Détection moléculaire des gènes de la pompe à efflux et des facteurs de virulence chez Pseudomonas Aeruginosa (Pseudomonas)
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
La pathogenèse des infections à PA est multifactorielle et elle est souvent compliquée par la résistance intrinsèque de la bactérie à certains agents antimicrobiens tels que les sulfamides, les tétracyclines et le triméthoprime, ainsi que par sa capacité à acquérir ou à développer rapidement une résistance aux principales classes d'antibiotiques tels que les aminoglycosides. , quinolones, B-lactamines et polymyxines (Bassetti et al., 2018).
Les systèmes d'efflux, qui interviennent dans l'expulsion des antibiotiques hors de la cellule peu après leur entrée, la production d'enzymes pour inactiver les antibiotiques et la diminution de la perméabilité à travers la paroi cellulaire sont des mécanismes utilisés par l'AP pour développer une résistance antimicrobienne (Meletis & Bagkeri, 2013).
PA possède un grand nombre de facteurs de virulence qui jouent un rôle important dans la pathogenèse et la détermination de la gravité de l'infection. Ces facteurs de virulence agissent seuls ou en synergie les uns avec les autres pour provoquer des lésions tissulaires, une nécrose et la mort cellulaire. Parmi les facteurs de virulence de l'AP, les principaux déterminants de la virulence sont le système de sécrétion de type III (T3SS) et le quorum sensing (système de signalisation cellule à cellule). Le T3SS est un complexe en forme d'aiguille, également connu sous le nom d'injectisome, qui permet à une bactérie de délivrer différentes protéines effectrices telles que ExoS, ExoT, ExoU et ExoY à travers la membrane dans une cellule hôte, modifiant les fonctions de la cellule hôte et augmentant la survie bactérienne. taux ( Horna G et, Ruiz J, 2021). Dans cette étude, nous avons cherché à évaluer la prévalence de la résistance aux antibiotiques causée par la présence de gènes Efflux et de certains facteurs de virulence chez Pseudomonas aeruginosa à partir d'isolats cliniques.
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Noha S Shafik, lecturer
- Numéro de téléphone: +20 01067261504
- E-mail: Nohasaber@med.sohag.edu.eg
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: Nesma A Mohammed, lecturer
- Numéro de téléphone: +20 01006780725
- E-mail: Nesmaaateef@med.sohag.edu.eg
Lieux d'étude
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Sohag, Egypte
- Recrutement
- Sohag University
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Contact:
- Noha S Shafik, Lecturer
- Numéro de téléphone: 01067261504
- E-mail: nohasaber@med.sohag.edu.eg
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Contact:
- Nesma A Mohamed, Lecturer
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Cette étude sera réalisée sur tous les patients souffrant d'infections pouvant être causées par le pseudomonas aeruginosa.
Des prélèvements (pus, urine, sang, crachats, écoulement auriculaire) seront prélevés dans différents services du CHU sohag.
Les données cliniques seront obtenues sous la forme :
- Données sur les manifestations cliniques, y compris la fièvre, l'expectoration, le pus des plaies, les symptômes urinaires, les symptômes d'infections des voies respiratoires supérieures et les symptômes d'otite externe.
La description
Critère d'intégration:
- Tous les patients souffrant d'infections pouvant être causées par le pseudomonas aeruginosa
Critère d'exclusion:
- Échantillons diagnostiqués comme porteurs d'organismes autres que Pseudomonas aeruginosa.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cas-témoins
- Perspectives temporelles: Transversale
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Patients atteints d'infections à pseudomonas aeruginosa
Tous les patients souffrent d'infections qui peuvent être causées par le pseudomonas aeruginosa. Les données cliniques seront obtenues sous la forme :
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Les échantillons seront ensemencés sur de la gélose au cétrimide en utilisant la technique d'étalement.
les colonies sur gélose au cétrimide seront étalées sur une lame de verre et colorées par une coloration de Gram
Les tests de sensibilité aux antibiotiques seront effectués par la méthode de diffusion sur disque conformément au CLSI
Détection moléculaire des gènes d'efflux et de certains gènes de virulence par PCR conventionnelle
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Patients atteints d'infections autres que pseudomonas aeruginosa
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Les échantillons seront ensemencés sur de la gélose au cétrimide en utilisant la technique d'étalement.
les colonies sur gélose au cétrimide seront étalées sur une lame de verre et colorées par une coloration de Gram
Les tests de sensibilité aux antibiotiques seront effectués par la méthode de diffusion sur disque conformément au CLSI
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Isolement et identification de pseudomonas aeruginosa à l'aide de techniques de culture et de systèmes automatisés
Délai: 1er décembre 2022 au 1er février 2023
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identification de pseudomonas aeruginosa dans différents échantillons cliniques prélevés à l'hôpital universitaire Sohag à l'aide de différentes techniques de laboratoire telles que la culture sur gélose citramide, la coloration au Gram, les réactions biochimiques telles que le test Oxidase, le test de fermentation du sucre et l'identification automatisée à l'aide du système vitek2
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1er décembre 2022 au 1er février 2023
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Identification du schéma récent de sensibilité aux antibiotiques à l'aide de la méthode de diffusion Kerby -Disc modifiée
Délai: 1er décembre 2022 au 1er février 2023
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Détermination du schéma récent de sensibilité aux antibiotiques à l'aide de différents antibiotiques par méthode de diffusion sur disque en étalant l'inoculum dans une boîte pitry contenant de la gélose Muller Hinton, puis différents disques contenant des antibiotiques sont placés à une distance de 1,5 cm, puis incubés à 37 co pendant 24 heures.
Le diamètre de la zone d'inhibition est mesuré pour déterminer la CMI de chaque antibiotique selon les directives du CSLI 2022.
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1er décembre 2022 au 1er février 2023
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Identification moléculaire de certains facteurs de virulence et gènes d'efflux par PCR
Délai: 1 février 2023 au 30 mars 2023
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Détection moléculaire de certains facteurs de virulence et gènes d'efflux à l'aide d'amorces spécifiques par PCR conventionnelle.
les amorces des gènes suivants seront utilisées comme exoS, exoU, toxA, mex A, mex B. L'extraction de l'ADN sera effectuée en premier, suivie d'une technique d'amplification à l'aide du cycleur thermique.
La détection de l'ADN amplifié se fera par électrophorèse sur gel d'Agrose coloré au bromure d'éthidium.
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1 février 2023 au 30 mars 2023
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chaise d'étude: Mohamed H Alrawy, Faculty of medicine, Sohag university
- Chaise d'étude: Ebtisam M Gad, Faculty of medicine, Sohag university
Publications et liens utiles
Liens utiles
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Anticipé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- Soh-Med-22-11-18
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
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