Microproteomics에 기반한 위 인장 고리 세포 암종의 기전
2023년 8월 2일 업데이트: Xiangdong Cheng, Zhejiang Cancer Hospital
위 인장 고리 세포 암종 (GSRCC)은 암 분야에서 독특한 역학 및 병인을 가지고 있지만 발생률은 낮습니다.
불행히도 현재 GSRCC의 예후적 단백질체 특징에 초점을 맞춘 체계적인 연구가 부족합니다.
이러한 지식 격차를 감안할 때, 이 연구는 신뢰할 수 있고 재현 가능한 DIA-PCT 방법을 사용하여 GSRCC의 단백질체 환경을 포괄적으로 특성화하는 것을 목표로 합니다.
이 연구 목적에는 GSRCC의 이질성을 특성화하고, 분자 유형을 지정하고, 잠재적인 바이오마커 및 치료 표적을 식별하고, GSRCC의 계층화된 분석을 위한 리소스를 제공하는 것이 포함됩니다.
이러한 목표를 달성하기 위해 연구자들은 10,000명 이상의 위암 환자 풀에서 112명의 GSRCC 환자 코호트를 선택하고 DIA-PCT 방법을 사용하여 단백질 분석을 수행했습니다.
이 세심한 접근 방식은 각각 고유한 분자 특성을 나타내는 GSRCC의 4가지 새로운 프로테오믹 하위 유형을 밝혀냈습니다.
또한 연구자들은 PRDX2 및 DDX27이 GSRCC에 대한 예측 바이오마커 역할을 할 수 있음을 발견했으며, 이는 75명의 GSRCC 환자의 독립적인 코호트에서 추가로 검증되었습니다.
또한 조사관은 MLT-GSRCC 하위 그룹에 특히 주의를 기울였고 MLT-GSRCC 환자들 사이에서 3개의 뚜렷한 단백질 클러스터를 식별했습니다.
이 하위 그룹 내의 하위 유형 2는 가장 나쁜 예후를 보였습니다.
엄격한 선별 과정을 통해 연구자들은 GSRCC 치료를 위한 잠재적인 표적을 결정했습니다.
결론적으로, 이러한 발견은 GSRCC의 이질성에 대한 연구자의 이해에 기여하고 향후 임상 계층화 및 표적 치료 전략을 위한 귀중한 자원을 제공합니다.
연구 개요
연구 유형
관찰
등록 (추정된)
300
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 장소
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Zhejiang
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Hangzhou, Zhejiang, 중국, 310000
- Cancer Hospital of the University of Chinese Academy of Sciences (Zhejiang Cancer Hospital)
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
샘플링 방법
확률 샘플
연구 인구
이 경우는 인장 고리 세포 함량이 70% 이상이었고 이전에 화학 요법이나 방사선 요법을 받은 적이 없었습니다.
설명
포함 기준:
- 병리학적으로 확인된 GSRCC, 여기서 GSRCC는 인장 고리 세포의 백분율이 50% 이상인 것으로 정의됩니다.
- 완전한 의료 정보를 가진 환자
- 생존 추적 정보가 있는 환자
제외 기준:
- 다른 악성 종양 환자
- 다른 병리학적 요소(예: 신경내분비 암종 및 편평 세포 암종 등)의 존재
- 불완전하거나 분실된 사례 정보
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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암 조직
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두 그룹에 대한 특별한 개입은 없었다.
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정상적인 인접 조직
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두 그룹에 대한 특별한 개입은 없었다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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조직의 프로테옴
기간: LC-MS/MS를 이용하여 샘플 내 단백질의 종류와 정상 인접 조직과 비교하여 샘플 내 상대적인 양을 검출하였으며, 평균 1개월
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병리학적으로 GSRCC로 진단된 시료는 준주치의 이상의 병리과의사 2명이 판단한 반지세포 함량 > 70%이고 이전에 방사선 및 화학요법을 받지 않은 시료로 선정하였다.
종양 조직과 쌍을 이룬 nat는 종양 절제 시 동일한 환자로부터 수집하여 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE)에 보관했습니다.
액체 크로마토그래피-질량 분석법(LC-MS)을 사용하여 샘플의 프로테오믹스를 검출했습니다.
샘플의 단백질을 추출하고 샘플의 프로테오믹스를 LC-MS로 검출했습니다.
시료 내 단백질의 종류와 함량을 알아보기 위해 정성 및 정량 분석을 실시하였다.
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LC-MS/MS를 이용하여 샘플 내 단백질의 종류와 정상 인접 조직과 비교하여 샘플 내 상대적인 양을 검출하였으며, 평균 1개월
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
간행물 및 유용한 링크
연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.
일반 간행물
- Puccini A, Poorman K, Catalano F, Seeber A, Goldberg RM, Salem ME, Shields AF, Berger MD, Battaglin F, Tokunaga R, Naseem M, Zhang W, Philip PA, Marshall JL, Korn WM, Lenz HJ. Molecular profiling of signet-ring-cell carcinoma (SRCC) from the stomach and colon reveals potential new therapeutic targets. Oncogene. 2022 Jun;41(26):3455-3460. doi: 10.1038/s41388-022-02350-6. Epub 2022 May 26.
- Fan Y, Bai B, Liang Y, Ren Y, Liu Y, Zhou F, Lou X, Zi J, Hou G, Chen F, Zhao Q, Liu S. Proteomic Profiling of Gastric Signet Ring Cell Carcinoma Tissues Reveals Characteristic Changes of the Complement Cascade Pathway. Mol Cell Proteomics. 2021;20:100068. doi: 10.1016/j.mcpro.2021.100068. Epub 2021 Mar 3.
- Ge S, Xia X, Ding C, Zhen B, Zhou Q, Feng J, Yuan J, Chen R, Li Y, Ge Z, Ji J, Zhang L, Wang J, Li Z, Lai Y, Hu Y, Li Y, Li Y, Gao J, Chen L, Xu J, Zhang C, Jung SY, Choi JM, Jain A, Liu M, Song L, Liu W, Guo G, Gong T, Huang Y, Qiu Y, Huang W, Shi T, Zhu W, Wang Y, He F, Shen L, Qin J. A proteomic landscape of diffuse-type gastric cancer. Nat Commun. 2018 Mar 8;9(1):1012. doi: 10.1038/s41467-018-03121-2. Erratum In: Nat Commun. 2018 May 8;9(1):1850.
- Asleh K, Negri GL, Spencer Miko SE, Colborne S, Hughes CS, Wang XQ, Gao D, Gilks CB, Chia SKL, Nielsen TO, Morin GB. Proteomic analysis of archival breast cancer clinical specimens identifies biological subtypes with distinct survival outcomes. Nat Commun. 2022 Feb 16;13(1):896. doi: 10.1038/s41467-022-28524-0.
- Chen J, Liu K, Luo Y, Kang M, Wang J, Chen G, Qi J, Wu W, Wang B, Han Y, Shi L, Wang K, Han X, Ma X, Liu W, Ding Y, Wang L, Liang H, Wang L, Chen J. Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma. Gastroenterology. 2023 Jul;165(1):88-103. doi: 10.1053/j.gastro.2023.03.008. Epub 2023 Mar 14.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
2023년 3월 2일
기본 완료 (추정된)
2024년 6월 30일
연구 완료 (추정된)
2024년 7월 30일
연구 등록 날짜
최초 제출
2023년 7월 17일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2023년 8월 2일
처음 게시됨 (실제)
2023년 8월 14일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2023년 8월 14일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2023년 8월 2일
마지막으로 확인됨
2023년 8월 1일
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- IRB-2023-584
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
아니요
IPD 계획 설명
이 연구는 약물 임상 시험을 포함하지 않지만 환자 정보의 기밀성을 보장하는 데 중점을 둡니다.
환자 개인정보 보호를 위해 이름, 나이 등 환자 정보 입력 시 실명 대신 코딩 시스템을 사용하였다.
등록 시 각 환자에게 연구 식별 번호가 할당되었습니다.
전체 연구 과정에서 연구팀의 주요 연구원만이 전자 데이터베이스에서 얻은 환자의 실제 개인 데이터(예: 이름, 연령)에 접근할 수 있는 권한을 가지며 이러한 정보를 유포하거나 공유하는 것을 엄격히 금지합니다.
연구 논문이 출판되는 동안 연구팀의 주요 연구원들은 비식별화를 달성하기 위해 샘플 코딩을 사용하여 환자의 개인 정보(예: 이름)를 대체합니다.
또한, 연구 참여자의 개인정보 보호는 연구 전 과정에 걸쳐 유지되어야 하며, 이러한 정보를 유포하거나 유출하는 것을 엄격히 금지합니다.
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
아니
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
아니
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