糖尿病患者の足の創傷および骨炎におけるブドウ球菌ペッテンコフェリの病原性因子 (PETTENK-OS)
糖尿病患者の足の創傷および骨炎におけるブドウ球菌ペッテンコフェリの病原性因子の評価。 PETTENK-OS 研究
調査の概要
状態
条件
詳細な説明
グラム陽性球菌、特に黄色ブドウ球菌およびコアグラーゼ陰性ブドウ球菌(SCoN)は、糖尿病性足部潰瘍から最も頻繁に分離される細菌です。 これらの創傷の好ましくない進行における黄色ブドウ球菌の役割に関する研究は行われてきたが、SCoN の役割に焦点を当てた研究はなかった。 50 種類ほどの SCoN 種のうち、すべてが同じ毒性潜在力を持っているわけではありません。 ブドウ球菌ペッテンコフェリの役割は不明です。 しかし、この細菌は糖尿病性足潰瘍で 7 番目に多く同定されており、これらの感染症の病態生理学にも関与している可能性があることが示唆されています。 Loetscheらの研究では、標的16S rDNA配列決定による糖尿病性足部潰瘍サンプル349件のマイクロバイオームの研究では、黄色ブドウ球菌13.3%、ペッテンコフェリブドウ球菌5.3%を含む相対存在量22.8%で、ブドウ球菌属が最も豊富であることが示された。
ニーム大学病院では、この細菌は主に研究室の糖尿病性足部潰瘍または骨炎のサンプルで同定されています(2018年から2022年の間にこの細菌から分離された167件のうち、糖尿病性足部潰瘍のサンプルから89件のS.ペッテンコフェリが分離されました)。慢性創傷の管理は、存在する細菌のほぼ 80% がバイオフィルム内に存在するという事実にもあります。 また、細菌が存在する環境、特に細菌同士の間で確立される相互作用が、創傷治癒の遅れに重要な役割を果たしていることが証明されています。 したがって、これらの細菌の相互作用を支配するメカニズムを理解し、これらの細菌の真の病原性の可能性を確立することが不可欠です。
最近、私たちのチームは、糖尿病患者の足の骨炎から分離された S. ペッテンコフェリ (SP165) 株が実際の毒性の可能性を持っていることを実証しました。 SP165 は、バイオフィルムを生成できるだけでなく、ヒトの血液、ヒトのケラチノサイト、マウスおよびヒトのマクロファージ中でも生存することができました。 また、ゼブラフィッシュ モデルにおいて顕著な胎児死亡率を引き起こすことにより、その毒性も実証されました。
その後、ニーム大学病院からの 29 株の分離株を対象とした 2 回目の研究で、異なる毒性を持つ 2 つの主要なクローンの存在が実証されました。
この株パネルの表現型およびゲノム分析により、3 つのバイオフィルム生成プロファイル (急速かつ高度にバイオフィルム生成、ゆっくりとバイオフィルム生成、および非バイオフィルム生成) および 2 つのゼブラフィッシュ毒性プロファイル (高度および中程度の致死性) が報告されました。 耐性、毒性、バイオフィルム生成に関する遺伝子もゲノム上で見つかりました。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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Gard
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Nîmes、Gard、フランス、30029
- Nîmes University Hospital
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-
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- スタフィロコッカス ペッテンコフェリ株の既製コレクションに関するこの研究には適用されません
除外基準:
- スタフィロコッカス ペッテンコフェリ株の既製コレクションに関するこの研究には適用されません
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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骨炎および非糖尿病性創傷、血液培養および鼻腔から分離されたブドウ球菌ペッテンコフェリ株の遺伝的多様性。
時間枠:0日目~3か月目
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すべての S. ペッテンコフェリ株の細菌ゲノムの完全な配列決定によるタイピングと系統距離 (全ゲノムおよびコア ゲノムの一塩基多型) の分析によって推定されたクレードの数。
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0日目~3か月目
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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骨炎および非糖尿病性創傷、血液培養および鼻腔から分離されたブドウ球菌ペッテンコフェリ株の遺伝的多様性。
時間枠:3~6ヶ月
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すべてのブドウ球菌ペッテンコフェリ株の細菌ゲノムの完全な配列決定と系統学的距離の分析によるタイピングによって推定されたクレードの数。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団内のレジストーム:骨炎
時間枠:3~6ヶ月
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抗生物質耐性遺伝子 (レジトーム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団の耐性: 非糖尿病性創傷
時間枠:3~6ヶ月
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抗生物質耐性遺伝子 (レジトーム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団の耐性: 糖尿病性創傷
時間枠:3~6ヶ月
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抗生物質耐性遺伝子 (レジトーム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団の耐性: 血液培養
時間枠:3~6ヶ月
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抗生物質耐性遺伝子 (レジトーム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団の耐性: 鼻腔
時間枠:3~6ヶ月
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抗生物質耐性遺伝子 (レジトーム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団内のウイルスローム: 骨炎
時間枠:3~6ヶ月
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病原性遺伝子 (ビルローム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団内のウイルスローム: 非糖尿病性創傷
時間枠:3~6ヶ月
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病原性遺伝子 (ビルローム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団内のウイルスローム: 糖尿病性創傷
時間枠:3~6ヶ月
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病原性遺伝子 (ビルローム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団内のウイルスローム: 血液培養
時間枠:3~6ヶ月
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病原性遺伝子 (ビルローム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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サンプル起源に応じた株集団内のウイルスローム: 鼻腔
時間枠:3~6ヶ月
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病原性遺伝子 (ビルローム) の存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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株集団内のプラスミドおよびサンプル起源に応じたプラスミド: 骨炎
時間枠:3~6ヶ月
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プラスミドの存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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株集団内のプラスミドおよびサンプル起源に応じたプラスミド: 非糖尿病性創傷
時間枠:3~6ヶ月
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プラスミドの存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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株集団内のプラスミドおよびサンプル起源別: 糖尿病性創傷
時間枠:3~6ヶ月
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プラスミドの存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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株集団内のプラスミドおよびサンプル起源に応じたプラスミド: 血液培養
時間枠:3~6ヶ月
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プラスミドの存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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株集団内のプラスミドおよびサンプル起源に応じたプラスミド: 鼻腔
時間枠:3~6ヶ月
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プラスミドの存在は、配列決定された細菌ゲノムのバイオインフォマティクス分析によって特定されます。
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3~6ヶ月
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85株のサブサンプルにおける集団の表現型耐性プロファイル
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の最小発育阻止濃度が記録されます (分離株のアンチバイオグラム)。これらのアンチバイオグラムは、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなどの新規に販売された分子または現行の分子について確立されます。
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6~14ヶ月
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集団およびサンプル起源に応じた表現型耐性プロファイル: 骨炎
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の最小発育阻止濃度 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらのアンチバイオグラムは、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなどの新規に販売された分子または現行の分子に対して確立されます。
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6~14ヶ月
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集団およびサンプル起源に応じた表現型耐性プロファイル: 非糖尿病性創傷
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の最小発育阻止濃度 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらのアンチバイオグラムは、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなどの新規に販売された分子または現行の分子に対して確立されます。
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6~14ヶ月
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集団およびサンプル起源に応じた表現型耐性プロファイル: 糖尿病性創傷
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の最小発育阻止濃度 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらのアンチバイオグラムは、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなどの新規に販売された分子または現行の分子に対して確立されます。
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6~14ヶ月
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集団およびサンプル起源に応じた表現型耐性プロファイル: 血液培養
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の最小発育阻止濃度 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらのアンチバイオグラムは、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなどの新規に販売された分子または現行の分子に対して確立されます。
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6~14ヶ月
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集団およびサンプル起源に応じた表現型耐性プロファイル: 鼻腔
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の最小発育阻止濃度 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらのアンチバイオグラムは、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなどの新規に販売された分子または現行の分子に対して確立されます。
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6~14ヶ月
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サンプル起源に応じた S. ペッテンコフェリ株の選択 (85 サブサンプル) における抗生物質の非存在下および存在下でのバイオフィルム形成量: 骨炎
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の存在下または非存在下でのバイオフィルム形成指数 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらの抗生物質は、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなど、新規に市販された分子または現行の分子になります。
結果は、0 = バイオフィルムあり、12 = バイオフィルムなしの範囲のスケールで記録されます。
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6~14ヶ月
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サンプル起源に応じた S. ペッテンコフェリ株の選択 (85 サブサンプル) における抗生物質の非存在下および存在下でのバイオフィルム形成量: 非糖尿病性創傷
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の存在下または非存在下でのバイオフィルム形成指数 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらの抗生物質は、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなど、新規に市販された分子または現行の分子になります。
結果は、0 = バイオフィルムあり、12 = バイオフィルムなしの範囲のスケールで記録されます。
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6~14ヶ月
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サンプル起源に応じた S. ペッテンコフェリ株の選択 (85 サブサンプル) における抗生物質の非存在下および存在下でのバイオフィルム形成量: 糖尿病性創傷
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の存在下または非存在下でのバイオフィルム形成指数 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらの抗生物質は、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなど、新規に市販された分子または現行の分子になります。
結果は、0 = バイオフィルムあり、12 = バイオフィルムなしの範囲のスケールで記録されます。
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6~14ヶ月
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サンプル起源に応じた S. ペッテンコフェリ株の選択 (85 サブサンプル) における抗生物質の非存在下および存在下でのバイオフィルム形成量: 血液培養
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の存在下または非存在下でのバイオフィルム形成指数 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらの抗生物質は、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなど、新規に市販された分子または現行の分子になります。
結果は、0 = バイオフィルムあり、12 = バイオフィルムなしの範囲のスケールで記録されます。
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6~14ヶ月
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サンプル起源: 鼻腔に応じた S. ペッテンコフェリ株の選択 (85 サブサンプル) における抗生物質の非存在下および存在下でのバイオフィルム形成量
時間枠:6~14ヶ月
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一連の抗生物質の存在下または非存在下でのバイオフィルム形成指数 (分離株のアンチバイオグラム)。
これらの抗生物質は、セフタロリン、セフトビプロール、ダルババンシン、デラフロキサシン、テジゾリド、オリタバンシンなど、新規に市販された分子または現行の分子になります。
結果は、0 = バイオフィルムあり、12 = バイオフィルムなしの範囲のスケールで記録されます。
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6~14ヶ月
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20 菌株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた細菌増殖率: 骨炎
時間枠:6~14ヶ月
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経時的に細菌培養物の吸光度を測定することによる細菌増殖曲線。
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6~14ヶ月
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20 菌株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた細菌増殖率: 非糖尿病性創傷
時間枠:6~14ヶ月
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経時的に細菌培養物の吸光度を測定することによる細菌増殖曲線。
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6~14ヶ月
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20 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた細菌増殖率: 糖尿病性創傷
時間枠:6~14ヶ月
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経時的に細菌培養物の吸光度を測定することによる細菌増殖曲線。
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6~14ヶ月
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20 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた細菌増殖率: 血液培養
時間枠:6~14ヶ月
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経時的に細菌培養物の吸光度を測定することによる細菌増殖曲線。
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6~14ヶ月
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20 菌株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた細菌増殖速度: 鼻腔内輸送
時間枠:6~14ヶ月
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経時的に細菌培養物の吸光度を測定することによる細菌増殖曲線。
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6~14ヶ月
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3 つの菌株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 骨炎
時間枠:6~14ヶ月
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In vitro 骨芽細胞培養モデル (MC3T3-E1) における LDH の内在化および放出の速度 (細菌分離株の細胞毒性の兆候)
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6~14ヶ月
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3 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 骨炎由来の S. ペッテンコフェリ株の細胞内細菌増殖
時間枠:6~14ヶ月
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細胞内細菌増殖の量は、in vitro マクロファージ細胞培養モデル (RAW 264.7) で評価されます。
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6~14ヶ月
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3 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 糖尿病性創傷
時間枠:6~14ヶ月
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In vitro 骨芽細胞培養モデル (MC3T3-E1) における LDH の内在化および放出の速度 (細菌分離株の細胞毒性の兆候)
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6~14ヶ月
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3 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 糖尿病性創傷からの S. ペッテンコフェリ株の細胞内細菌増殖
時間枠:6~14ヶ月
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細胞内細菌増殖の量は、in vitro マクロファージ細胞培養モデル (RAW 264.7) で評価されます。
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6~14ヶ月
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3 つの菌株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 血液培養
時間枠:6~14ヶ月
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In vitro 骨芽細胞培養モデル (MC3T3-E1) における LDH の内在化および放出の速度 (細菌分離株の細胞毒性の兆候)
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6~14ヶ月
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3 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 血液培養からの S. ペッテンコフェリ株の細胞内細菌増殖
時間枠:6~14ヶ月
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細胞内細菌増殖の量は、in vitro マクロファージ細胞培養モデル (RAW 264.7) で評価されます。
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6~14ヶ月
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3 つの菌株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 鼻腔
時間枠:6~14ヶ月
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In vitro 骨芽細胞培養モデル (MC3T3-E1) における LDH の内在化および放出の速度 (細菌分離株の細胞毒性の兆候)
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6~14ヶ月
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3 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 鼻腔由来の S. ペッテンコフェリ株の細胞内細菌増殖
時間枠:6~14ヶ月
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細胞内細菌増殖の量は、in vitro マクロファージ細胞培養モデル (RAW 264.7) で評価されます。
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6~14ヶ月
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3 株のサブサンプルのサンプル起源に応じた毒性プロファイル: S. ペッテンコフェリ株に浸漬した糖尿病ゼブラフィッシュの骨炎からの生存時間
時間枠:最大48時間
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48時間後の生存曲線
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最大48時間
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3 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 非糖尿病性創傷からの S. ペッテンコフェリ株に浸漬された糖尿病ゼブラフィッシュの生存時間
時間枠:最大48時間
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48時間後の生存曲線
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最大48時間
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3 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 糖尿病性創傷からの S. ペッテンコフェリ株に浸漬された糖尿病性ゼブラフィッシュの生存時間
時間枠:最大48時間
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48時間後の生存曲線
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最大48時間
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3 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 血液培養からの S. ペッテンコフェリ株に浸漬された糖尿病ゼブラフィッシュの生存時間
時間枠:最大48時間
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48時間後の生存曲線
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最大48時間
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3 株のサブサンプルにおけるサンプル起源に応じた毒性プロファイル: 鼻腔由来の S. ペッテンコフェリ株に浸漬した糖尿病ゼブラフィッシュの生存時間
時間枠:最大48時間
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48時間後の生存曲線
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最大48時間
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協力者と研究者
協力者
捜査官
- 主任研究者:Chloé MAGNAN, Dr.、Nîmes University Hospital, France
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。