Studie The Sequencing for Detection in Congenital Heart Disease (SD-CHD).

Standardní microarray a karyotyp postrádají mnohé genetické příčiny ICHS. Sekvenování celého genomu (WGS) a další specializované technologie pro genetickou a epigenetickou diagnostiku, jako je sekvenování s dlouhým čtením, digitální kapénková PCR, sekvenování RNA a methylační analýza, identifikují další příčiny ICHS, ale tyto technologie nebyly systematicky nabízeny pacientům prenatálně.

Přesná fetální diagnostika se rozšířila od diagnózy aneuploidie na karyotypu k variantám počtu kopií detekovaných na mikročipu (jako je deleční syndrom 22q11) na sekvenování genů prostřednictvím genových panelů a sekvenování exomů (ES). Celkově má ​​prenatální ES v podmínkách ultrazvukové anomálie diagnostickou výtěžnost 8,5 % a 10 % u plodů s normálním mikročipem a karyotypem. Kohorty specifické pro anomálie zaznamenaly diagnostickou míru až 29 % u neimunitního hydropsu, což je etiologie s genetickou heterogenitou a překrýváním s ICHS. Zavádění ES v prenatální diagnostice bylo omezeno přístupem k pacientům kvůli ceně, době potřebné k testování, pohodlí poskytovatele při široké povaze ES a potenciálním variantám nejistého významu a sekundárním nálezům.

Kvalita a přesnost dat z genomového sekvenování přímo souvisí s kvalitou a přesností informací, které vstupují do bioinformatické analýzy. Jedna malá studie zaznamenala, že když byly prenatální případy ES znovu analyzovány postnatálně nebo poté, co byly k dispozici výsledky pitvy, dalších 20 % případů dosáhlo diagnostického výsledku kvůli zvýšeným fenotypovým informacím. Vliv fenotypu na diagnostický výtěžek genomového sekvenování pro specifické anomálie je nejasný.

Stále více se uznává důležitost pohledu na fetální a novorozenecké období jako na kontinuitu péče. Prenatální detekce kritické ICHS má příležitost pomoci rodině optimalizovat přežití novorozence a učení se dalším zdravotním problémům nebo jejich nedostatek může mít velký vliv na připravenost rodičů. To může ovlivnit jejich míru stresu a rozhodnutí klinického managementu, jako je to, s jakými konzultanty se mají prenatálně setkat, které centrum si vybrat pro porod a případně i to, jaká terapeutika zvážit v prvních měsících a letech života. Předchozí dětská kohorta pacientů s hypertrofickou kardiomyopatií (HCM) zaznamenala, že mezi pacienty s novou molekulární diagnózou mělo 73 % jedinců patogenní variantu identifikovanou v genu se zavedenými doporučeními pro klinickou léčbu, 36 % mělo syndromické geny HCM a 2,9 % bylo v genech s vhodnou klinickou studií.

Konkrétní cíle:

1. Proveďte sekvenování celého genomu (WGS) u plodů s prenatálně zjištěnou vrozenou srdeční vadou (CHD), které splňují kritéria pro zařazení. Posuďte diagnostickou výtěžnost WGS u ICHS a vliv prenatálního versus postnatálního fenotypu na diagnostickou výtěžnost.
2. Zlepšit bioinformatické filtrování a prenatální fenotypování pro identifikaci genů způsobujících fenotyp pomocí podrobných ultrasonografických vyšetření, zobrazování magnetickou rezonancí, pitevních nebo patologických nálezů a výsledků biochemického nebo proteomického profilování, pokud jsou k dispozici.
3. Vyhodnoťte užitečnost WGS pro těhotenství a neonatální péči, včetně výběru místa porodu, předporodních konzultací se subspecializovanými poskytovateli a postnatálních intervencí a konzultací se subspecializovanými poskytovateli.

Prostřednictvím těchto cílů rozšíří studijní tým vědecké chápání genetické diagnózy u plodů s ICHS a vyhodnotí dopad na rodinnou úzkost, depresi a zhodnotí klinickou užitečnost těchto informací. Tyto informace umožní přístupy zaměřené na pacienta k zavádění nových technologií při současném zlepšení zdravotních výsledků a umožní budoucí péči šitou na míru pro konkrétní onemocnění u nejběžnějších strukturálních malformací identifikovaných na prenatálním ultrazvuku.