糖尿病患者足部伤口和骨炎中佩氏葡萄球菌的致病因素 (PETTENK-OS)
糖尿病患者足部伤口和骨炎中佩氏葡萄球菌致病因素的评价。 PETTENK-OS 研究
研究概览
地位
条件
详细说明
革兰氏阳性球菌,特别是金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性葡萄球菌 (SCoN),是最常从糖尿病足溃疡中分离到的细菌。 虽然已经对金黄色葡萄球菌在这些伤口的不利演变中的作用进行了研究,但没有研究关注 SCoN 的作用。 在大约 50 种 SCoN 物种中,并非所有物种都具有相同的潜在毒力。 佩氏葡萄球菌的作用尚不清楚。 然而,这种细菌是糖尿病足溃疡中第七常见的细菌,表明它也可能参与这些感染的病理生理学。 在 Loetsche 等人的工作中。通过靶向16S rDNA测序对349份糖尿病足溃疡样本的微生物组进行研究表明,葡萄球菌属最为丰富,相对丰度为22.8%,其中金黄色葡萄球菌为13.3%,佩滕科费里葡萄球菌为5.3%。
在尼姆大学医院,我们实验室的糖尿病足溃疡或骨炎样本中主要发现了这种细菌(2018 年至 2022 年间,从糖尿病足溃疡样本中分离出了 167 份 S. pettenkoferi 细菌)。管理慢性伤口还在于,几乎 80% 的细菌存在于生物膜中。 人们还发现,细菌所处的环境,特别是它们之间建立的相互作用,在伤口愈合延迟中发挥着重要作用。 因此,有必要了解控制这些细菌相互作用的机制并确定这些细菌的真正致病潜力。
最近,我们的团队证明从糖尿病患者足部骨炎中分离出的一株 S. pettenkoferi (SP165) 具有真正的毒力潜力。 除了能够产生生物膜外,SP165 还能够在人类血液、人类角质形成细胞以及小鼠和人类巨噬细胞中存活。 它还通过在斑马鱼模型中引起显着的胚胎死亡来证明其毒力。
随后对尼姆大学医院的 29 个分离株进行的第二项研究证明存在两种具有不同毒力的主要克隆。
通过对这组菌株的表型和基因组分析,报告了三种生物膜生产概况(快速和高度生物膜生产、缓慢生物膜生产和非生物膜生产)和两种斑马鱼毒力概况(高度和中度致死)。 在它们的基因组上也发现了抗性、毒力和生物膜产生的基因。
研究类型
注册 (实际的)
联系人和位置
学习地点
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Gard
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Nîmes、Gard、法国、30029
- Nîmes University Hospital
-
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 孩子
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 不适用于对已配制好的佩氏葡萄球菌菌株的研究
排除标准:
- 不适用于对已配制好的佩氏葡萄球菌菌株的研究
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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从骨炎和非糖尿病伤口、血培养和鼻腔携带中分离出的佩氏葡萄球菌菌株的遗传多样性。
大体时间:第 0 至 3 个月
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通过对所有 S. pettenkoferi 菌株的细菌基因组进行完整测序和系统发育距离分析(全基因组和核心基因组单核苷酸多态性)进行分型来估计进化枝数量。
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第 0 至 3 个月
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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从骨炎和非糖尿病伤口、血培养和鼻腔携带中分离出的佩氏葡萄球菌菌株的遗传多样性。
大体时间:3-6个月
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通过对所有 Pettenkoferi 葡萄球菌菌株的细菌基因组进行完整测序和系统发育距离分析进行分型来估计进化枝数量。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的抵抗组:骨炎
大体时间:3-6个月
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抗生素抗性基因(resistome)的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的抵抗力:非糖尿病伤口
大体时间:3-6个月
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抗生素抗性基因(resistome)的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的抵抗力:糖尿病伤口
大体时间:3-6个月
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抗生素抗性基因(resistome)的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的抵抗组:血培养
大体时间:3-6个月
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抗生素抗性基因(resistome)的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的抵抗组:鼻腔携带
大体时间:3-6个月
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抗生素抗性基因(resistome)的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的病毒组:骨炎
大体时间:3-6个月
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通过对已测序的细菌基因组进行生物信息学分析,可以鉴定毒力基因(病毒组)的存在。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的病毒组:非糖尿病伤口
大体时间:3-6个月
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通过对已测序的细菌基因组进行生物信息学分析,可以鉴定毒力基因(病毒组)的存在。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的病毒组:糖尿病伤口
大体时间:3-6个月
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通过对已测序的细菌基因组进行生物信息学分析,可以鉴定毒力基因(病毒组)的存在。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的病毒组:血培养
大体时间:3-6个月
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通过对已测序的细菌基因组进行生物信息学分析,可以鉴定毒力基因(病毒组)的存在。
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3-6个月
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根据样本来源的菌株群体中的病毒组:鼻携带
大体时间:3-6个月
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通过对已测序的细菌基因组进行生物信息学分析,可以鉴定毒力基因(病毒组)的存在。
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3-6个月
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菌株群体中的质粒和根据样本来源:骨炎
大体时间:3-6个月
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质粒的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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菌株群体中的质粒和根据样本来源:非糖尿病伤口
大体时间:3-6个月
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质粒的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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菌株群体中的质粒和根据样本来源:糖尿病伤口
大体时间:3-6个月
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质粒的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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菌株群体中的质粒和根据样本来源:血培养
大体时间:3-6个月
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质粒的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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菌株群体中的质粒和根据样品来源:鼻携带
大体时间:3-6个月
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质粒的存在将通过对测序的细菌基因组进行生物信息学分析来鉴定。
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3-6个月
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85 个菌株子样本中群体的表型抗性概况
大体时间:6 - 14 个月
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将记录一系列抗生素的最低抑菌浓度(分离株的抗菌谱)。这些抗菌谱将基于新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
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6 - 14 个月
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人群中的表型耐药性概况以及根据样本来源:骨炎
大体时间:6 - 14 个月
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一系列抗生素的最低抑菌浓度(分离株的抗菌谱)。
这些抗菌谱将基于新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
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6 - 14 个月
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人群中的表型耐药性概况以及根据样本来源:非糖尿病伤口
大体时间:6 - 14 个月
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一系列抗生素的最低抑菌浓度(分离株的抗菌谱)。
这些抗菌谱将基于新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
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6 - 14 个月
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人群中的表型耐药性概况以及根据样本来源:糖尿病伤口
大体时间:6 - 14 个月
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一系列抗生素的最低抑菌浓度(分离株的抗菌谱)。
这些抗菌谱将基于新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
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6 - 14 个月
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人群中的表型耐药性概况以及根据样本来源:血培养
大体时间:6 - 14 个月
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一系列抗生素的最低抑菌浓度(分离株的抗菌谱)。
这些抗菌谱将基于新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
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6 - 14 个月
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人群中的表型抗性概况以及根据样本来源:鼻腔携带
大体时间:6 - 14 个月
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一系列抗生素的最低抑菌浓度(分离株的抗菌谱)。
这些抗菌谱将基于新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
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6 - 14 个月
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根据样品来源,在不存在和存在抗生素的情况下选择的 S. pettenkoferi 菌株(85 个子样品)中的生物膜形成量:骨炎
大体时间:6 - 14 个月
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存在/不存在一系列抗生素时的生物膜形成指数(分离株的抗菌谱)。
这些抗生素将是新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
结果记录范围为 0 = 生物膜和 12 = 无生物膜
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6 - 14 个月
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根据样品来源:非糖尿病伤口,选择的 S. pettenkoferi 菌株(85 个子样品)中在不存在和存在抗生素的情况下生物膜形成的量
大体时间:6 - 14 个月
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存在/不存在一系列抗生素时的生物膜形成指数(分离株的抗菌谱)。
这些抗生素将是新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
结果记录范围为 0 = 生物膜和 12 = 无生物膜
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6 - 14 个月
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根据样品来源:糖尿病伤口,选择的 S. pettenkoferi 菌株(85 个子样品)中在不存在和存在抗生素的情况下生物膜形成的量
大体时间:6 - 14 个月
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存在/不存在一系列抗生素时的生物膜形成指数(分离株的抗菌谱)。
这些抗生素将是新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
结果记录范围为 0 = 生物膜和 12 = 无生物膜
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6 - 14 个月
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根据样本来源:血培养,选择 S. pettenkoferi 菌株(85 个子样本),在不存在和存在抗生素的情况下生物膜形成量
大体时间:6 - 14 个月
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存在/不存在一系列抗生素时的生物膜形成指数(分离株的抗菌谱)。
这些抗生素将是新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
结果记录范围为 0 = 生物膜和 12 = 无生物膜
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6 - 14 个月
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根据样品来源,在不存在和存在抗生素的情况下选择的 S. pettenkoferi 菌株(85 个子样本)中的生物膜形成量:鼻腔运输
大体时间:6 - 14 个月
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存在/不存在一系列抗生素时的生物膜形成指数(分离株的抗菌谱)。
这些抗生素将是新上市或现有的分子,如头孢洛林、头孢比普罗、达巴万星、德拉沙星、泰地唑胺和奥利万星。
结果记录范围为 0 = 生物膜和 12 = 无生物膜
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6 - 14 个月
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20 株子样本中根据样本来源的细菌生长率:骨炎
大体时间:6 - 14 个月
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通过测量细菌培养物随时间的吸光度来绘制细菌生长曲线。
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6 - 14 个月
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20 株子样本中根据样本来源的细菌生长率:非糖尿病伤口
大体时间:6 - 14 个月
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通过测量细菌培养物随时间的吸光度来绘制细菌生长曲线。
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6 - 14 个月
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20 株子样本中根据样本来源的细菌生长率:糖尿病伤口
大体时间:6 - 14 个月
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通过测量细菌培养物随时间的吸光度来绘制细菌生长曲线。
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6 - 14 个月
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20 个菌株的子样本中根据样本来源的细菌生长率:血培养
大体时间:6 - 14 个月
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通过测量细菌培养物随时间的吸光度来绘制细菌生长曲线。
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6 - 14 个月
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20 株子样本中根据样本来源的细菌生长率:鼻腔携带
大体时间:6 - 14 个月
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通过测量细菌培养物随时间的吸光度来绘制细菌生长曲线。
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6 - 14 个月
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根据 3 个菌株的子样本中样本来源的毒力概况:骨炎
大体时间:6 - 14 个月
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体外成骨细胞培养模型 (MC3T3-E1) 中 LDH 的内化和释放速率(细菌分离物的细胞毒性标志)
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6 - 14 个月
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根据 3 个菌株的子样本中样本来源的毒力概况:来自骨炎的 S. pettenkoferi 菌株的细胞内细菌增殖
大体时间:6 - 14 个月
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将在体外巨噬细胞培养模型(RAW 264.7)中评估细胞内细菌增殖的量。
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6 - 14 个月
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根据 3 种菌株的子样本中样本来源的毒力概况:糖尿病伤口
大体时间:6 - 14 个月
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体外成骨细胞培养模型 (MC3T3-E1) 中 LDH 的内化和释放速率(细菌分离物的细胞毒性标志)
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6 - 14 个月
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根据 3 个菌株的子样本中样本来源的毒力概况:来自糖尿病伤口的 S. pettenkoferi 菌株的细胞内细菌增殖
大体时间:6 - 14 个月
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将在体外巨噬细胞培养模型(RAW 264.7)中评估细胞内细菌增殖的量。
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6 - 14 个月
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根据 3 种菌株的子样本中样本来源的毒力概况:血培养
大体时间:6 - 14 个月
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体外成骨细胞培养模型 (MC3T3-E1) 中 LDH 的内化和释放速率(细菌分离物的细胞毒性标志)
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6 - 14 个月
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根据 3 个菌株的子样本中的样本来源的毒力概况:来自血培养物的 S. pettenkoferi 菌株的细胞内细菌增殖
大体时间:6 - 14 个月
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将在体外巨噬细胞培养模型(RAW 264.7)中评估细胞内细菌增殖的量。
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6 - 14 个月
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根据 3 株子样本中样本来源的毒力概况:鼻携带
大体时间:6 - 14 个月
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体外成骨细胞培养模型 (MC3T3-E1) 中 LDH 的内化和释放速率(细菌分离物的细胞毒性标志)
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6 - 14 个月
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根据 3 个菌株的子样本中的样本来源的毒力概况:鼻腔携带的 S. pettenkoferi 菌株的细胞内细菌增殖
大体时间:6 - 14 个月
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将在体外巨噬细胞培养模型(RAW 264.7)中评估细胞内细菌增殖的量。
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6 - 14 个月
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根据 3 个菌株的子样本中的样本来源的毒力概况:浸入骨炎 S. pettenkoferi 菌株中的糖尿病斑马鱼的存活时间
大体时间:最长 48 小时
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48小时生存曲线
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最长 48 小时
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根据 3 个菌株的子样本中的样本来源的毒力概况:浸入来自非糖尿病伤口的 S. pettenkoferi 菌株中的糖尿病斑马鱼的存活时间
大体时间:最长 48 小时
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48小时生存曲线
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最长 48 小时
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根据 3 个菌株的子样本中的样本来源的毒力概况:浸入来自糖尿病伤口的 S. pettenkoferi 菌株中的糖尿病斑马鱼的存活时间
大体时间:最长 48 小时
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48小时生存曲线
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最长 48 小时
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根据 3 个菌株的子样本中的样本来源的毒力概况:浸入来自血培养的 S. pettenkoferi 菌株中的糖尿病斑马鱼的存活时间
大体时间:最长 48 小时
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48小时生存曲线
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最长 48 小时
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根据 3 个菌株的子样本中的样本来源的毒力概况:浸入来自鼻腔的 S. pettenkoferi 菌株中的糖尿病斑马鱼的存活时间
大体时间:最长 48 小时
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48小时生存曲线
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最长 48 小时
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合作者和调查者
合作者
调查人员
- 首席研究员:Chloé MAGNAN, Dr.、Nîmes University Hospital, France
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
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