铜绿假单胞菌外排泵和毒力因子基因的分子检测 (Pseudomonas)
研究概览
详细说明
PA 感染的发病机制是多因素的，细菌对磺胺类、四环素类和甲氧苄氨嘧啶等抗菌药物的内在耐药性，以及对氨基糖苷类等主要抗生素类抗生素的耐药性或快速产生耐药性的能力，往往使病程复杂化、喹诺酮类、β-内酰胺类和多粘菌素（Bassetti 等人，2018 年）。
外排系统介导抗生素在进入细胞后不久被排出体外，酶的产生使抗生素失活，以及细胞壁渗透性的降低是 PA 用来产生抗菌素耐药性的一些机制（Meletis & Bagkeri， 2013）。
PA 具有大量毒力因子，在发病机制和感染严重程度的确定中起着重要作用。 这些毒力因子单独或协同作用引起组织损伤、坏死和细胞死亡。 在 PA 的毒力因子中，毒力的主要决定因素是 III 型分泌系统 (T3SS) 和群体感应（细胞间信号系统）。 T3SS 是一种针状复合物，也称为注射体，它使细菌能够将不同的效应蛋白（如 ExoS、ExoT、ExoU 和 ExoY）跨膜递送到宿主细胞中，从而改变宿主细胞功能并提高细菌存活率率（Horna G 和 Ruiz J，2021 年）。 在这项研究中，我们的目的是评估临床分离的铜绿假单胞菌中外排基因和一些毒力因子的存在引起的抗生素耐药性的流行。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名：Noha S Shafik, lecturer
- 电话号码：+20 01067261504
- 邮箱：Nohasaber@med.sohag.edu.eg
研究联系人备份
- 姓名：Nesma A Mohammed, lecturer
- 电话号码：+20 01006780725
- 邮箱：Nesmaaateef@med.sohag.edu.eg
学习地点
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Sohag、埃及
- 招聘中
- Sohag University
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接触：
- Noha S Shafik, Lecturer
- 电话号码：01067261504
- 邮箱：nohasaber@med.sohag.edu.eg
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接触：
- Nesma A Mohamed, Lecturer
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
这项研究将在所有患有可能由铜绿假单胞菌引起的感染的患者中进行。
样本（脓液、尿液、血液、痰液、耳分泌物）将从 sohag 大学医院的不同部门采集。
将获得临床数据：
- 有关临床表现的数据，包括发烧、咳痰、伤口流脓、泌尿系统症状、上呼吸道感染症状和外耳炎症状。
描述
纳入标准：
- 所有患有可能由铜绿假单胞菌引起的感染的患者
排除标准：
- 样本被诊断出含有除铜绿假单胞菌以外的其他生物体。
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
- 观测模型：病例对照
- 时间观点：横截面
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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铜绿假单胞菌感染患者
所有患者都患有可能由铜绿假单胞菌引起的感染。 将获得临床数据：
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使用铺板技术将样品接种在西曲亚胺琼脂上。
将西曲胺琼脂上的菌落铺在载玻片上并用革兰氏染色剂染色
根据 CLSI，将通过纸片扩散法进行抗生素敏感性测试
常规PCR对外排基因和部分毒力基因的分子检测
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铜绿假单胞菌以外的感染患者
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使用铺板技术将样品接种在西曲亚胺琼脂上。
将西曲胺琼脂上的菌落铺在载玻片上并用革兰氏染色剂染色
根据 CLSI，将通过纸片扩散法进行抗生素敏感性测试
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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使用培养和自动化系统技术分离和鉴定铜绿假单胞菌
大体时间：2022年12月1日至2023年2月1日
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使用不同的实验室技术鉴定从 Sohag 大学医院收集的不同临床样本中的铜绿假单胞菌，如柠檬酰胺琼脂培养、革兰氏染色、氧化酶测试、糖发酵测试等生化反应，以及使用 vitek2 系统的自动识别
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2022年12月1日至2023年2月1日
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使用改进的 Kerby 圆盘扩散法鉴定最近的抗生素敏感性模式
大体时间：2022年12月1日至2023年2月1日
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通过圆盘扩散法确定最近使用不同抗生素的抗生素敏感性模式，通过将接种物散布在含有 Muller Hinton 琼脂的果核培养皿中，然后将含有抗生素的不同圆盘以 1.5 cm 的距离放置，然后在 37 co 下孵育 24 小时。
根据 CSLI 2022 的指南，测量抑菌圈的直径以确定每种抗生素的 MIC。
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2022年12月1日至2023年2月1日
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使用 PCR 对一些毒力因子和流出基因进行分子鉴定
大体时间：2023年2月1日至2023年3月30日
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通过常规 PCR 使用特异性引物对某些毒力因子和流出基因进行分子检测。
以下基因的引物将用作 exoS、exoU、toxA、mex A、mex B。首先提取 DNA，然后使用热循环仪进行扩增技术。
使用用溴化乙锭染色的琼脂糖凝胶电泳检测扩增的 DNA。
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2023年2月1日至2023年3月30日
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合作者和调查者
调查人员
- 学习椅：Mohamed H Alrawy、Faculty of medicine, Sohag university
- 学习椅：Ebtisam M Gad、Faculty of medicine, Sohag university
出版物和有用的链接
有用的网址
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (实际的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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