Genotipagem de Pneumocystis Jirovecii
Genotipagem de Pneumocystis Jirovecii em tempo real para apoiar a tomada de decisões clínicas no tratamento de surtos nosocomiais
Compartilhamos nossas vidas com microorganismos, e estes geralmente não representam um problema se um indivíduo for saudável e com um sistema imunológico normal. No entanto, se o sistema imunológico não estiver funcionando adequadamente (por exemplo, pacientes com câncer), eles correm o risco de infecção. Um microrganismo, um fungo chamado Pneumocystis jirovecii (PCP), pode causar infecções respiratórias graves em pacientes sem sistema imunológico funcionando adequadamente, levando à hospitalização e à morte se não for tratado. Se os pacientes permanecerem sem um sistema imunológico funcionando, eles terão uma chance maior de infecções repetidas.
O PCP se espalha pelo ar de pessoa para pessoa e pode sobreviver em superfícies ambientais. Os pacientes podem ser infectados após contato com essas superfícies. Os hospitais têm a responsabilidade de garantir que os pacientes infectados com PCP não a transmitam a outros pacientes doentes. Nos casos em que o PCP infectou vários pacientes, saber se o mesmo fungo foi transmitido (ou transmitido) de paciente para paciente é vital para compreender se há um surto no hospital. Compreender o quão semelhante (a relação) é a cepa PCP permite que os profissionais de saúde detectem qualquer transmissão entre pacientes ou o ambiente.
Para entender o quão relacionada está a infecção por PCP de cada paciente, utilizaremos um teste laboratorial denominado tipagem de sequência multilocus (MLST). Este teste analisa seções do código genético dos fungos usando sequenciamento de ácido desoxirribonucléico (DNA) para criar um código (genótipo) que nos diz o quão relacionado um PCP está com outros testados, permitindo a comparação entre pacientes e, em última análise, detectando a transmissão.
Nosso objetivo é desenvolver este teste de sequenciamento usando amostras de pacientes positivas para PCP e garantir que ele funcione de acordo com padrões de alta qualidade. O material excedente de setenta amostras conhecidas de pacientes positivos para PCP será testado. Cada amostra será analisada para verificar se o genótipo do DNA corresponde ou é semelhante a outras amostras de pacientes que testamos, ajudando a compreender como o PCP pode se espalhar entre os pacientes.
Visão geral do estudo
Status
Condições
Descrição detalhada
Compartilhamos nossas vidas com microorganismos, e estes geralmente não representam um problema se um indivíduo for saudável e com um sistema imunológico normal. No entanto, se o sistema imunológico não estiver funcionando adequadamente (por exemplo, pacientes com câncer), eles correm o risco de infecção. Um microrganismo, um fungo chamado Pneumocystis jirovecii (PCP), pode causar infecções respiratórias graves em pacientes sem sistema imunológico funcionando adequadamente, levando à hospitalização e à morte se não for tratado. Se os pacientes permanecerem sem um sistema imunológico funcionando, eles terão uma chance maior de infecções repetidas.
O PCP se espalha pelo ar de pessoa para pessoa e pode sobreviver em superfícies ambientais. Os pacientes podem ser infectados após contato com essas superfícies. Os hospitais têm a responsabilidade de garantir que os pacientes infectados com PCP não a transmitam a outros pacientes doentes. Nos casos em que o PCP infectou vários pacientes, saber se o mesmo fungo foi transmitido (ou transmitido) de paciente para paciente é vital para compreender se há um surto no hospital. Compreender o quão semelhante (a relação) é a cepa PCP permite que os profissionais de saúde detectem qualquer transmissão entre pacientes ou o ambiente.
Para entender o quão relacionada está a infecção por PCP de cada paciente, utilizaremos um teste laboratorial denominado tipagem de sequência multilocus (MLST). Este teste analisa seções do código genético dos fungos usando sequenciamento de ácido desoxirribonucléico (DNA) para criar um código (genótipo) que nos diz o quão relacionado um PCP está com outros testados, permitindo a comparação entre pacientes e, em última análise, detectando a transmissão.
Nosso objetivo é desenvolver este teste de sequenciamento usando amostras de pacientes positivas para PCP e garantir que ele funcione de acordo com padrões de alta qualidade. O material excedente de setenta amostras conhecidas de pacientes positivos para PCP será testado. Cada amostra será analisada para verificar se o genótipo do DNA corresponde ou é semelhante a outras amostras de pacientes que testamos, ajudando a compreender como o PCP pode se espalhar entre os pacientes.
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Extratos totais de ácidos nucleicos de pacientes adultos (acima de 18 anos) com diagnóstico positivo de PCP (e detectado em > 50 cópias/10ul) em testes de painel respiratório de rotina.
Critério de exclusão:
- Extratos totais de ácidos nucleicos de pacientes com diagnóstico negativo de PCP em testes respiratórios de rotina
- Extratos totais de ácidos nucleicos de pacientes não adultos (menores de 18 anos).
- Amostras de extrato nucleico total positivas para PCP com < 50 cópias/10ul.
- Pacientes incluídos no registro nacional de opt-out do Reino Unido
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Objetivo 1: Desenvolvimento de um ensaio de genotipagem MLST PCP dentro do NUH.
Prazo: 18 meses
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O esquema MLST publicado anteriormente por Pasic et al (2020) usando os alelos β-TUB, CYB, mt26S e SOD será avaliado, com cada alelo otimizado e verificado para implementação para o Objetivo 2.
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18 meses
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Objetivo 2: Analisar amostras positivas de pacientes para PCP e identificar o genótipo de PCP, avaliando as ligações entre os metadados do paciente e o genótipo
Prazo: 18 meses
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Após a implementação bem-sucedida do ensaio MLST, até 70 amostras de ácidos nucleicos totais positivos para PCP serão testadas usando o ensaio MLST.
Os genótipos serão identificados e análises filogenéticas realizadas para avaliar o parentesco da população.
A partir disso, avaliaremos possíveis eventos de transmissão entre pacientes usando metadados de pacientes e movimentos de leitos hospitalares/visitas clínicas.
Além disso, a análise dos dados ajudará a compreender se determinados genótipos de PCP são mais prováveis de ocorrer em grupos específicos de pacientes e se existem ligações com a gravidade, mortalidade e transmissão da doença.
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18 meses
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Estimado)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 23PA004
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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