Molekylær påvisning av gener for effluxpumpe og virulensfaktorer i Pseudomonas Aeruginosa (Pseudomonas)
Studieoversikt
Status
Forhold
Detaljert beskrivelse
Patogenesen av PA-infeksjoner er multifaktoriell, og den kompliseres ofte av bakterienes iboende resistens mot noen antimikrobielle midler som sulfonamider, tetracykliner og trimetoprim, samt dens evne til å erverve eller raskt utvikle resistens mot store klasser av antibiotika som aminoglykosider , kinoloner, B-laktamer og polymyxiner (Bassetti et al., 2018).
Utstrømningssystemene, som medierer utdrivelsen av antibiotika ut av cellen kort tid etter inntreden, produksjonen av enzymer for å inaktivere antibiotika, og reduksjonen i permeabilitet over celleveggen er noen mekanismer som brukes av PA for å utvikle antimikrobiell resistens (Meletis & Bagkeri, 2013).
PA har et stort antall virulensfaktorer som spiller en betydelig rolle i patogenesen og bestemmelsen av infeksjonens alvorlighetsgrad. Disse virulensfaktorene virker alene eller i synergi med hverandre for å forårsake vevsskade, nekrose og celledød. Blant virulensfaktorene til PA er de viktigste determinantene for virulens type III sekresjonssystem (T3SS) og quorum sensing (celle-til-celle signalsystem). T3SS er et nållignende kompleks, også kjent som injektisomet, som gjør det mulig for en bakterie å levere forskjellige effektorproteiner som ExoS, ExoT, ExoU og ExoY over membranen inn i en vertscelle, endre vertscellefunksjoner og øke bakteriell overlevelse priser (Horna G og Ruiz J, 2021). I denne studien hadde vi som mål å evaluere prevalensen av antibiotikaresistens forårsaket av tilstedeværelsen av Efflux-gener og noen virulensfaktorer i Pseudomonas aeruginosa fra kliniske isolater.
Studietype
Registrering (Forventet)
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Noha S Shafik, lecturer
- Telefonnummer: +20 01067261504
- E-post: Nohasaber@med.sohag.edu.eg
Studer Kontakt Backup
- Navn: Nesma A Mohammed, lecturer
- Telefonnummer: +20 01006780725
- E-post: Nesmaaateef@med.sohag.edu.eg
Studiesteder
-
-
-
Sohag, Egypt
- Rekruttering
- Sohag University
-
Ta kontakt med:
- Noha S Shafik, Lecturer
- Telefonnummer: 01067261504
- E-post: nohasaber@med.sohag.edu.eg
-
Ta kontakt med:
- Nesma A Mohamed, Lecturer
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Denne studien vil bli utført på alle pasienter som lider av infeksjoner som kan være forårsaket av pseudomonas aeruginosa.
Prøver (puss, urin, blod, oppspytt, øreutslipp) vil bli samlet inn fra ulike avdelinger ved Sohag universitetssykehus.
Kliniske data vil bli innhentet som:
- Data om kliniske manifestasjoner inkludert feber, ekspektorasjon, puss fra sår, urinveissymptomer, symptomer på øvre luftveisinfeksjoner og symptomer på otitis externa.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Alle pasienter som lider av infeksjoner som kan være forårsaket av pseudomonas aeruginosa
Ekskluderingskriterier:
- Prøver diagnostisert å ha andre organismer enn pseudomonas aeruginosa.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Case-Control
- Tidsperspektiver: Tverrsnitt
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Pasienter med pseudomonas aeruginosa-infeksjoner
Alle pasienter lider av infeksjoner som kan være forårsaket av pseudomonas aeruginosa. Kliniske data vil bli innhentet som:
|
Prøver vil bli inokulert på cetrimidagar ved bruk av utplatingsteknikken.
kolonier på cetrimidagar vil bli spredt på glassplate og farget med gramfarging
Antibiotikasensitivitetstesting vil bli utført ved diskdiffusjonsmetode i henhold til CLSI
Molekylær deteksjon til effluksgener og noen virulensgener ved konvensjonell PCR
|
|
Pasienter med andre infeksjoner enn pseudomonas aeruginosa
|
Prøver vil bli inokulert på cetrimidagar ved bruk av utplatingsteknikken.
kolonier på cetrimidagar vil bli spredt på glassplate og farget med gramfarging
Antibiotikasensitivitetstesting vil bli utført ved diskdiffusjonsmetode i henhold til CLSI
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Isolering og identifikasjon av pseudomonas aeruginosa ved bruk av kultur og automatiserte systemteknikker
Tidsramme: 1. desember 2022 til 1. februar 2023
|
identifikasjon av pseudomonas aeruginosa i forskjellige kliniske prøver samlet fra Sohag universitetssykehus ved bruk av forskjellige laboratorieteknikker som kultur på citramidagar, farging med gram, biokjemiske reaksjoner som oksidasetest, sukkerfermenteringstest og automatisert identifikasjon ved bruk av vitek2-systemet
|
1. desember 2022 til 1. februar 2023
|
|
Identifisering av nylig antibiotikafølsomhetsmønster ved bruk av Modified Kerby -Disc Diffusion-metoden
Tidsramme: 1. desember 2022 til 1. februar 2023
|
Bestemmelse av nyere antibiotikafølsomhetsmønster ved bruk av forskjellige antibiotika ved diskdiffusjonsmetode ved å spre inokulumet i pitryskål som inneholder Muller Hinton Agar, deretter plasseres forskjellige plater som inneholder antibiotika i en avstand på 1,5 cm, og inkuberes deretter ved 37 co i 24 timer.
Diameteren til hemmingssonen måles for å bestemme MIC for hvert antibiotikum i henhold til retningslinjene i CSLI 2022.
|
1. desember 2022 til 1. februar 2023
|
|
Molekylær identifikasjon av noen virulensfaktorer og effluksgener ved bruk av PCR
Tidsramme: 1. februar 2023 til 30. mars 2023
|
Molekylær påvisning av noen virulensfaktorer og effluksgener ved bruk av spesifikke primere ved konvensjonell PCR.
primere av følgende gener vil bli brukt som exoS, exoU, toxA, mex A, mex B. Ekstraksjon av DNA vil bli gjort først, etterfulgt av amplifikasjonsteknikk ved bruk av termisk syklus.
Påvisning av amplifisert DNA vil bli gjort ved bruk av Agrose gelelektroforese farget med etidiumbromid.
|
1. februar 2023 til 30. mars 2023
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Etterforskere
- Studiestol: Mohamed H Alrawy, Faculty of medicine, Sohag university
- Studiestol: Ebtisam M Gad, Faculty of medicine, Sohag university
Publikasjoner og nyttige lenker
Hjelpsomme linker
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- Soh-Med-22-11-18
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .