基于微蛋白质组学的胃印戒细胞癌发生机制
2023年8月2日 更新者：Xiangdong Cheng、Zhejiang Cancer Hospital
胃印戒细胞癌（GSRCC）在癌症领域具有独特的流行病学和发病机制，但发病率较低。
不幸的是，目前缺乏针对 GSRCC 预后蛋白质组特征的系统研究。
鉴于这一知识差距，本研究旨在使用可靠且可重复的 DIA-PCT 方法全面表征 GSRCC 的蛋白质组学景观。
本研究的目标包括表征 GSRCC 的异质性、进行分子分型、识别潜在的生物标志物和治疗靶点，并为 GSRCC 的分层分析提供资源。
为了实现这些目标，研究人员从 10,000 多名胃癌患者中选择了 112 名 GSRCC 患者，并使用 DIA-PCT 方法进行了蛋白质组分析。
这种细致的方法揭示了 GSRCC 的四种新型蛋白质组亚型，每种亚型都表现出独特的分子特征。
此外，研究人员发现 PRDX2 和 DDX27 可以作为 GSRCC 的预测生物标志物，并在 75 名 GSRCC 患者的独立队列中得到进一步验证。
此外，研究人员特别关注 MLT-GSRCC 亚组，并在 MLT-GSRCC 患者中确定了三个不同的蛋白质组簇。
该亚组中的亚型 2 表现出最差的预后。
通过严格的筛选过程，研究人员确定了治疗 GSRCC 的潜在靶点。
总之，这些发现有助于研究人员了解 GSRCC 的异质性，并为未来的临床分层和针对性治疗策略提供宝贵的资源。
研究概览
研究类型
观察性的
注册 (估计的)
300
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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Zhejiang
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Hangzhou、Zhejiang、中国、310000
- Cancer Hospital of the University of Chinese Academy of Sciences (Zhejiang Cancer Hospital)
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
- 孩子
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
不
取样方法
概率样本
研究人群
这些病例的印戒细胞含量大于70%，且之前未接受过化疗或放疗
描述
纳入标准：
- 经病理学确诊的 GSRCC，其中 GSRCC 定义为印戒细胞百分比≥ 50%
- 患者拥有完整的医疗信息
- 患者生存随访信息
排除标准：
- 患有其他恶性肿瘤的患者
- 存在其他病理成分（例如神经内分泌癌和鳞状细胞癌等）
- 案件信息不完整或丢失
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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组织蛋白质组
大体时间：采用Lc-MS/MS检测样本中蛋白质的种类以及样本中与正常癌旁组织相比的相对含量，平均1个月
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经2名副主任医师以上病理医师判断印戒细胞含量>70%且既往未接受放化疗的样本，选择经病理诊断为GSRCC的样本。
在肿瘤切除时从同一患者收集肿瘤组织和配对的 nat，并保存在福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 中。
采用液相色谱-质谱法（LC-MS）检测样品中的蛋白质组学。
提取样品中的蛋白质，并通过LC-MS检测样品中的蛋白质组学。
进行定性和定量分析以检测样品中蛋白质的类型和含量。
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采用Lc-MS/MS检测样本中蛋白质的种类以及样本中与正常癌旁组织相比的相对含量，平均1个月
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Puccini A, Poorman K, Catalano F, Seeber A, Goldberg RM, Salem ME, Shields AF, Berger MD, Battaglin F, Tokunaga R, Naseem M, Zhang W, Philip PA, Marshall JL, Korn WM, Lenz HJ. Molecular profiling of signet-ring-cell carcinoma (SRCC) from the stomach and colon reveals potential new therapeutic targets. Oncogene. 2022 Jun;41(26):3455-3460. doi: 10.1038/s41388-022-02350-6. Epub 2022 May 26.
- Fan Y, Bai B, Liang Y, Ren Y, Liu Y, Zhou F, Lou X, Zi J, Hou G, Chen F, Zhao Q, Liu S. Proteomic Profiling of Gastric Signet Ring Cell Carcinoma Tissues Reveals Characteristic Changes of the Complement Cascade Pathway. Mol Cell Proteomics. 2021;20:100068. doi: 10.1016/j.mcpro.2021.100068. Epub 2021 Mar 3.
- Ge S, Xia X, Ding C, Zhen B, Zhou Q, Feng J, Yuan J, Chen R, Li Y, Ge Z, Ji J, Zhang L, Wang J, Li Z, Lai Y, Hu Y, Li Y, Li Y, Gao J, Chen L, Xu J, Zhang C, Jung SY, Choi JM, Jain A, Liu M, Song L, Liu W, Guo G, Gong T, Huang Y, Qiu Y, Huang W, Shi T, Zhu W, Wang Y, He F, Shen L, Qin J. A proteomic landscape of diffuse-type gastric cancer. Nat Commun. 2018 Mar 8;9(1):1012. doi: 10.1038/s41467-018-03121-2. Erratum In: Nat Commun. 2018 May 8;9(1):1850.
- Asleh K, Negri GL, Spencer Miko SE, Colborne S, Hughes CS, Wang XQ, Gao D, Gilks CB, Chia SKL, Nielsen TO, Morin GB. Proteomic analysis of archival breast cancer clinical specimens identifies biological subtypes with distinct survival outcomes. Nat Commun. 2022 Feb 16;13(1):896. doi: 10.1038/s41467-022-28524-0.
- Chen J, Liu K, Luo Y, Kang M, Wang J, Chen G, Qi J, Wu W, Wang B, Han Y, Shi L, Wang K, Han X, Ma X, Liu W, Ding Y, Wang L, Liang H, Wang L, Chen J. Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma. Gastroenterology. 2023 Jul;165(1):88-103. doi: 10.1053/j.gastro.2023.03.008. Epub 2023 Mar 14.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2023年3月2日
初级完成 (估计的)
2024年6月30日
研究完成 (估计的)
2024年7月30日
研究注册日期
首次提交
2023年7月17日
首先提交符合 QC 标准的
2023年8月2日
首次发布 (实际的)
2023年8月14日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2023年8月14日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2023年8月2日
最后验证
2023年8月1日
更多信息
与本研究相关的术语
其他研究编号
- IRB-2023-584
计划个人参与者数据 (IPD)
计划共享个人参与者数据 (IPD)？
不
IPD 计划说明
本研究不涉及药物临床试验，但重点是确保患者信息的保密性。
为了保护患者隐私，在输入姓名和年龄等患者信息时，使用编码系统代替真实姓名。
每位患者在入组时都被分配了一个研究识别号。
在整个研究过程中，只有研究团队中的主要研究人员有权访问从电子数据库中获得的患者的真实个人数据（例如姓名和年龄），并且严禁传播或共享这些信息。
在研究文章发表期间，研究团队中的主要研究人员将使用样本编码来替换患者隐私信息（例如姓名），以实现去标识化。
此外，在整个研究过程中必须保护研究参与者的个人信息，严禁传播或泄露此类信息。
药物和器械信息、研究文件
研究美国 FDA 监管的药品
不
研究美国 FDA 监管的设备产品
不
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