マイクロプロテオミクスに基づく胃印環細胞癌のメカニズム
2023年8月2日 更新者:Xiangdong Cheng、Zhejiang Cancer Hospital
胃印環細胞癌 (GSRCC) は癌の分野において独特の疫学と病因を持っていますが、その発生率は低いです。
残念ながら、現在、GSRCC の予後プロテオミクスの特徴に焦点を当てた系統的な研究は不足しています。
この知識のギャップを考慮して、この研究は、信頼性があり再現性のある DIA-PCT 法を使用して、GSRCC のプロテオミクスの状況を包括的に特徴付けることを目的としています。
この研究の目的には、GSRCCの不均一性の特徴付け、分子タイピングの実行、潜在的なバイオマーカーと治療標的の同定、GSRCCの層別分析のためのリソースの提供が含まれます。
これらの目標を達成するために、研究者らは10,000人を超える胃がん患者のプールから112人のGSRCC患者のコホートを選択し、DIA-PCT法を使用してプロテオミクス分析を実施した。
この細心の注意を払ったアプローチにより、GSRCC の 4 つの新規プロテオミクス サブタイプが明らかになり、それぞれが独自の分子特性を示しました。
さらに、研究者らは、PRDX2 および DDX27 が GSRCC の予測バイオマーカーとして機能することを発見し、これらは 75 人の GSRCC 患者の独立したコホートでさらに検証されました。
さらに、研究者らはMLT-GSRCCサブグループに特に注意を払い、MLT-GSRCC患者の間に3つの異なるプロテオームクラスターを特定した。
このサブグループ内のサブタイプ 2 は最も予後が悪いことが示されました。
厳格なスクリーニングプロセスを通じて、研究者らはGSRCCの治療の潜在的な標的を決定した。
結論として、これらの発見は、研究者によるGSRCCの不均一性の理解に貢献し、将来の臨床層別化および標的治療戦略のための貴重なリソースを提供します。
調査の概要
研究の種類
観察的
入学 (推定)
300
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
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Zhejiang
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Hangzhou、Zhejiang、中国、310000
- Cancer Hospital of the University of Chinese Academy of Sciences (Zhejiang Cancer Hospital)
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参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
サンプリング方法
確率サンプル
調査対象母集団
これらの症例は印環細胞含有量が 70% を超えており、事前に化学療法または放射線療法を受けていませんでした。
説明
包含基準:
- 病理学によってGSRCCが確認された場合、GSRCCは印環細胞の割合が50%以上であると定義されます。
- 完全な医療情報を持っている患者
- 生存追跡情報を持つ患者
除外基準:
- 他の悪性腫瘍を患っている患者
- 他の病理学的要素の存在(例、神経内分泌癌および扁平上皮癌など)
- 不完全または紛失した症例情報
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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がん組織
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2 つのグループには特別な介入はありませんでした。
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正常な隣接組織
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2 つのグループには特別な介入はありませんでした。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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組織のプロテオーム
時間枠:Lc-MS/MS を使用して、サンプル中のタンパク質の種類と、正常な隣接組織と比較したサンプル中の相対量を検出しました (平均 1 か月)
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病理学的に GSRCC と診断されたサンプルは、副主治医以上の病理医 2 名による判定で印環細胞含有率が 70% 以上で、放射線療法や化学療法を受けていないサンプルとして選択されました。
腫瘍組織とペアになった nat は、腫瘍切除時に同じ患者から収集され、ホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE) に保存されました。
液体クロマトグラフィー質量分析 (LC-MS) を使用して、サンプル内のプロテオミクスを検出しました。
サンプル中のタンパク質が抽出され、サンプル中のプロテオミクスが LC-MS によって検出されました。
サンプル中のタンパク質の種類と含有量を検出するために、定性および定量分析が実行されました。
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Lc-MS/MS を使用して、サンプル中のタンパク質の種類と、正常な隣接組織と比較したサンプル中の相対量を検出しました (平均 1 か月)
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
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出版物と役立つリンク
研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。
一般刊行物
- Puccini A, Poorman K, Catalano F, Seeber A, Goldberg RM, Salem ME, Shields AF, Berger MD, Battaglin F, Tokunaga R, Naseem M, Zhang W, Philip PA, Marshall JL, Korn WM, Lenz HJ. Molecular profiling of signet-ring-cell carcinoma (SRCC) from the stomach and colon reveals potential new therapeutic targets. Oncogene. 2022 Jun;41(26):3455-3460. doi: 10.1038/s41388-022-02350-6. Epub 2022 May 26.
- Fan Y, Bai B, Liang Y, Ren Y, Liu Y, Zhou F, Lou X, Zi J, Hou G, Chen F, Zhao Q, Liu S. Proteomic Profiling of Gastric Signet Ring Cell Carcinoma Tissues Reveals Characteristic Changes of the Complement Cascade Pathway. Mol Cell Proteomics. 2021;20:100068. doi: 10.1016/j.mcpro.2021.100068. Epub 2021 Mar 3.
- Ge S, Xia X, Ding C, Zhen B, Zhou Q, Feng J, Yuan J, Chen R, Li Y, Ge Z, Ji J, Zhang L, Wang J, Li Z, Lai Y, Hu Y, Li Y, Li Y, Gao J, Chen L, Xu J, Zhang C, Jung SY, Choi JM, Jain A, Liu M, Song L, Liu W, Guo G, Gong T, Huang Y, Qiu Y, Huang W, Shi T, Zhu W, Wang Y, He F, Shen L, Qin J. A proteomic landscape of diffuse-type gastric cancer. Nat Commun. 2018 Mar 8;9(1):1012. doi: 10.1038/s41467-018-03121-2. Erratum In: Nat Commun. 2018 May 8;9(1):1850.
- Asleh K, Negri GL, Spencer Miko SE, Colborne S, Hughes CS, Wang XQ, Gao D, Gilks CB, Chia SKL, Nielsen TO, Morin GB. Proteomic analysis of archival breast cancer clinical specimens identifies biological subtypes with distinct survival outcomes. Nat Commun. 2022 Feb 16;13(1):896. doi: 10.1038/s41467-022-28524-0.
- Chen J, Liu K, Luo Y, Kang M, Wang J, Chen G, Qi J, Wu W, Wang B, Han Y, Shi L, Wang K, Han X, Ma X, Liu W, Ding Y, Wang L, Liang H, Wang L, Chen J. Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma. Gastroenterology. 2023 Jul;165(1):88-103. doi: 10.1053/j.gastro.2023.03.008. Epub 2023 Mar 14.
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2023年3月2日
一次修了 (推定)
2024年6月30日
研究の完了 (推定)
2024年7月30日
試験登録日
最初に提出
2023年7月17日
QC基準を満たした最初の提出物
2023年8月2日
最初の投稿 (実際)
2023年8月14日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2023年8月14日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2023年8月2日
最終確認日
2023年8月1日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- IRB-2023-584
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
いいえ
IPD プランの説明
この研究には薬物の臨床試験は含まれていませんが、患者情報の機密性の確保に焦点を当てています。
患者のプライバシーを保護するため、名前や年齢などの患者情報を入力する際には、実名ではなくコーディングシステムが使用されました。
各患者には、登録時に研究識別番号が割り当てられました。
研究全体を通じて、研究チームの主要な研究者のみが電子データベースから取得した患者の真の個人データ(名前や年齢など)にアクセスする権限を持ち、この情報を回覧したり共有したりすることは固く禁じられています。
研究論文の出版中に、研究チームの主な研究者はサンプルコーディングを使用して患者のプライバシー情報(名前など)を置き換え、匿名化を実現します。
また、研究参加者の個人情報の保護は研究の全過程を通じて維持されなければならず、そのような情報を流通させたり漏洩させたりすることは固く禁じられています。
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
いいえ
米国FDA規制機器製品の研究
いいえ
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。