Genotipado de Pneumocystis Jirovecii
Genotipado de Pneumocystis Jirovecii en tiempo real para respaldar la toma de decisiones clínicas en el manejo de brotes nosocomiales
Compartimos nuestra vida con microorganismos, y estos generalmente no suponen un problema si un individuo está sano y tiene un sistema inmunológico normal. Sin embargo, si el sistema inmunológico no funciona correctamente (por ejemplo, pacientes con cáncer), corren el riesgo de contraer una infección. Un microorganismo, un hongo llamado Pneumocystis jirovecii (PCP), puede causar infecciones respiratorias graves en pacientes cuyo sistema inmunológico no funciona adecuadamente, lo que lleva a la hospitalización y la muerte si no se trata. Si los pacientes permanecen sin un sistema inmunológico que funcione, tienen una mayor probabilidad de sufrir una infección repetida.
El PCP se transmite a través del aire de persona a persona y puede sobrevivir en superficies ambientales. Los pacientes pueden infectarse después del contacto con estas superficies. Los hospitales tienen la responsabilidad de garantizar que los pacientes infectados con PCP no lo transmitan a otros pacientes enfermos. En los casos en que la PCP ha infectado a varios pacientes, saber si el mismo hongo se ha transmitido (o transmitido) de un paciente a otro es vital para comprender si hay un brote en el hospital. Comprender qué tan similar (la relación) es la cepa de PCP permite a los trabajadores de la salud detectar cualquier transmisión entre pacientes o el medio ambiente.
Para comprender qué tan relacionada está la infección por PCP de cada paciente, utilizaremos una prueba de laboratorio llamada tipificación de secuencia multilocus (MLST). Esta prueba analiza secciones del código genético del hongo utilizando la secuenciación del ácido desoxirribonucleico (ADN) para crear un código (genotipo) que nos indica qué tan relacionado está un PCP con otros analizados, lo que permite comparar entre pacientes y, en última instancia, detectar la transmisión.
Nuestro objetivo es desarrollar esta prueba de secuenciación utilizando muestras de pacientes positivas para PCP y garantizar que funcione con estándares de alta calidad. Se analizará el material sobrante de setenta muestras de pacientes positivos para PCP. Cada muestra se analizará para ver si el genotipo de ADN coincide o es similar con otras muestras de pacientes que hemos analizado, lo que ayudará a comprender cómo la PCP puede transmitirse entre pacientes.
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Descripción detallada
Compartimos nuestra vida con microorganismos, y estos generalmente no suponen un problema si un individuo está sano y tiene un sistema inmunológico normal. Sin embargo, si el sistema inmunológico no funciona correctamente (por ejemplo, pacientes con cáncer), corren el riesgo de contraer una infección. Un microorganismo, un hongo llamado Pneumocystis jirovecii (PCP), puede causar infecciones respiratorias graves en pacientes cuyo sistema inmunológico no funciona adecuadamente, lo que lleva a la hospitalización y la muerte si no se trata. Si los pacientes permanecen sin un sistema inmunológico que funcione, tienen una mayor probabilidad de sufrir una infección repetida.
El PCP se transmite a través del aire de persona a persona y puede sobrevivir en superficies ambientales. Los pacientes pueden infectarse después del contacto con estas superficies. Los hospitales tienen la responsabilidad de garantizar que los pacientes infectados con PCP no lo transmitan a otros pacientes enfermos. En los casos en que la PCP ha infectado a varios pacientes, saber si el mismo hongo se ha transmitido (o transmitido) de un paciente a otro es vital para comprender si hay un brote en el hospital. Comprender qué tan similar (la relación) es la cepa de PCP permite a los trabajadores de la salud detectar cualquier transmisión entre pacientes o el medio ambiente.
Para comprender qué tan relacionada está la infección por PCP de cada paciente, utilizaremos una prueba de laboratorio llamada tipificación de secuencia multilocus (MLST). Esta prueba analiza secciones del código genético del hongo utilizando la secuenciación del ácido desoxirribonucleico (ADN) para crear un código (genotipo) que nos indica qué tan relacionado está un PCP con otros analizados, lo que permite comparar entre pacientes y, en última instancia, detectar la transmisión.
Nuestro objetivo es desarrollar esta prueba de secuenciación utilizando muestras de pacientes positivas para PCP y garantizar que funcione con estándares de alta calidad. Se analizará el material sobrante de setenta muestras de pacientes positivos para PCP. Cada muestra se analizará para ver si el genotipo de ADN coincide o es similar con otras muestras de pacientes que hemos analizado, lo que ayudará a comprender cómo la PCP puede transmitirse entre pacientes.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Criterios de inclusión:
- Extractos totales de ácido nucleico de pacientes adultos (mayores de 18 años) con un diagnóstico positivo de PCP (y detectado en > 50 copias/10 ul) a partir de pruebas de panel respiratorio de rutina.
Criterio de exclusión:
- Extractos totales de ácido nucleico de pacientes con diagnóstico negativo de PCP a partir de pruebas de panel respiratorio de rutina
- Extractos totales de ácidos nucleicos de pacientes no adultos (menores de 18 años).
- Muestras de extractos nucleicos totales positivas para PCP con < 50 copias/10 ul.
- Pacientes incluidos en el registro nacional de exclusión voluntaria del Reino Unido
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Objetivo 1: Desarrollo de un ensayo de genotipado de PCP MLST dentro de NUH.
Periodo de tiempo: 18 meses
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Se evaluará el esquema MLST publicado anteriormente por Pasic et al (2020) que utiliza los alelos β-TUB, CYB, mt26S y SOD, y cada alelo se optimizará y verificará para su implementación en el Objetivo 2.
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18 meses
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Objetivo 2: Analizar muestras de pacientes positivos para PCP e identificar el genotipo de PCP, evaluando los vínculos entre los metadatos del paciente y el genotipo.
Periodo de tiempo: 18 meses
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Tras la implementación exitosa del ensayo MLST, se analizarán hasta 70 muestras de ácido nucleico total positivas para PCP mediante el ensayo MLST.
Se identificarán genotipos y se realizarán análisis filogenéticos para evaluar la relación de la población.
A partir de esto, evaluaremos posibles eventos de transmisión entre pacientes utilizando metadatos de pacientes y movimientos de camas de hospital/visitas a la clínica.
Además, el análisis de datos ayudará a comprender si ciertos genotipos de PCP tienen más probabilidades de ocurrir en grupos de pacientes específicos y si existen vínculos con la gravedad, la mortalidad y la transmisión de la enfermedad.
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18 meses
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Estimado)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- 23PA004
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
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