Mechanisme van gastrische zegelringcelcarcinoom op basis van microproteomics
2 augustus 2023 bijgewerkt door: Xiangdong Cheng, Zhejiang Cancer Hospital
Maagzegelringcelcarcinoom (GSRCC) bezit een unieke epidemiologie en pathogenese op het gebied van kanker, maar de incidentie ervan is laag.
Helaas is er momenteel een gebrek aan systematisch onderzoek gericht op de prognostische proteomische kenmerken van GSRCC.
Gezien deze kenniskloof, heeft deze studie tot doel het proteomische landschap van GSRCC volledig te karakteriseren met behulp van een betrouwbare en reproduceerbare DIA-PCT-methode.
Deze studiedoelstellingen omvatten het karakteriseren van de heterogeniteit van GSRCC, het uitvoeren van moleculaire typering, het identificeren van potentiële biomarkers en therapeutische doelen, en het bieden van een hulpmiddel voor gestratificeerde analyse van GSRCC.
Om deze doelen te bereiken, selecteerden de onderzoekers een cohort van 112 GSRCC-patiënten uit een pool van meer dan 10.000 maagkankerpatiënten en voerden ze een proteomische analyse uit met behulp van de DIA-PCT-methode.
Deze zorgvuldige aanpak onthulde vier nieuwe proteomische subtypes van GSRCC, elk met unieke moleculaire kenmerken.
Bovendien ontdekten de onderzoekers dat PRDX2 en DDX27 kunnen dienen als voorspellende biomarkers voor GSRCC, die verder werden gevalideerd in een onafhankelijk cohort van 75 GSRCC-patiënten.
Bovendien besteedden de onderzoekers bijzondere aandacht aan de MLT-GSRCC-subgroep en identificeerden ze drie verschillende proteomische clusters bij MLT-GSRCC-patiënten.
Subtype 2 binnen deze subgroep vertoonde de slechtste prognose.
Door middel van een rigoureus screeningproces bepaalden de onderzoekers potentiële doelen voor de behandeling van GSRCC.
Concluderend dragen deze bevindingen bij aan het inzicht van de onderzoekers in de heterogeniteit van GSRCC en bieden ze waardevolle bronnen voor toekomstige klinische stratificatie en gerichte behandelingsstrategieën.
Studie Overzicht
Toestand
Actief, niet wervend
Conditie
Interventie / Behandeling
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Geschat)
300
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
Zhejiang
-
Hangzhou, Zhejiang, China, 310000
- Cancer Hospital of the University of Chinese Academy of Sciences (Zhejiang Cancer Hospital)
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Nee
Bemonsteringsmethode
Kanssteekproef
Studie Bevolking
Deze gevallen hadden een zegelringcelgehalte van meer dan 70% en hadden geen eerdere chemotherapie of radiotherapie ondergaan
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- bevestigde GSRCC door pathologie, waarbij GSRCC wordt gedefinieerd als een percentage zegelringcellen ≥ 50%
- patiënten met volledige medische informatie
- patiënten met informatie over overlevingsopvolging
Uitsluitingscriteria:
- patiënten met andere kwaadaardige tumoren
- aanwezigheid van andere pathologische componenten (bijv. neuro-endocrien carcinoom en plaveiselcelcarcinoom, enz.)
- onvolledige of verloren zaakinformatie
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Kanker weefsels
|
Er waren geen speciale interventies voor de twee groepen.
|
|
Normale aangrenzende weefsels
|
Er waren geen speciale interventies voor de twee groepen.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Het proteoom van weefsel
Tijdsspanne: Lc-MS/MS werd gebruikt om de typen eiwitten in de monsters en de relatieve hoeveelheden in de monsters te detecteren in vergelijking met normaal aangrenzend weefsel, gemiddeld een maand
|
De monsters die door pathologie als GSRCC werden gediagnosticeerd, werden geselecteerd als de monsters met een zegelringcelgehalte van > 70% zoals beoordeeld door 2 pathologen van een assistent-hoofdarts of hoger en zonder eerdere radiotherapie en chemotherapie.
Tumorweefsels en gepaard nat werden verzameld van dezelfde patiënt op het moment van tumorresectie en opgeslagen in met formaline gefixeerde paraffine-inbedding (FFPE).
Vloeistofchromatografie-massaspectrometrie (LC-MS) werd gebruikt om de proteomics in de monsters te detecteren.
De eiwitten in de monsters werden geëxtraheerd en de proteomics in de monsters werden gedetecteerd door LC-MS.
Kwalitatieve en kwantitatieve analyse werd uitgevoerd om de soorten en inhoud van eiwitten in de monsters te detecteren.
|
Lc-MS/MS werd gebruikt om de typen eiwitten in de monsters en de relatieve hoeveelheden in de monsters te detecteren in vergelijking met normaal aangrenzend weefsel, gemiddeld een maand
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Sponsor
Publicaties en nuttige links
De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.
Algemene publicaties
- Puccini A, Poorman K, Catalano F, Seeber A, Goldberg RM, Salem ME, Shields AF, Berger MD, Battaglin F, Tokunaga R, Naseem M, Zhang W, Philip PA, Marshall JL, Korn WM, Lenz HJ. Molecular profiling of signet-ring-cell carcinoma (SRCC) from the stomach and colon reveals potential new therapeutic targets. Oncogene. 2022 Jun;41(26):3455-3460. doi: 10.1038/s41388-022-02350-6. Epub 2022 May 26.
- Fan Y, Bai B, Liang Y, Ren Y, Liu Y, Zhou F, Lou X, Zi J, Hou G, Chen F, Zhao Q, Liu S. Proteomic Profiling of Gastric Signet Ring Cell Carcinoma Tissues Reveals Characteristic Changes of the Complement Cascade Pathway. Mol Cell Proteomics. 2021;20:100068. doi: 10.1016/j.mcpro.2021.100068. Epub 2021 Mar 3.
- Ge S, Xia X, Ding C, Zhen B, Zhou Q, Feng J, Yuan J, Chen R, Li Y, Ge Z, Ji J, Zhang L, Wang J, Li Z, Lai Y, Hu Y, Li Y, Li Y, Gao J, Chen L, Xu J, Zhang C, Jung SY, Choi JM, Jain A, Liu M, Song L, Liu W, Guo G, Gong T, Huang Y, Qiu Y, Huang W, Shi T, Zhu W, Wang Y, He F, Shen L, Qin J. A proteomic landscape of diffuse-type gastric cancer. Nat Commun. 2018 Mar 8;9(1):1012. doi: 10.1038/s41467-018-03121-2. Erratum In: Nat Commun. 2018 May 8;9(1):1850.
- Asleh K, Negri GL, Spencer Miko SE, Colborne S, Hughes CS, Wang XQ, Gao D, Gilks CB, Chia SKL, Nielsen TO, Morin GB. Proteomic analysis of archival breast cancer clinical specimens identifies biological subtypes with distinct survival outcomes. Nat Commun. 2022 Feb 16;13(1):896. doi: 10.1038/s41467-022-28524-0.
- Chen J, Liu K, Luo Y, Kang M, Wang J, Chen G, Qi J, Wu W, Wang B, Han Y, Shi L, Wang K, Han X, Ma X, Liu W, Ding Y, Wang L, Liang H, Wang L, Chen J. Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma. Gastroenterology. 2023 Jul;165(1):88-103. doi: 10.1053/j.gastro.2023.03.008. Epub 2023 Mar 14.
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
2 maart 2023
Primaire voltooiing (Geschat)
30 juni 2024
Studie voltooiing (Geschat)
30 juli 2024
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
17 juli 2023
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
2 augustus 2023
Eerst geplaatst (Werkelijk)
14 augustus 2023
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
14 augustus 2023
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
2 augustus 2023
Laatst geverifieerd
1 augustus 2023
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- IRB-2023-584
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
NEE
Beschrijving IPD-plan
Deze studie omvat geen klinische geneesmiddelenonderzoeken, maar richt zich op het waarborgen van de vertrouwelijkheid van patiënteninformatie.
Om de privacy van de patiënt te beschermen, werd een coderingssysteem gebruikt in plaats van echte namen bij het invoeren van patiëntgegevens zoals namen en leeftijden.
Elke patiënt kreeg bij inschrijving een studie-identificatienummer toegewezen.
Gedurende de hele studie hebben alleen de hoofdonderzoekers van het onderzoeksteam de bevoegdheid om toegang te krijgen tot de echte persoonlijke gegevens van patiënten verkregen uit de elektronische database (zoals namen en leeftijden), en het is ten strengste verboden om deze informatie te verspreiden of te delen.
Tijdens de publicatie van het onderzoeksartikel zullen de hoofdonderzoekers in het onderzoeksteam voorbeeldcodering gebruiken om de privacyinformatie van patiënten (zoals namen) te vervangen om de-identificatie te bereiken.
Bovendien moet de bescherming van persoonlijke informatie van studiedeelnemers gedurende het hele onderzoeksproces worden gehandhaafd en is het ten strengste verboden om dergelijke informatie te verspreiden of te lekken.
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Nee
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Nee
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .