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先天性心脏病 (SD-CHD) 研究中的测序检测

2024年2月9日 更新者:Rebecca Reimers、Scripps Translational Science Institute

这项研究正在招募在拉迪儿童医院胎儿心脏病学项目接受先天性心脏病产前诊断的孕妇,以寻找胎儿或未出生婴儿的遗传疾病。

先天性心脏病 (CHD) 是一组心脏结构差异,是全球活产婴儿中最常见的出生缺陷。 CHD 是与出生缺陷相关的婴儿死亡的主要原因。 产前检测可以为父母提供分娩计划、产后修复、专门药物治疗和详细咨询。 多达三分之一的患有先心病的胎儿可能有遗传原因。 对于婴儿来说,了解遗传病有助于患者和医生为婴儿提供最好的护理。 如果在产前发现,同样的知识可以帮助参与者为分娩地点做好准备,与专家会面,并考虑可能合适的专门治疗和药物。

全基因组测序(WGS)对产前检测出先天性心脏病(CHD)的胎儿的诊断率和临床效用将与选择羊膜穿刺术或绒毛膜绒毛取样的患者的常规临床测试进行比较。 将从胎儿样本和亲生血液样本中获取 DNA,并根据标准临床解释指南进行分析。 结果将报告给医疗保健提供者和患者,并收集临床效用的衡量标准。 此外,压力、焦虑、抑郁和信息感知效用的测量将通过经过验证的调查工具进行评估。 选择进行诊断程序的历史患者队列将被用作比较人群。

研究概览

详细说明

标准微阵列和核型分析忽略了许多冠心病的遗传原因。 全基因组测序 (WGS) 和其他用于遗传和表观遗传诊断的专业技术,如长读长测序、数字液滴 PCR、RNA 测序和甲基化分析,将识别 CHD 的其他原因,但这些技术尚未在产前系统地提供给患者。

精准胎儿诊断已从核型非整倍体诊断扩展到微阵列检测到的拷贝数变异(例如 22q11 缺失综合征),再到通过基因组和外显子组测序 (ES) 进行基因测序。 总体而言,对于具有正常微阵列和核型的胎儿,超声异常情况下的产前 ES 的诊断率分别为 8.5% 和 10%。 异常特异性队列注意到非免疫性积水的诊断率高达 29%,这是一种具有遗传异质性且与 CHD 重叠的病因。 由于成本、检测所需的时间、提供者对 ES 广泛性质的舒适度以及意义不确定的潜在变异和次要发现等原因,ES 在产前诊断中的采用受到患者获取的限制。

基因组测序数据的质量和准确性与生物信息学分析中信息的质量和准确性直接相关。 一项小型研究指出,当产前 ES 病例在产后或尸检结果获得后重新分析时,由于表型信息的增加,另外 20% 的病例得出了诊断结果。 表型对特定异常基因组测序诊断率的影响尚不清楚。

人们越来越认识到将胎儿期和新生儿期视为连续护理的重要性。 危重先心病的产前检测有机会帮助家庭优化新生儿生存,了解其他健康挑战,或缺乏了解,可能会对父母的准备产生很大影响。 这可能会影响他们的压力水平和临床管理决策,例如产前与哪些顾问会面、选择哪个中心进行分娩,甚至可能影响在生命的最初几个月和几年内考虑什么治疗方法。 先前的肥厚型心肌病 (HCM) 儿科患者队列指出,在进行新分子诊断的患者中,73% 的个体在已建立临床管理建议的基因中发现了致病性变异,36% 存在于综合征型 HCM 基因中,2.9% 存在于综合征型 HCM 基因中。 % 属于符合资格临床试验的基因。

具体目标:

  1. 对符合纳入标准的产前检测出先天性心脏病 (CHD) 的胎儿进行全基因组测序 (WGS)。 评估 WGS 对 CHD 的诊断率以及产前与产后表型对诊断率的影响。
  2. 通过使用详细的超声检查、磁共振成像、尸检或病理学结果以及可用的生化或蛋白质组分析结果,改进生物信息过滤和产前表型分析,以识别导致表型的基因。
  3. 评估 WGS 在妊娠和新生儿护理方面的效用,包括分娩地点的选择、与专科医生的产前咨询以及产后干预和与专科医生的咨询。

通过这些目标,研究小组将扩大对先心病胎儿基因诊断的科学认识,评估其对家庭焦虑、抑郁的影响,并评估这些信息的临床效用。 这些信息将允许采用以患者为中心的方法来实施新技术,同时改善健康结果,并允许未来针对产前超声发现的最常见结构畸形进行针对特定疾病的定制护理。

研究类型

介入性

注册 (估计的)

200

阶段

  • 不适用

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习联系方式

学习地点

    • California
      • San Diego、California、美国、92123
        • 招聘中
        • Rady Children's Institute for Genomic Medicine
        • 接触:
          • Rebecca Reimers, MD/MPH
          • 电话号码:858-494-5290

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

  • 成人
  • 年长者

接受健康志愿者

不

描述

纳入标准:

  • 持续妊娠且产前检测出胎儿 CHD 的孕妇
  • 渴望基因诊断和羊膜穿刺术或绒毛膜绒毛取样的临床计划

排除标准:

  • 孕龄 38 周或以上
  • 临床病程完全由已知的染色体异常或已证实的基因诊断来解释,从而解释了临床状况
  • 18岁以下孕妇

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 主要用途:诊断
  • 分配:不适用
  • 介入模型:单组作业
  • 屏蔽:无(打开标签)

武器和干预

参与者组/臂
干预/治疗
其他:对受试者样本进行全基因组测序 (WGC)
对符合纳入标准的产前检测出先天性心脏病 (CHD) 的胎儿进行全基因组测序 (WGS)。 评估 WGS 对 CHD 的诊断率以及产前与产后表型对诊断率的影响。

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
全基因组测序(WGS)对胎儿先天性心脏病的诊断率
大体时间:预计 2 年内将有 200 个三人组
具有致病性或可能致病性测序结果的三重奏/三重奏总数。
预计 2 年内将有 200 个三人组

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
按 CHD 病变类型划分的诊断率
大体时间:预计 2 年内将有 200 个三人组
与主要结局一样,诊断率细分为瓣膜缺损、房间隔缺损、心室间隔缺损、流入道和流出道异常
预计 2 年内将有 200 个三人组
WGS 的患者效用通过以下方式衡量:基因组赋权量表 (GEmS)
大体时间:出生后 18 个月进行最终调查
用于衡量在各种临床条件下接收基因组测试结果的心理影响和个人赋权。 GEmS 由 28 个项目和 4 个派生因素组成。 这四个因素似乎评估以下维度: 因素 1 - 诊断的意义(父母对基因组测序的实用性和所得信息的重要性的看法);因素 2 - 过程的情绪管理(家长对自己管理与诊断过程和结果相关的情绪的能力有信心);因素 3 - 寻求信息和支持(家长对自己采取下一步措施寻找新信息和支持的能力充满信心);因素 4 - 影响和规划(寻求医疗保健提供者的支持以及信息对家庭生殖决策的重要性)。 因素得分越高,参与者在每个评估维度上的能力就越强。
出生后 18 个月进行最终调查
WGS 的患者效用通过以下方式衡量:关于基因组测试结果的感受 (FACToR) 问卷
大体时间:出生后 18 个月进行最终调查
对之前发布的、经过验证的工具进行评分,设计简洁、敏感且以患者为中心。 用于衡量在各种临床条件下接收基因组测试结果的心理影响和个人赋权。 该工具包括 12 个项目和 4 个分量表(消极情绪、积极情绪、不确定性、隐私问题),采用 5 点李克特量表。 0=一点也不,1=一点,2=有点,3=很多,4=很多。
出生后 18 个月进行最终调查
WGS 的提供者效用:临床医生报告的基因检测效用指数(C 指南)
大体时间:出生后 18 个月进行最终调查

先前发布的评分指标,用于评估基因检测在临床实践中的临床效用。 在 30 个 C-GUIDE 项目中,使用特定于项目的固定响应选项,27 个项目的评分为 0 到 2,另外 3 个项目的评分为 -2 到 0。 项目得分 >0 表示正效用,项目得分 <0 表示负效用(“负效用”),项目得分为 0 表示无效用。

每个评分策略的可能 C-GUIDE 总分范围为:每个 PV -2 到 32,一个 PV 加一个 SV 为 -4 到 48,一个 PV 加一个 SV 加一个 PGx 集群为 -6 到 54。 C-GUIDE 是一个序数尺度,项目没有加权。

出生后 18 个月进行最终调查
患者随时间的抑郁和焦虑测量:GAD7
大体时间:出生后 18 个月进行最终调查
通过标准化仪器广泛性焦虑症-7 (GAD7) 测量,最低分数为 0;最高分是21分;分数越高意味着情况越差、越焦虑
出生后 18 个月进行最终调查
随着时间的推移,患者抑郁和焦虑的测量结果:EPDS
大体时间:出生后 18 个月进行最终调查
采用标准化仪器爱丁堡围产期/产后抑郁量表(EPDS)测量,最低得分为0;最高分为30分;分数越高意味着情况越差、越抑郁
出生后 18 个月进行最终调查
该群体的人口统计数据。
大体时间:注册期限。
来自临床测序证据生成研究 (CSER) 联盟的标准化指标。
注册期限。

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2024年1月9日

初级完成 (估计的)

2026年4月1日

研究完成 (估计的)

2026年10月1日

研究注册日期

首次提交

2023年10月28日

首先提交符合 QC 标准的

2024年1月29日

首次发布 (实际的)

2024年2月6日

研究记录更新

最后更新发布 (估计的)

2024年2月13日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2024年2月9日

最后验证

2024年2月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他研究编号

  • IRB-23-8202

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

不

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

不

研究美国 FDA 监管的设备产品

不

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