Moleculaire detectie van effluxpomp- en virulentiefactorengenen in Pseudomonas Aeruginosa (Pseudomonas)
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Gedetailleerde beschrijving
De pathogenese van PA-infecties is multifactorieel en wordt vaak gecompliceerd door de intrinsieke resistentie van de bacterie tegen sommige antimicrobiële middelen zoals sulfonamiden, tetracyclines en trimethoprim, evenals het vermogen om resistentie te verwerven of snel te ontwikkelen tegen belangrijke klassen antibiotica zoals aminoglycosiden , chinolonen, B-lactamen en polymyxinen (Bassetti et al., 2018).
De effluxsystemen, die zorgen voor de uitdrijving van antibiotica uit de cel kort na binnenkomst, de productie van enzymen om antibiotica te inactiveren en de afname van de doorlaatbaarheid door de celwand zijn enkele mechanismen die door PA worden gebruikt om antimicrobiële resistentie te ontwikkelen (Meletis & Bagkeri, 2013).
PA bezit een groot aantal virulentiefactoren die een belangrijke rol spelen bij de pathogenese en het bepalen van de ernst van de infectie. Deze virulentiefactoren werken alleen of in synergie met elkaar en veroorzaken weefselbeschadiging, necrose en celdood. Onder de virulentiefactoren van PA zijn de belangrijkste determinanten van virulentie het type III secretiesysteem (T3SS) en quorum sensing (cel-naar-cel signaleringssysteem). De T3SS is een naaldachtig complex, ook wel het injectisome genoemd, dat een bacterie in staat stelt om verschillende effectoreiwitten zoals ExoS, ExoT, ExoU en ExoY door het membraan in een gastheercel te brengen, waardoor de functies van de gastheercel veranderen en de overleving van bacteriën toeneemt tarieven (Horna G en, Ruiz J, 2021). In deze studie wilden we de prevalentie van antibioticaresistentie evalueren die wordt veroorzaakt door de aanwezigheid van Efflux-genen en enkele virulentiefactoren in Pseudomonas aeruginosa van klinische isolaten.
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Noha S Shafik, lecturer
- Telefoonnummer: +20 01067261504
- E-mail: Nohasaber@med.sohag.edu.eg
Studie Contact Back-up
- Naam: Nesma A Mohammed, lecturer
- Telefoonnummer: +20 01006780725
- E-mail: Nesmaaateef@med.sohag.edu.eg
Studie Locaties
-
-
-
Sohag, Egypte
- Werving
- Sohag University
-
Contact:
- Noha S Shafik, Lecturer
- Telefoonnummer: 01067261504
- E-mail: nohasaber@med.sohag.edu.eg
-
Contact:
- Nesma A Mohamed, Lecturer
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Deze studie zal worden uitgevoerd bij alle patiënten die lijden aan infecties die kunnen worden veroorzaakt door pseudomonas aeruginosa.
Monsters (pus, urine, bloed, sputum, oorafscheiding) zullen worden verzameld op verschillende afdelingen van het universitair ziekenhuis van Sohag.
Klinische gegevens worden verkregen als:
- Gegevens over klinische verschijnselen, waaronder koorts, slijm, pus uit wonden, plassymptomen, symptomen van infecties van de bovenste luchtwegen en symptomen van otitis externa.
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Alle patiënten die lijden aan infecties die kunnen worden veroorzaakt door pseudomonas aeruginosa
Uitsluitingscriteria:
- Monsters met de diagnose andere organismen dan Pseudomonas aeruginosa.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-control
- Tijdsperspectieven: Dwarsdoorsnede
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Patiënten met pseudomonas aeruginosa-infecties
Alle patiënten lijden aan infecties die kunnen worden veroorzaakt door pseudomonas aeruginosa. Klinische gegevens worden verkregen als:
|
Monsters worden geïnoculeerd op cettrimide-agar met behulp van de uitplaattechniek.
kolonies op cetrimide-agar worden uitgespreid op een glasplaatje en gekleurd met gramkleuring
Testen op gevoeligheid voor antibiotica zullen worden uitgevoerd met behulp van de schijfdiffusiemethode volgens CLSI
Moleculaire detectie om genen en sommige virulentiegenen uit te vloeien door middel van conventionele PCR
|
|
Patiënten met andere infecties dan pseudomonas aeruginosa
|
Monsters worden geïnoculeerd op cettrimide-agar met behulp van de uitplaattechniek.
kolonies op cetrimide-agar worden uitgespreid op een glasplaatje en gekleurd met gramkleuring
Testen op gevoeligheid voor antibiotica zullen worden uitgevoerd met behulp van de schijfdiffusiemethode volgens CLSI
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Isolatie en identificatie van pseudomonas aeruginosa met behulp van kweek- en geautomatiseerde systeemtechnieken
Tijdsspanne: 1 december 2022 tot 1 februari 2023
|
identificatie van pseudomonas aeruginosa in verschillende klinische monsters verzameld uit het Sohag University Hospital met behulp van verschillende laboratoriumtechnieken zoals kweek op citramide-agar, kleuring met Gram, biochemische reacties zoals Oxidase-test, suikerfermentatietest en geautomatiseerde identificatie met behulp van het vitek2-systeem
|
1 december 2022 tot 1 februari 2023
|
|
Identificatie van recent antibioticumgevoeligheidspatroon met behulp van Modified Kerby -Disc Diffusion-methode
Tijdsspanne: 1 december 2022 tot 1 februari 2023
|
Bepaling van recent antibioticumgevoeligheidspatroon met behulp van verschillende antibiotica door schijfdiffusiemethode door het inoculum te verspreiden in pitry-schaal met Muller Hinton-agar, vervolgens worden verschillende schijven met antibiotica op een afstand van 1,5 cm geplaatst en vervolgens gedurende 24 uur bij 37 ° C geïncubeerd.
De diameter van de remmingszone wordt gemeten om de MIC voor elk antibioticum te bepalen volgens de richtlijnen van CSLI 2022.
|
1 december 2022 tot 1 februari 2023
|
|
Moleculaire identificatie van enkele virulentiefactoren en effluxgenen met behulp van PCR
Tijdsspanne: 1 februari 2023 tot 30 maart 2023
|
Moleculaire detectie van sommige virulentiefactoren en effluxgenen met behulp van specifieke primers door middel van conventionele PCR.
primers van de volgende genen zullen worden gebruikt als exoS,exoU, toxA, mex A, mex B. Eerst zal extractie van DNA worden gedaan, gevolgd door amplificatietechniek met behulp van de thermische cycler.
Detectie van geamplificeerd DNA zal worden gedaan met behulp van Agrose-gelelektroforese gekleurd met ethidiumbromide.
|
1 februari 2023 tot 30 maart 2023
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Studie stoel: Mohamed H Alrawy, Faculty of medicine, Sohag university
- Studie stoel: Ebtisam M Gad, Faculty of medicine, Sohag university
Publicaties en nuttige links
Nuttige links
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Verwacht)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- Soh-Med-22-11-18
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .