Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Molekylär detektion av gener för effluxpump och virulensfaktorer i Pseudomonas Aeruginosa (Pseudomonas)

11 april 2023 uppdaterad av: Noha Saber Shafik, Sohag University
Pseudomonas aeruginosa (PA) är en allestädes närvarande aerob, icke-fermentativ gramnegativ stav som är allmänt förknippad med nosokomial lunginflammation och kan leda till allvarlig sjukdom med dåliga resultat, särskilt hos kritiskt sjuka personer på grund av förmågan hos vissa stammar att orsaka lungepitel. skada och spridning ut i cirkulationen. 2 På intensivvårdsavdelningen rankas PA-infektion bland de fem främsta orsakerna till blodomlopps-, lung-, operations-, urinvägs- och mjukdelsinfektioner.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljerad beskrivning

Patogenesen av PA-infektioner är multifaktoriell, och den kompliceras ofta av bakteriens inneboende resistens mot vissa antimikrobiella medel såsom sulfonamider, tetracykliner och trimetoprim, såväl som dess förmåga att förvärva eller snabbt utveckla resistens mot större klasser av antibiotika såsom aminoglykosider , kinoloner, B-laktamer och polymyxiner (Bassetti et al., 2018).

Utflödessystemen, som förmedlar utstötningen av antibiotika ur cellen kort efter inträdet, produktionen av enzymer för att inaktivera antibiotika och minskningen av permeabiliteten över cellväggen är några mekanismer som PA använder för att utveckla antimikrobiell resistens (Meletis & Bagkeri, 2013).

PA besitter ett stort antal virulensfaktorer som spelar en betydande roll vid patogenes och bestämning av infektionens svårighetsgrad. Dessa virulensfaktorer verkar ensamma eller i synergi med varandra för att orsaka vävnadsskada, nekros och celldöd. Bland virulensfaktorerna för PA är de viktigaste bestämningsfaktorerna för virulens typ III-sekretionssystemet (T3SS) och kvorumavkänning (cell-till-cell-signaleringssystem). T3SS är ett nålliknande komplex, även känt som injektisomet, som gör det möjligt för en bakterie att leverera olika effektorproteiner såsom ExoS, ExoT, ExoU och ExoY över membranet in i en värdcell, vilket förändrar värdcellernas funktioner och ökar bakteriell överlevnad priser (Horna G och Ruiz J, 2021). I denna studie syftade vi till att utvärdera prevalensen av antibiotikaresistens orsakad av närvaron av Efflux-gener och vissa virulensfaktorer i Pseudomonas aeruginosa från kliniska isolat.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Förväntat)

75

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studera Kontakt Backup

Studieorter

  • Egypten
      • Sohag, Egypten
        • Rekrytering
        • Sohag University
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Nesma A Mohamed, Lecturer

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

4 veckor till 80 år (Barn, Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Nej

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Denna studie kommer att genomföras på alla patienter som lider av infektioner som kan orsakas av pseudomonas aeruginosa.

Prover (pus, urin, blod, sputum, flytningar från öronen) kommer att samlas in från olika avdelningar på sohag universitetssjukhus.

Kliniska data kommer att erhållas som:

- Data om kliniska manifestationer inklusive feber, UPPHOSTNING, pus från sår, urinvägssymtom, symtom på övre luftvägsinfektioner och symtom på otitis externa.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Alla patienter som lider av infektioner som kan orsakas av pseudomonas aeruginosa

Exklusions kriterier:

  • Prover diagnostiserade att ha andra organismer än pseudomonas aeruginosa.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Observationsmodeller: Case-Control
  • Tidsperspektiv: Tvärsnitt

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Patienter med pseudomonas aeruginosa-infektioner

Alla patienter lider av infektioner som kan orsakas av pseudomonas aeruginosa.

Kliniska data kommer att erhållas som:

  • Data om kliniska manifestationer inklusive feber, UPPHOSTNING, pus från sår, urinvägssymtom, symtom på övre luftvägsinfektioner och symtom på otitis externa.
  • Proverna kommer att odlas på cetrimidagar.
  • Antibiotikakänslighetstestning kommer att göras med diskdiffusionsmetod enligt CLSI.
  • Molekylär detektion av effluxgener och vissa virulensgener genom PCR.
Diagnostiskt test: kultur på cetrimidagar
Prover kommer att inokuleras på cetrimidagar med användning av utplätering.
Diagnostiskt test: Färgning med Gram bets
kolonier på cetrimidagar kommer att spridas på objektglas och färgas med gramfärgning
Diagnostiskt test: Antibiotikakänslighetstestning
Antibiotikakänslighetstestning kommer att göras med diskdiffusionsmetod enligt CLSI
Diagnostiskt test: Molekylär detektion av effluxgener och vissa virulensgener
Molekylär detektion av effluxgener och vissa virulensgener genom konventionell PCR
Patienter med andra infektioner än pseudomonas aeruginosa
  • Data om kliniska manifestationer inklusive feber, UPPHOSTNING, pus från sår, urinvägssymtom, symtom på övre luftvägsinfektioner och symtom på otitis externa.
  • Prover kommer att odlas på olika odlingsmedier och automatiserad identifiering av Vitek-systemet.
Diagnostiskt test: kultur på cetrimidagar
Prover kommer att inokuleras på cetrimidagar med användning av utplätering.
Diagnostiskt test: Färgning med Gram bets
kolonier på cetrimidagar kommer att spridas på objektglas och färgas med gramfärgning
Diagnostiskt test: Antibiotikakänslighetstestning
Antibiotikakänslighetstestning kommer att göras med diskdiffusionsmetod enligt CLSI

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Isolering och identifiering av pseudomonas aeruginosa med hjälp av odling och automatiserade systemtekniker
Tidsram: 1 december 2022 till 1 februari 2023
identifiering av pseudomonas aeruginosa i olika kliniska prover som samlats in från universitetssjukhuset i Sohag med olika laboratorietekniker som odling på citramidagar, färgning med gram, biokemiska reaktioner som oxidastest, sockerfermenteringstest och automatiserad identifiering med hjälp av vitek2-systemet
1 december 2022 till 1 februari 2023
Identifiering av senaste antibiotikakänslighetsmönster med Modified Kerby-Disc Diffusion-metoden
Tidsram: 1 december 2022 till 1 februari 2023
Bestämning av nya antibiotikakänslighetsmönster med användning av olika antibiotika genom diskdiffusionsmetod genom att sprida inokulumet i pitryskål innehållande Muller Hinton Agar, sedan placeras olika skivor innehållande antibiotika på ett avstånd av 1,5 cm och inkuberas sedan vid 37 co i 24 timmar. Diametern på hämningszonen mäts för att bestämma MIC för varje antibiotikum enligt riktlinjerna i CSLI 2022.
1 december 2022 till 1 februari 2023
Molekylär identifiering av vissa virulensfaktorer och effluxgener med PCR
Tidsram: 1 februari 2023 till 30 mars 2023
Molekylär detektion av vissa virulensfaktorer och effluxgener med användning av specifika primrar med konventionell PCR. primers av följande gener kommer att användas som exoS, exoU, toxA, mex A, mex B. Extraktion av DNA kommer att göras först, följt av amplifieringsteknik med användning av termisk cykler. Detektion av amplifierat DNA kommer att göras med hjälp av Agrose gelelektrofores färgad med etidiumbromid.
1 februari 2023 till 30 mars 2023

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Sohag University

Utredare

  • Studiestol: Mohamed H Alrawy, Faculty of medicine, Sohag university
  • Studiestol: Ebtisam M Gad, Faculty of medicine, Sohag university

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Användbara länkar

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

1 december 2022

Primärt slutförande (Faktisk)

30 mars 2023

Avslutad studie (Förväntat)

1 maj 2023

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

19 november 2022

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

29 november 2022

Första postat (Faktisk)

8 december 2022

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

12 april 2023

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

11 april 2023

Senast verifierad

1 april 2023

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Nyckelord

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • Soh-Med-22-11-18

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

NEJ

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera