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Detección molecular de genes de factores de virulencia y bomba de eflujo en Pseudomonas aeruginosa (Pseudomonas)

11 de abril de 2023 actualizado por: Noha Saber Shafik, Sohag University
Pseudomonas aeruginosa (PA) es un bacilo gramnegativo no fermentador aeróbico ubicuo que está ampliamente asociado con la neumonía nosocomial y puede provocar una enfermedad grave con malos resultados, en particular en personas gravemente enfermas debido a la capacidad de algunas cepas para causar daño epitelial pulmonar. lesión y diseminación a la circulación. 2 En la unidad de cuidados intensivos, la infección por PA se clasifica entre las cinco principales causas de infecciones del torrente sanguíneo, pulmonares, del sitio quirúrgico, del tracto urinario y de tejidos blandos.

Descripción general del estudio

Descripción detallada

La patogenia de las infecciones por PA es multifactorial y con frecuencia se complica por la resistencia intrínseca de la bacteria a algunos agentes antimicrobianos como las sulfonamidas, las tetraciclinas y la trimetoprima, así como por su capacidad para adquirir o desarrollar rápidamente resistencia a las principales clases de antibióticos como los aminoglucósidos. , quinolonas, betalactámicos y polimixinas (Bassetti et al., 2018).

Los sistemas de eflujo, que median la expulsión de los antibióticos fuera de la célula poco después de su entrada, la producción de enzimas para inactivar los antibióticos y la disminución de la permeabilidad a través de la pared celular son algunos de los mecanismos utilizados por la AP para desarrollar resistencia a los antimicrobianos (Meletis & Bagkeri, 2013).

PA posee una gran cantidad de factores de virulencia que juegan un papel importante en la patogénesis y la determinación de la gravedad de la infección. Estos factores de virulencia actúan solos o en sinergia entre sí para causar daño tisular, necrosis y muerte celular. Entre los factores de virulencia de PA, los principales determinantes de la virulencia son el sistema de secreción de tipo III (T3SS) y la detección de quórum (sistema de señalización de célula a célula). El T3SS es un complejo similar a una aguja, también conocido como inyectosoma, que permite que una bacteria entregue diferentes proteínas efectoras como ExoS, ExoT, ExoU y ExoY a través de la membrana en una célula huésped, alterando las funciones de la célula huésped y aumentando la supervivencia bacteriana. tasas (Horna G y, Ruiz J, 2021). En este estudio, nuestro objetivo fue evaluar la prevalencia de la resistencia a los antibióticos causada por la presencia de genes Efflux y algunos factores de virulencia en Pseudomonas aeruginosa de aislamientos clínicos.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Anticipado)

75

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

Copia de seguridad de contactos de estudio

Ubicaciones de estudio

      • Sohag, Egipto
        • Reclutamiento
        • Sohag University
        • Contacto:
        • Contacto:
          • Nesma A Mohamed, Lecturer

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

4 semanas a 80 años (Niño, Adulto, Adulto Mayor)

Acepta Voluntarios Saludables

No

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

Este estudio se realizará a todos los pacientes que padezcan infecciones que puedan ser causadas por pseudomonas aeruginosa.

Se recogerán muestras (pus, orina, sangre, esputo, secreción del oído) de diferentes departamentos del hospital universitario de sohag.

Los Datos Clínicos se obtendrán como:

- Datos sobre manifestaciones clínicas que incluyen fiebre, expectoración, pus de heridas, síntomas urinarios, síntomas de infecciones del tracto respiratorio superior y síntomas de otitis externa.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Todos los pacientes que padezcan infecciones que puedan ser causadas por pseudomonas aeruginosa

Criterio de exclusión:

  • Muestras diagnosticadas con organismos distintos de pseudomonas aeruginosa.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Modelos observacionales: Control de caso
  • Perspectivas temporales: Transversal

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
Pacientes con infecciones por pseudomonas aeruginosa

Todos los pacientes padecen infecciones que pueden ser causadas por pseudomonas aeruginosa.

Los Datos Clínicos se obtendrán como:

  • Datos sobre manifestaciones clínicas que incluyen fiebre, expectoración, pus de heridas, síntomas urinarios, síntomas de infecciones del tracto respiratorio superior y síntomas de otitis externa.
  • Las muestras se cultivarán en agar cetrimida.
  • Las pruebas de sensibilidad a los antibióticos se realizarán mediante el método de difusión en disco según el CLSI.
  • Detección molecular de genes de eflujo y algunos genes de virulencia por PCR.
Las muestras se inocularán en agar cetrimida mediante la técnica de cultivo en placa.
las colonias en agar cetrimida se extenderán sobre un portaobjetos de vidrio y se teñirán con tinción de Gram
Las pruebas de sensibilidad a los antibióticos se realizarán mediante el método de difusión en disco según CLSI
Detección molecular de genes de eflujo y algunos genes de virulencia mediante PCR convencional
Pacientes con infecciones distintas de pseudomonas aeruginosa
  • Datos sobre manifestaciones clínicas que incluyen fiebre, expectoración, pus de heridas, síntomas urinarios, síntomas de infecciones del tracto respiratorio superior y síntomas de otitis externa.
  • Las muestras serán cultivadas en diferentes medios de cultivo e identificación automatizada por el sistema Vitek.
Las muestras se inocularán en agar cetrimida mediante la técnica de cultivo en placa.
las colonias en agar cetrimida se extenderán sobre un portaobjetos de vidrio y se teñirán con tinción de Gram
Las pruebas de sensibilidad a los antibióticos se realizarán mediante el método de difusión en disco según CLSI

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Aislamiento e identificación de pseudomonas aeruginosa mediante cultivo y técnicas de sistemas automatizados
Periodo de tiempo: 1 diciembre 2022 a 1 febrero 2023
identificación de pseudomonas aeruginosa en diferentes muestras clínicas recolectadas del hospital de la Universidad de Sohag usando diferentes técnicas de laboratorio como cultivo en agar citramida, tinción con Gram, reacciones bioquímicas como la prueba de oxidasa, prueba de fermentación de azúcar e identificación automatizada usando el sistema vitek2
1 diciembre 2022 a 1 febrero 2023
Identificación de un patrón reciente de sensibilidad a los antibióticos mediante el método de difusión en disco de Kerby modificado
Periodo de tiempo: 1 diciembre 2022 a 1 febrero 2023
Determinación del patrón reciente de sensibilidad antibiótica utilizando diferentes antibióticos por el método de difusión en disco esparciendo el inóculo en placa de pitry que contiene Muller Hinton Agar, luego se colocan diferentes discos que contienen antibióticos a una distancia de 1.5 cm, luego se incuban a 37 co por 24 hrs. Se mide el diámetro de la zona de inhibición para determinar la CIM de cada antibiótico según las directrices de CSLI 2022.
1 diciembre 2022 a 1 febrero 2023
Identificación molecular de algunos factores de virulencia y genes de eflujo mediante PCR
Periodo de tiempo: 1 de febrero de 2023 al 30 de marzo de 2023
Detección molecular de algunos factores de virulencia y genes de eflujo utilizando cebadores específicos mediante PCR convencional. Se usarán cebadores de los siguientes genes como exoS,exoU, toxA, mex A, mex B. Primero se realizará la extracción de ADN, seguida de la técnica de amplificación usando el termociclador. La detección del ADN amplificado se realizará mediante electroforesis en gel Agrose teñido con bromuro de etidio.
1 de febrero de 2023 al 30 de marzo de 2023

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Patrocinador

Investigadores

  • Silla de estudio: Mohamed H Alrawy, Faculty of medicine, Sohag university
  • Silla de estudio: Ebtisam M Gad, Faculty of medicine, Sohag university

Publicaciones y enlaces útiles

La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.

Enlaces Útiles

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

1 de diciembre de 2022

Finalización primaria (Actual)

30 de marzo de 2023

Finalización del estudio (Anticipado)

1 de mayo de 2023

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

19 de noviembre de 2022

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

29 de noviembre de 2022

Publicado por primera vez (Actual)

8 de diciembre de 2022

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

12 de abril de 2023

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

11 de abril de 2023

Última verificación

1 de abril de 2023

Más información

Términos relacionados con este estudio

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

NO

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

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