Mikroproteomiikkaan perustuva mahalaukun signet-rengassolukarsinooman mekanismi
keskiviikko 2. elokuuta 2023 päivittänyt: Xiangdong Cheng, Zhejiang Cancer Hospital
Mahalaukun sinettirengassolukarsinoomalla (GSRCC) on ainutlaatuinen epidemiologia ja patogeneesi syövän alalla, mutta sen esiintyvyys on alhainen.
Valitettavasti tällä hetkellä puuttuu systemaattinen tutkimus, joka keskittyisi GSRCC:n prognostisiin proteomisiin piirteisiin.
Tämän tiedon puutteen vuoksi tämän tutkimuksen tavoitteena on karakterisoida kattavasti GSRCC:n proteominen maisema käyttämällä luotettavaa ja toistettavaa DIA-PCT-menetelmää.
Tämän tutkimuksen tavoitteita ovat GSRCC:n heterogeenisyyden karakterisointi, molekyylityypityksen suorittaminen, mahdollisten biomarkkerien ja terapeuttisten kohteiden tunnistaminen sekä resurssien tarjoaminen GSRCC:n kerrostuneelle analyysille.
Näiden tavoitteiden saavuttamiseksi tutkijat valitsivat 112 GSRCC-potilaan kohortin yli 10 000 mahasyöpäpotilaan joukosta ja suorittivat proteomisen analyysin DIA-PCT-menetelmällä.
Tämä huolellinen lähestymistapa paljasti neljä uutta GSRCC:n proteomista alatyyppiä, joista jokaisella oli ainutlaatuisia molekyyliominaisuuksia.
Lisäksi tutkijat havaitsivat, että PRDX2 ja DDX27 voivat toimia ennustavina biomarkkereina GSRCC:lle, jotka validoitiin edelleen riippumattomassa 75 GSRCC-potilaan kohortissa.
Lisäksi tutkijat kiinnittivät erityistä huomiota MLT-GSSRCC-alaryhmään ja tunnistivat kolme erillistä proteomista klusteria MLT-GSSRCC-potilaiden joukossa.
Tämän alaryhmän alatyyppi 2 osoitti huonoimman ennusteen.
Tiukan seulontaprosessin avulla tutkijat määrittelivät mahdolliset kohteet GSRCC:n hoidolle.
Yhteenvetona voidaan todeta, että nämä havainnot auttavat tutkijoita ymmärtämään GSRCC:n heterogeenisyyttä ja tarjoavat arvokkaita resursseja tulevaa kliinistä kerrostumista ja kohdennettuja hoitostrategioita varten.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Aktiivinen, ei rekrytointi
Interventio / Hoito
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
300
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
Zhejiang
-
Hangzhou, Zhejiang, Kiina, 310000
- Cancer Hospital of the University of Chinese Academy of Sciences (Zhejiang Cancer Hospital)
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Näytteenottomenetelmä
Todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Näissä tapauksissa sinettirengassolujen määrä oli yli 70 %, eikä niille ole tehty aiempaa kemoterapiaa tai sädehoitoa
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Patologian perusteella vahvistettu GSRCC, jossa GSRCC:n määritellään olevan sinettirengassolujen prosenttiosuus ≥ 50 %
- potilaille täydelliset lääketieteelliset tiedot
- potilaiden selviytymisen seurantatiedot
Poissulkemiskriteerit:
- potilaita, joilla on muita pahanlaatuisia kasvaimia
- muiden patologisten komponenttien läsnäolo (esim. neuroendokriininen karsinooma ja levyepiteelisyöpä jne.)
- puutteelliset tai kadonneet tapaustiedot
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Syöpäkudokset
|
Kummallakaan ryhmällä ei ollut erityisiä interventioita.
|
|
Normaalit viereiset kudokset
|
Kummallakaan ryhmällä ei ollut erityisiä interventioita.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Kudoksen proteomi
Aikaikkuna: Lc-MS/MS:llä havaittiin näytteissä olevien proteiinien tyypit ja suhteelliset määrät näytteissä verrattuna normaaliin viereiseen kudokseen, keskimäärin kuukauden ajan.
|
Näytteet, jotka diagnosoitiin GSRCC:ksi patologian perusteella, valittiin näytteiksi, joiden sinettirengassolujen pitoisuus oli > 70 % kahden ylilääkärin patologin arvioiden ja ilman aikaisempaa sädehoitoa ja kemoterapiaa.
Kasvainkudokset ja parillinen nat kerättiin samalta potilaalta kasvaimen resektiohetkellä ja säilytettiin formaliinilla kiinnitetyssä parafiini upotuksessa (FFPE).
Proteomiikan havaitsemiseen näytteistä käytettiin nestekromatografia-massaspektrometriaa (LC-MS).
Näytteiden proteiinit uutettiin ja näytteiden proteomiikka havaittiin LC-MS:llä.
Proteiinityypit ja -pitoisuudet näytteistä selvitettiin kvalitatiivisella ja kvantitatiivisella analyysillä.
|
Lc-MS/MS:llä havaittiin näytteissä olevien proteiinien tyypit ja suhteelliset määrät näytteissä verrattuna normaaliin viereiseen kudokseen, keskimäärin kuukauden ajan.
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Puccini A, Poorman K, Catalano F, Seeber A, Goldberg RM, Salem ME, Shields AF, Berger MD, Battaglin F, Tokunaga R, Naseem M, Zhang W, Philip PA, Marshall JL, Korn WM, Lenz HJ. Molecular profiling of signet-ring-cell carcinoma (SRCC) from the stomach and colon reveals potential new therapeutic targets. Oncogene. 2022 Jun;41(26):3455-3460. doi: 10.1038/s41388-022-02350-6. Epub 2022 May 26.
- Fan Y, Bai B, Liang Y, Ren Y, Liu Y, Zhou F, Lou X, Zi J, Hou G, Chen F, Zhao Q, Liu S. Proteomic Profiling of Gastric Signet Ring Cell Carcinoma Tissues Reveals Characteristic Changes of the Complement Cascade Pathway. Mol Cell Proteomics. 2021;20:100068. doi: 10.1016/j.mcpro.2021.100068. Epub 2021 Mar 3.
- Ge S, Xia X, Ding C, Zhen B, Zhou Q, Feng J, Yuan J, Chen R, Li Y, Ge Z, Ji J, Zhang L, Wang J, Li Z, Lai Y, Hu Y, Li Y, Li Y, Gao J, Chen L, Xu J, Zhang C, Jung SY, Choi JM, Jain A, Liu M, Song L, Liu W, Guo G, Gong T, Huang Y, Qiu Y, Huang W, Shi T, Zhu W, Wang Y, He F, Shen L, Qin J. A proteomic landscape of diffuse-type gastric cancer. Nat Commun. 2018 Mar 8;9(1):1012. doi: 10.1038/s41467-018-03121-2. Erratum In: Nat Commun. 2018 May 8;9(1):1850.
- Asleh K, Negri GL, Spencer Miko SE, Colborne S, Hughes CS, Wang XQ, Gao D, Gilks CB, Chia SKL, Nielsen TO, Morin GB. Proteomic analysis of archival breast cancer clinical specimens identifies biological subtypes with distinct survival outcomes. Nat Commun. 2022 Feb 16;13(1):896. doi: 10.1038/s41467-022-28524-0.
- Chen J, Liu K, Luo Y, Kang M, Wang J, Chen G, Qi J, Wu W, Wang B, Han Y, Shi L, Wang K, Han X, Ma X, Liu W, Ding Y, Wang L, Liang H, Wang L, Chen J. Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma. Gastroenterology. 2023 Jul;165(1):88-103. doi: 10.1053/j.gastro.2023.03.008. Epub 2023 Mar 14.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Torstai 2. maaliskuuta 2023
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Sunnuntai 30. kesäkuuta 2024
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Tiistai 30. heinäkuuta 2024
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 17. heinäkuuta 2023
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 2. elokuuta 2023
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Maanantai 14. elokuuta 2023
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Maanantai 14. elokuuta 2023
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 2. elokuuta 2023
Viimeksi vahvistettu
Tiistai 1. elokuuta 2023
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- IRB-2023-584
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
IPD-suunnitelman kuvaus
Tämä tutkimus ei sisällä lääketutkimuksia, vaan keskittyy potilastietojen luottamuksellisuuden varmistamiseen.
Potilaiden yksityisyyden suojaamiseksi potilastietojen, kuten nimien ja iän, syöttämisessä käytettiin koodausjärjestelmää oikeiden nimien sijaan.
Jokaiselle potilaalle annettiin tutkimuksen tunnusnumero ilmoittautumisen yhteydessä.
Koko tutkimuksen ajan vain tutkimusryhmän päätutkijoilla on valtuudet päästä käsiksi sähköisestä tietokannasta saatuihin potilaiden todellisiin henkilötietoihin (kuten nimet ja iät), ja näiden tietojen levittäminen tai jakaminen on ehdottomasti kielletty.
Tutkimusartikkelin julkaisun aikana tutkimusryhmän päätutkijat käyttävät näytekoodausta korvaamaan potilaiden tietosuojatiedot (kuten nimet) tunnistamisen poistamiseksi.
Lisäksi tutkimukseen osallistuvien henkilötietojen suoja on säilytettävä koko tutkimusprosessin ajan, ja tällaisten tietojen levittäminen tai vuotaminen on ehdottomasti kielletty.
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .