ニューモシスティス・ジロベシイの遺伝子型解析

私たちは微生物と生活を共にしていますが、個人が健康で免疫系が正常であれば、微生物は通常問題を引き起こしません。 ただし、免疫システムが適切に機能していない場合（がん患者など）、感染のリスクがあります。 微生物の 1 つであるニューモシスチス ジロベシ (PCP) と呼ばれる真菌は、免疫系が適切に機能していない患者に重度の胸部感染症を引き起こし、治療しなければ入院や死に至る可能性があります。 患者の免疫システムが機能しないままだと、感染を繰り返す可能性が高くなります。

PCP は空気を介して人から人へと広がり、環境表面でも生存できます。 患者はこれらの表面に接触すると感染する可能性があります。 病院には、PCP に感染した患者が他の体調の悪い患者にうつさないようにする責任があります。 PCP が複数の患者に感染した場合、同じ真菌が患者から患者へと伝わったかどうかを知ることは、病院内で集団感染が発生しているかどうかを理解する上で極めて重要です。 PCP 株の類似性 (関連性) を理解することで、医療従事者は患者間または環境間の感染を検出できるようになります。

各患者の PCP 感染がどのように関連しているかを理解するために、多座位配列タイピング (MLST) と呼ばれる臨床検査を利用します。 この検査では、デオキシリボ核酸 (DNA) 配列決定を使用して真菌の遺伝暗号の一部を調べて、ある PCP が検査対象の他の PCP とどのように関連しているかを示すコード (遺伝子型) を作成します。これにより、患者間の比較が可能になり、最終的には感染を特定することができます。

私たちの目的は、PCP 陽性の患者サンプルを使用してこのシーケンス検査を開発し、高品質の基準で実行されることを保証することです。 既知の70のPCP陽性患者サンプルからの余剰物質が検査される。 各サンプルは、DNA 遺伝子型が、当社が検査した他の患者サンプルと一致するか、類似しているかを確認するために分析され、PCP が患者間でどのように広がるかを理解するのに役立ちます。