Genotypisierung von Pneumocystis Jirovecii

Wir teilen unser Leben mit Mikroorganismen, und diese stellen im Allgemeinen kein Problem dar, wenn eine Person gesund ist und über ein normales Immunsystem verfügt. Wenn das Immunsystem jedoch nicht richtig funktioniert (z. B. bei Krebspatienten), besteht für sie das Risiko einer Infektion. Ein Mikroorganismus, ein Pilz namens Pneumocystis jirovecii (PCP), kann bei Patienten ohne ordnungsgemäß funktionierendes Immunsystem schwere Brustinfektionen verursachen, die unbehandelt zu Krankenhausaufenthalten und zum Tod führen. Wenn Patienten kein funktionierendes Immunsystem haben, ist die Wahrscheinlichkeit einer erneuten Infektion größer.

PCP verbreitet sich über die Luft von Mensch zu Mensch und kann auf Umweltoberflächen überleben. Patienten können sich nach Kontakt mit diesen Oberflächen infizieren. Krankenhäuser sind dafür verantwortlich, sicherzustellen, dass PCP-infizierte Patienten das Virus nicht an andere erkrankte Patienten weitergeben. In Fällen, in denen PCP mehrere Patienten infiziert hat, ist es wichtig zu wissen, ob derselbe Pilz von Patient zu Patient weitergegeben (oder übertragen) wurde, um zu verstehen, ob es im Krankenhaus zu einem Ausbruch kommt. Das Verständnis, wie ähnlich (die Verwandtschaft) der PCP-Stamm ist, ermöglicht es dem Gesundheitspersonal, jede Übertragung zwischen Patienten oder der Umgebung zu erkennen.

Um zu verstehen, in welchem ​​Zusammenhang die PCP-Infektion jedes Patienten steht, werden wir einen Labortest namens Multilocus Sequence Typing (MLST) durchführen. Dieser Test untersucht Abschnitte des genetischen Codes des Pilzes mithilfe von Desoxyribonukleinsäure (DNA)-Sequenzierung, um einen Code (Genotyp) zu erstellen, der uns sagt, wie verwandt ein PCP mit anderen getesteten ist, was einen Vergleich zwischen Patienten und letztendlich die Erkennung einer Übertragung ermöglicht.

Unser Ziel ist es, diesen Sequenzierungstest anhand von PCP-positiven Patientenproben zu entwickeln und sicherzustellen, dass er hohen Qualitätsstandards entspricht. Überschüssiges Material von siebzig bekannten PCP-positiven Patientenproben wird getestet. Jede Probe wird analysiert, um festzustellen, ob der DNA-Genotyp mit anderen von uns getesteten Patientenproben übereinstimmt oder ihnen ähnelt. Dies hilft zu verstehen, wie sich PCP zwischen Patienten ausbreiten kann.