Sekvensointi synnynnäisen sydänsairauden havaitsemiseksi (SD-CHD) -tutkimus

Monet sepelvaltimotaudin geneettiset syyt jäävät huomioimatta standardimikrosirulla ja karyotyypillä. Koko genomin sekvensointi (WGS) ja muut geneettiseen ja epigeneettiseen diagnoosiin erikoistuneet tekniikat, kuten pitkään luettava sekvensointi, digitaalinen pisara-PCR, RNA-sekvensointi ja metylaatioanalyysi, tunnistavat CHD:n muita syitä, mutta näitä tekniikoita ei ole systemaattisesti tarjottu potilaille ennen syntymää.

Tarkka sikiön diagnoosi on laajentunut karyotyypin aneuploidian diagnosoinnista mikrosirulla havaittuihin kopiolukuvariantteihin (kuten 22q11-deleetiooireyhtymä) geenisekvensointiin geenipaneelien ja exome-sekvensoinnin (ES) kautta. Kaiken kaikkiaan synnytystä edeltävällä ES:llä ultraäänipoikkeaman taustalla on ollut diagnostiset saannot 8,5 % ja 10 % sikiöillä, joilla on normaali mikrosiru ja karyotyyppi. Anomaliaspesifiset kohortit ovat havainneet jopa 29 %:n diagnostisia määriä ei-immuunihydropeissa, jotka ovat geneettisesti heterogeenisiä ja päällekkäisiä CHD:n kanssa. ES:n käyttöönottoa synnytystä edeltävässä diagnoosissa on rajoittanut potilaan pääsy kustannuksiin, testaukseen tarvittavaan aikaan, palveluntarjoajan mukavuuteen ES:n laajasta luonteesta sekä mahdollisista epävarman merkityksen ja toissijaisten löydösten muunnelmista.

Genomisekvensoinnin datan laatu ja tarkkuus liittyvät suoraan bioinformaattiseen analyysiin menevän tiedon laatuun ja tarkkuuteen. Eräässä pienessä tutkimuksessa todettiin, että kun synnytystä edeltävät ES-tapaukset analysoitiin uudelleen postnataalisesti tai sen jälkeen, kun ruumiinavaustulokset olivat saatavilla, 20 % tapauksista saavutti diagnostisen tuloksen lisääntyneen fenotyyppisen tiedon vuoksi. Fenotyypin vaikutus genomisen sekvensoinnin diagnostiseen tuottoon spesifisten poikkeavuuksien osalta on epäselvä.

Sikiön ja vastasyntyneen ajanjakson näkemisen merkitys hoidon jatkumona tunnustetaan yhä enemmän. Kriittisen sepelvaltimotaudin synnytystä edeltävällä havaitsemisella on mahdollisuus auttaa perhettä optimoimaan vastasyntyneen selviytymistä, ja muiden terveyshaasteiden oppiminen tai niiden puute voi vaikuttaa suuresti vanhempien valmiuksiin. Tämä voi vaikuttaa heidän stressitasoonsa ja kliinisen hallinnon päätöksiin, kuten siihen, mitä konsultteja tavata ennen syntymää, mikä keskus valita synnytystä varten, ja mahdollisesti jopa mitä hoitomuotoja harkita ensimmäisinä elinkuukausina ja -vuosina. Aiempi lapsiryhmä, jossa oli hypertrofista kardiomyopatiaa (HCM) sairastanutta potilaita, totesi, että 73 prosentilla henkilöistä, joilla oli uusi molekyylidiagnoosi, oli patogeeninen variantti tunnistettu geenissä, jolla oli vakiintuneet kliinisen hoitosuositukset, 36 prosentilla oli syndrooma HCM-geenejä ja 2,9 prosenttia. % oli geeneissä, joilla oli kelvollinen kliininen tutkimus.

Erityiset tavoitteet:

1. Suorita koko genomin sekvensointi (WGS) sikiöille, joilla on syntymää edeltävä synnynnäinen sydänsairaus (CHD), jotka täyttävät sisällyttämiskriteerit. Arvioi WGS:n diagnostinen saanto CHD:ssä ja prenataalisen ja postnataalisen fenotyypin vaikutus diagnostiseen saantoon.
2. Paranna bioinformaattista suodatusta ja syntymää edeltävää fenotyyppiä fenotyyppiä aiheuttavien geenien tunnistamiseksi käyttämällä yksityiskohtaisia ​​ultraäänitutkimuksia, magneettikuvausta, ruumiinavaus- tai patologisia löydöksiä ja biokemiallisia tai proteomisia profilointituloksia, jos niitä on saatavilla.
3. Arvioi WGS:n käyttökelpoisuutta raskauden ja vastasyntyneiden hoidossa, mukaan lukien synnytyspaikan valinta, synnytystä edeltävä konsultaatio erikoislääkärin kanssa, synnytyksen jälkeiset interventiot ja konsultaatio erikoislääkärien kanssa.

Näiden tavoitteiden kautta tutkimusryhmä laajentaa tieteellistä ymmärrystä geneettisestä diagnoosista sikiöillä, joilla on sepelvaltimotauti, ja arvioi vaikutusta perheiden ahdistuneisuuteen, masennukseen ja arvioi näiden tietojen kliinistä hyötyä. Nämä tiedot mahdollistavat potilaskeskeisen lähestymistavan uusien teknologioiden käyttöönottamiseksi samalla, kun ne parantavat terveystuloksia ja mahdollistavat tulevaisuuden sairauskohtaisen räätälöidyn hoidon yleisimmissä synnytystä edeltävässä ultraäänitutkimuksessa tunnistetuissa rakenteellisissa epämuodostumissa.