先天性心疾患 (SD-CHD) 検出のためのシーケンス研究

CHD の遺伝的原因の多くは、標準的なマイクロアレイや核型では見逃されます。 全ゲノムシークエンシング（WGS）や、ロングリードシークエンシング、デジタルドロップレットPCR、RNAシークエンシング、メチル化解析などの遺伝子診断およびエピジェネティック診断のためのその他の専門技術は、CHDのさらなる原因を特定することになるが、これらの技術は出生前の患者に体系的に提供されていない。

精密胎児診断は、核型の異数性診断から、マイクロアレイで検出されるコピー数変異（22q11欠失症候群など）、さらには遺伝子パネルやエクソームシーケンス（ES）による遺伝子配列決定まで拡大しています。 全体として、超音波異常を伴う出生前 ES の診断率は 8.5%、マイクロアレイと核型が正常な胎児では 10% でした。 異常特異的コホートでは、遺伝的不均一性と CHD との重複を伴​​う病因である非免疫性水腫の診断率が最大 29% であることが指摘されています。 出生前診断における ES の導入は、費用、検査に必要な時間、ES の広範な性質に対する医療提供者の安心感、重要性が不確かな変異体や二次的所見などの理由により、患者のアクセスが制限されてきました。

ゲノム配列決定からのデータの品質と精度は、バイオインフォマティクス分析に使用される情報の品質と精度に直接関係しています。 ある小規模な研究では、出生後または解剖結果が入手可能になった後に出生前ES症例が再分析された場合、表現型情報の増加により、さらに20％の症例が診断結果に達したことが指摘されています。 特定の異常に対するゲノム配列決定の診断収率に対する表現型の影響は不明です。

胎児期と新生児期を一連のケアとして捉えることの重要性がますます認識されています。 重篤な CHD の出生前検出は、家族が新生児の生存を最適化するのに役立つ機会であり、他の健康上の課題、またはその欠如について学ぶことは、親の備えに大きな影響を与える可能性があります。 これは、ストレスのレベルや、出生前にどのコンサルタントに相談するか、出産のためにどのセンターを選択するか、さらには生後最初の数か月、数年間にどのような治療法を検討するかなどの臨床管理上の決定に影響を与える可能性があります。 肥大型心筋症（HCM）患者の以前の小児コホートでは、新たな分子診断を受けた患者のうち、73％の人が臨床管理推奨が確立されている遺伝子に病的バリアントが同定され、36％が症候性HCM遺伝子にあり、2.9人が病的バリアントを有していたことが指摘された。 % は適格な臨床試験を行った遺伝子に含まれていました。

具体的な目的:

1. 対象基準を満たす、出生前に検出された先天性心疾患 (CHD) を有する胎児に対して全ゲノムシーケンス (WGS) を実行します。 CHD における WGS の診断率と、診断率に対する出生前表現型と出生後の表現型の影響を評価します。
2. 詳細な超音波検査、磁気共鳴画像法、剖検または病理学的所見、および利用可能な場合は生化学またはプロテオミクスプロファイリング結果を使用して、表現型の原因となる遺伝子を同定するためのバイオインフォマティクスフィルタリングと出生前表現型検査を改善します。
3. 分娩場所の選択、サブスペシャリストの提供者との産前相談、サブスペシャリストの提供者との産後の介入と相談を含む、妊娠および新生児ケアに関する WGS の有用性を評価します。

これらの目的を通じて、研究チームはCHD胎児の遺伝子診断についての科学的理解を拡大し、家族の不安やうつ病への影響を評価し、この情報の臨床的有用性を評価する予定である。 この情報により、健康転帰を改善しながら新しい技術を導入するための患者中心のアプローチが可能になり、出生前超音波検査で特定される最も一般的な構造的奇形に対する将来の疾患特有のオーダーメイドケアが可能になります。