Механизм перстневидно-клеточной карциномы желудка на основе микропротеомики
2 августа 2023 г. обновлено: Xiangdong Cheng, Zhejiang Cancer Hospital
Перстневидно-клеточная карцинома желудка (GSRCC) обладает уникальной эпидемиологией и патогенезом в области рака, но ее частота невелика.
К сожалению, в настоящее время отсутствуют систематические исследования, посвященные прогностическим протеомным особенностям GSRCC.
Учитывая этот пробел в знаниях, это исследование направлено на всестороннюю характеристику протеомного ландшафта GSRCC с использованием надежного и воспроизводимого метода DIA-PCT.
Цели этого исследования включают характеристику гетерогенности GSRCC, выполнение молекулярного типирования, определение потенциальных биомаркеров и терапевтических целей, а также предоставление ресурса для стратифицированного анализа GSRCC.
Для достижения этих целей исследователи отобрали когорту из 112 пациентов с GSRCC из более чем 10 000 пациентов с раком желудка и провели протеомный анализ с использованием метода DIA-PCT.
Этот тщательный подход выявил четыре новых протеомных подтипа GSRCC, каждый из которых обладает уникальными молекулярными характеристиками.
Кроме того, исследователи обнаружили, что PRDX2 и DDX27 могут служить прогностическими биомаркерами для GSRCC, которые были дополнительно подтверждены в независимой когорте из 75 пациентов с GSRCC.
Кроме того, исследователи уделили особое внимание подгруппе MLT-GSRCC и выявили три различных протеомных кластера среди пациентов с MLT-GSRCC.
Подтип 2 в этой подгруппе продемонстрировал самый неблагоприятный прогноз.
В ходе тщательного отбора исследователи определили потенциальные мишени для лечения GSRCC.
В заключение, эти результаты способствуют пониманию исследователями гетерогенности GSRCC и предоставляют ценные ресурсы для будущей клинической стратификации и целевых стратегий лечения.
Обзор исследования
Статус
Активный, не рекрутирующий
Вмешательство/лечение
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Оцененный)
300
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
Zhejiang
-
Hangzhou, Zhejiang, Китай, 310000
- Cancer Hospital of the University of Chinese Academy of Sciences (Zhejiang Cancer Hospital)
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Метод выборки
Вероятностная выборка
Исследуемая популяция
В этих случаях содержание перстневидных клеток превышало 70%, и они не подвергались предшествующей химиотерапии или лучевой терапии.
Описание
Критерии включения:
- подтвержденный GSRCC патологией, где GSRCC определяется как наличие процентной доли перстневидных клеток ≥ 50%
- пациентов с полной медицинской информацией
- пациентов с последующей информацией о выживании
Критерий исключения:
- пациенты с другими злокачественными опухолями
- наличие других патологических компонентов (например, нейроэндокринная карцинома и плоскоклеточная карцинома и т. д.)
- неполная или утерянная информация о деле
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Раковые ткани
|
Никаких специальных вмешательств для обеих групп не проводилось.
|
|
Нормальные соседние ткани
|
Никаких специальных вмешательств для обеих групп не проводилось.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Протеом ткани
Временное ограничение: ЖХ-МС/МС использовали для определения типов белков в образцах и относительных количеств в образцах по сравнению с нормальной соседней тканью, в среднем за один месяц.
|
Образцы, диагностированные как GSRCC по патологии, были отобраны как образцы с содержанием перстневидных клеток> 70% по оценке 2 патологов младшего главного врача или выше и без предшествующей лучевой терапии и химиотерапии.
Опухолевые ткани и парные nat были собраны у одного и того же пациента во время резекции опухоли и сохранены в парафиновой заливке, фиксированной формалином (FFPE).
Для обнаружения протеомики в образцах использовали жидкостную хроматографию-масс-спектрометрию (ЖХ-МС).
Белки в образцах экстрагировали, а протеомику в образцах определяли с помощью ЖХ-МС.
Качественный и количественный анализ был проведен для определения типов и содержания белков в образцах.
|
ЖХ-МС/МС использовали для определения типов белков в образцах и относительных количеств в образцах по сравнению с нормальной соседней тканью, в среднем за один месяц.
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- Puccini A, Poorman K, Catalano F, Seeber A, Goldberg RM, Salem ME, Shields AF, Berger MD, Battaglin F, Tokunaga R, Naseem M, Zhang W, Philip PA, Marshall JL, Korn WM, Lenz HJ. Molecular profiling of signet-ring-cell carcinoma (SRCC) from the stomach and colon reveals potential new therapeutic targets. Oncogene. 2022 Jun;41(26):3455-3460. doi: 10.1038/s41388-022-02350-6. Epub 2022 May 26.
- Fan Y, Bai B, Liang Y, Ren Y, Liu Y, Zhou F, Lou X, Zi J, Hou G, Chen F, Zhao Q, Liu S. Proteomic Profiling of Gastric Signet Ring Cell Carcinoma Tissues Reveals Characteristic Changes of the Complement Cascade Pathway. Mol Cell Proteomics. 2021;20:100068. doi: 10.1016/j.mcpro.2021.100068. Epub 2021 Mar 3.
- Ge S, Xia X, Ding C, Zhen B, Zhou Q, Feng J, Yuan J, Chen R, Li Y, Ge Z, Ji J, Zhang L, Wang J, Li Z, Lai Y, Hu Y, Li Y, Li Y, Gao J, Chen L, Xu J, Zhang C, Jung SY, Choi JM, Jain A, Liu M, Song L, Liu W, Guo G, Gong T, Huang Y, Qiu Y, Huang W, Shi T, Zhu W, Wang Y, He F, Shen L, Qin J. A proteomic landscape of diffuse-type gastric cancer. Nat Commun. 2018 Mar 8;9(1):1012. doi: 10.1038/s41467-018-03121-2. Erratum In: Nat Commun. 2018 May 8;9(1):1850.
- Asleh K, Negri GL, Spencer Miko SE, Colborne S, Hughes CS, Wang XQ, Gao D, Gilks CB, Chia SKL, Nielsen TO, Morin GB. Proteomic analysis of archival breast cancer clinical specimens identifies biological subtypes with distinct survival outcomes. Nat Commun. 2022 Feb 16;13(1):896. doi: 10.1038/s41467-022-28524-0.
- Chen J, Liu K, Luo Y, Kang M, Wang J, Chen G, Qi J, Wu W, Wang B, Han Y, Shi L, Wang K, Han X, Ma X, Liu W, Ding Y, Wang L, Liang H, Wang L, Chen J. Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma. Gastroenterology. 2023 Jul;165(1):88-103. doi: 10.1053/j.gastro.2023.03.008. Epub 2023 Mar 14.
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
2 марта 2023 г.
Первичное завершение (Оцененный)
30 июня 2024 г.
Завершение исследования (Оцененный)
30 июля 2024 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
17 июля 2023 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
2 августа 2023 г.
Первый опубликованный (Действительный)
14 августа 2023 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
14 августа 2023 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
2 августа 2023 г.
Последняя проверка
1 августа 2023 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- IRB-2023-584
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕТ
Описание плана IPD
Это исследование не связано с клиническими испытаниями лекарственных средств, но направлено на обеспечение конфиденциальности информации о пациентах.
Чтобы защитить конфиденциальность пациентов, при вводе информации о пациенте, такой как имя и возраст, вместо настоящих имен использовалась система кодирования.
Каждому пациенту при регистрации присваивался идентификационный номер исследования.
На протяжении всего исследования только основные исследователи в исследовательской группе имеют право доступа к истинным персональным данным пациентов, полученным из электронной базы данных (таким как имена и возраст), и распространение или распространение этой информации строго запрещено.
Во время публикации исследовательской статьи основные исследователи в исследовательской группе будут использовать образцы кодирования для замены информации о конфиденциальности пациентов (например, имен) для деидентификации.
Кроме того, защита личной информации участников исследования должна поддерживаться на протяжении всего исследовательского процесса, и строго запрещается распространение или утечка такой информации.
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .