культивирования и автоматизированных систем
Временное ограничение: С 1 декабря 2022 г. по 1 февраля 2023 г.
|
идентификация Pseudomonas aeruginosa в различных клинических образцах, собранных в больнице Университета Сохаг, с использованием различных лабораторных методов, таких как посев на цитрамидный агар, окрашивание по Граму, биохимические реакции, такие как тест на оксидазу, тест на ферментацию сахара и автоматическая идентификация с использованием системы vitek2.
|
С 1 декабря 2022 г. по 1 февраля 2023 г.
|
|
Идентификация недавней картины чувствительности к антибиотикам с использованием модифицированного метода Керби-дисковой диффузии
Временное ограничение: С 1 декабря 2022 г. по 1 февраля 2023 г.
|
Определение недавней картины чувствительности к антибиотикам с использованием различных антибиотиков методом диско-диффузии путем распределения инокулята в чашке из кастрюли, содержащей агар Мюллера-Хинтона, затем различные диски, содержащие антибиотики, помещаются на расстоянии 1,5 см, затем инкубируются при 37°С в течение 24 часов.
Диаметр зоны ингибирования измеряют для определения МИК для каждого антибиотика в соответствии с рекомендациями CSLI 2022.
|
С 1 декабря 2022 г. по 1 февраля 2023 г.
|
|
Молекулярная идентификация некоторых факторов вирулентности и генов оттока с помощью ПЦР
Временное ограничение: 1 февраля 2023 г. - 30 марта 2023 г.
|
Молекулярное обнаружение некоторых факторов вирулентности и генов оттока с использованием специфических праймеров с помощью традиционной ПЦР.
праймеры следующих генов будут использоваться как exoS, exoU, toxA, mex A, mex B. Сначала будет проведена экстракция ДНК, а затем метод амплификации с использованием термоциклера.
Обнаружение амплифицированной ДНК будет проводиться с помощью электрофореза в геле Agrose, окрашенного бромистым этидием.
|
1 февраля 2023 г. - 30 марта 2023 г.
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Учебный стул: Mohamed H Alrawy, Faculty of medicine, Sohag university
- Учебный стул: Ebtisam M Gad, Faculty of medicine, Sohag university
Публикации и полезные ссылки
Полезные ссылки
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Ожидаемый)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- Soh-Med-22-11-18
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .