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Facteurs de pathogénicité de Staphylococcus Pettenkoferi dans les plaies du pied et l'ostéite chez les patients diabétiques (PETTENK-OS)

14 novembre 2025 mis à jour par: Centre Hospitalier Universitaire de Nīmes

Évaluation des facteurs de pathogénicité de Staphylococcus Pettenkoferi dans les plaies du pied et l'ostéite chez les patients diabétiques. L'étude PETTENK-OS

Les coques à Gram positif, en particulier Staphylococcus aureus et les staphylocoques à coagulase négative (SCoN), sont les bactéries les plus fréquemment isolées des ulcères du pied diabétique. Bien que des études aient été réalisées sur le rôle de S. aureus dans l'évolution défavorable de ces plaies, aucune étude ne s'est concentrée sur le rôle du SCoN. Parmi la cinquantaine d’espèces de SCoN, toutes n’ont pas le même potentiel de virulence. Le rôle de Staphylococcus pettenkoferi est inconnu, mais cette bactérie est la 7ème bactérie la plus fréquemment identifiée dans les ulcères du pied diabétique, ce qui suggère qu'elle pourrait également être impliquée dans la physiopathologie de ces infections. Au CHU de Nîmes, cette bactérie est principalement identifiée dans les prélèvements d'ulcères du pied diabétique ou d'ostéite dans notre laboratoire et 80% des bactéries présentes sont dans des biofilms. Il est essentiel de comprendre les mécanismes régissant ces interactions bactériennes et d'établir le véritable potentiel pathogène de ces bactéries. Récemment, l'équipe de Nîmes a montré qu'une souche de S. pettenkoferi (SP165) isolée d'une ostéite du pied chez un patient diabétique présentait un réel potentiel de virulence. SP165 pourrait non seulement produire un biofilm, mais pourrait également survivre dans le sang humain, les kératinocytes humains et les macrophages murins et humains. Cela a également provoqué une mortalité embryonnaire importante dans un modèle de poisson zèbre. Une seconde étude portant sur 29 isolats du CHU de Nîmes a ensuite démontré qu'il existait deux clones prédominants de virulences différentes. Trois profils de production de biofilm (rapidement et fortement producteur de biofilm, lentement producteur de biofilm et non-producteur de biofilm) et deux profils de poisson zèbre (fortement et modérément mortels) ont été rapportés par des analyses phénotypiques et génomiques sur ce panel de souches. Des gènes de résistance, de virulence et de production de biofilm ont également été trouvés sur leur génome.

Aperçu de l'étude

Statut

Actif, ne recrute pas

Les conditions

Ulcère du pied diabétique

Intervention / Traitement

Description détaillée

Au CHU de Nîmes, cette bactérie est identifiée principalement dans les échantillons d'ulcères du pied diabétique ou d'ostéite dans notre laboratoire (89 isolements de S. pettenkoferi à partir d'échantillons d'ulcères du pied diabétique sur 167 isolements réalisés de cette bactérie entre 2018 et 2022).La difficulté de la gestion des plaies chroniques réside aussi dans le fait que près de 80 % des bactéries présentes se trouvent dans des biofilms. Il a également été établi que l'environnement dans lequel se trouvent les bactéries, et notamment les interactions qu'elles établissent entre elles, jouent un rôle important dans le retard de cicatrisation des plaies. Il est donc essentiel de comprendre les mécanismes régissant ces interactions bactériennes et d’établir le véritable potentiel pathogène de ces bactéries.

Récemment, notre équipe a démontré qu’une souche de S. pettenkoferi (SP165) isolée d’une ostéite du pied chez un patient diabétique présentait un réel potentiel de virulence. En plus d'être capable de produire un biofilm, le SP165 était capable de survivre dans le sang humain, les kératinocytes humains et les macrophages murins et humains. Il a également démontré sa virulence en provoquant une mortalité embryonnaire importante dans le modèle du poisson zèbre.

Une seconde étude portant sur 29 isolats du CHU de Nîmes a ensuite démontré l'existence de deux clones prédominants de virulences différentes.

Trois profils de production de biofilm (producteur rapide et élevé de biofilm, producteur lent de biofilm et non producteur de biofilm) et deux profils de virulence du poisson zèbre (fortement et modérément mortels) ont été rapportés par des analyses phénotypiques et génomiques sur ce panel de souches. Des gènes de résistance, de virulence et de production de biofilm ont également été trouvés sur leur génome.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Réel)

230

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

France
- Gard
  - Nîmes, Gard, France, 30029
    - Nîmes University Hospital

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

Enfant
Adulte
Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

La collecte des souches sur le site du CHU de Nîmes auprès de 9 laboratoires européens collectés entre 2015 et 2023 pour un total de 108 mois a été réalisée entre novembre 2021 et août 2023.

La description

Critères d'intégration :

Non applicable pour cette recherche sur une collection déjà constituée de souches de Staphylococcus pettenkoferi

Critères d'exclusion :

Non applicable pour cette recherche sur une collection déjà constituée de souches de Staphylococcus pettenkoferi

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats	Description de la mesure	Délai
Diversité génétique des souches de Staphyloccocus pettenkoferi isolées d'ostéites et de plaies non diabétiques, d'hémocultures et de portage nasal. Délai: Jour 0 à 3 mois	Nombre de clades estimés par typage par séquençage complet des génomes bactériens de toutes les souches de S. pettenkoferi et analyse des distances phylogénétiques (génome entier et polymorphismes mononucléotidiques du génome central).	Jour 0 à 3 mois

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats	Description de la mesure	Délai
Diversité génétique des souches de Staphyloccocus pettenkoferi isolées d'ostéites et de plaies non diabétiques, d'hémocultures et de portage nasal. Délai: 3 à 6 mois	Nombre de clades estimés par typage par séquençage complet des génomes bactériens de toutes les souches de Staphylococcus pettenkoferi et analyse des distances phylogénétiques.	3 à 6 mois
Rérésistome dans la population de souches selon l'origine de l'échantillon : ostéite Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de résistance aux antibiotiques (résistome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Résistome dans la population de souches selon l'origine de l'échantillon : plaies non diabétiques Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de résistance aux antibiotiques (résistome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Rérésistome dans la population de souches selon l’origine de l’échantillon : plaies diabétiques Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de résistance aux antibiotiques (résistome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Rérésistome dans la population de souches selon l’origine de l’échantillon : hémocultures Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de résistance aux antibiotiques (résistome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Rérésistome dans la population de souches selon l'origine de l'échantillon : portage nasal Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de résistance aux antibiotiques (résistome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Virulome dans la population de souches selon l'origine de l'échantillon : ostéite Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de virulence (virulome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Virulome dans la population de souches selon l'origine de l'échantillon : plaies non diabétiques Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de virulence (virulome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Virulome dans la population de souches selon l'origine de l'échantillon : plaies diabétiques Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de virulence (virulome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Virulome dans la population de souches selon l'origine de l'échantillon : hémocultures Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de virulence (virulome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Virulome dans la population de souches selon l'origine de l'échantillon : portage nasal Délai: 3 à 6 mois	La présence de gènes de virulence (virulome) sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Plasmides dans la population de souches et selon l'origine de l'échantillon : ostéite Délai: 3 à 6 mois	La présence de plasmides sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Plasmides dans la population de souches et selon l'origine de l'échantillon : plaies non diabétiques Délai: 3 à 6 mois	La présence de plasmides sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Plasmides dans la population de souches et selon l'origine de l'échantillon : plaies diabétiques Délai: 3 à 6 mois	La présence de plasmides sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Plasmides dans la population de souches et selon l'origine de l'échantillon : hémocultures Délai: 3 à 6 mois	La présence de plasmides sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Plasmides dans la population de souches et selon l'origine de l'échantillon : portage nasal Délai: 3 à 6 mois	La présence de plasmides sera identifiée par analyse bioinformatique de génomes bactériens séquencés.	3 à 6 mois
Profils de résistance phénotypique dans la population dans un sous-échantillon de 85 souches Délai: 6 - 14 mois	La concentration minimale inhibitrice d'une série d'antibiotiques sera enregistrée (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiogrammes seront établis sur des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin.	6 - 14 mois
Profils phénotypiques de résistance dans la population et selon l’origine de l’échantillon : ostéite Délai: 6 - 14 mois	Concentration minimale inhibitrice pour une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiogrammes seront établis sur des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin.	6 - 14 mois
Profils phénotypiques de résistance dans la population et selon l'origine de l'échantillon : plaies non diabétiques Délai: 6 - 14 mois	Concentration minimale inhibitrice pour une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiogrammes seront établis sur des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin.	6 - 14 mois
Profils phénotypiques de résistance dans la population et selon l'origine de l'échantillon : plaies diabétiques Délai: 6 - 14 mois	Concentration minimale inhibitrice pour une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiogrammes seront établis sur des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin.	6 - 14 mois
Profils phénotypiques de résistance dans la population et selon l’origine des échantillons : hémocultures Délai: 6 - 14 mois	Concentration minimale inhibitrice pour une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiogrammes seront établis sur des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin.	6 - 14 mois
Profils de résistance phénotypique dans la population et selon l'origine de l'échantillon : portage nasal Délai: 6 - 14 mois	Concentration minimale inhibitrice pour une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiogrammes seront établis sur des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin.	6 - 14 mois
Taux de formation de biofilm en absence et en présence d'antibiotiques dans une sélection (85 sous-échantillons) de souches de S. pettenkoferi selon l'origine de l'échantillon : ostéite Délai: 6 - 14 mois	Indice de formation de biofilm en présence/absence d'une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiotiques seront des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin. Résultats enregistrés sur une échelle allant de 0 = biofilm et 12 = pas de biofilm	6 - 14 mois
Taux de formation de biofilm en absence et en présence d'antibiotiques dans une sélection (85 sous-échantillons) de souches de S. pettenkoferi selon l'origine de l'échantillon : plaies non diabétiques Délai: 6 - 14 mois	Indice de formation de biofilm en présence/absence d'une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiotiques seront des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin. Résultats enregistrés sur une échelle allant de 0 = biofilm et 12 = pas de biofilm	6 - 14 mois
Taux de formation de biofilm en absence et en présence d'antibiotiques dans une sélection (85 sous-échantillons) de souches de S. pettenkoferi selon l'origine de l'échantillon : plaies diabétiques Délai: 6 - 14 mois	Indice de formation de biofilm en présence/absence d'une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiotiques seront des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin. Résultats enregistrés sur une échelle allant de 0 = biofilm et 12 = pas de biofilm	6 - 14 mois
Taux de formation de biofilm en absence et en présence d'antibiotiques dans une sélection (85 sous-échantillons) de souches de S. pettenkoferi selon l'origine de l'échantillon : hémocultures Délai: 6 - 14 mois	Indice de formation de biofilm en présence/absence d'une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiotiques seront des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin. Résultats enregistrés sur une échelle allant de 0 = biofilm et 12 = pas de biofilm	6 - 14 mois
Taux de formation de biofilm en absence et en présence d'antibiotiques dans une sélection (85 sous-échantillons) de souches de S. pettenkoferi selon l'origine de l'échantillon : portage nasal Délai: 6 - 14 mois	Indice de formation de biofilm en présence/absence d'une série d'antibiotiques (antibiogrammes d'isolats). Ces antibiotiques seront des molécules nouvellement commercialisées ou actuelles telles que la Ceftarolin, le Ceftobiprol, la Dalbavancin, la Delafloxacin, le Tedizolid et l'Oritavancin. Résultats enregistrés sur une échelle allant de 0 = biofilm et 12 = pas de biofilm	6 - 14 mois
Taux de croissance bactérienne selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 20 souches : ostéite Délai: 6 - 14 mois	Courbe de croissance bactérienne en mesurant l’absorbance sur culture bactérienne au fil du temps.	6 - 14 mois
Taux de croissance bactérienne selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 20 souches : plaies non diabétiques Délai: 6 - 14 mois	Courbe de croissance bactérienne en mesurant l’absorbance sur culture bactérienne au fil du temps.	6 - 14 mois
Taux de croissance bactérienne selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 20 souches : plaies diabétiques Délai: 6 - 14 mois	Courbe de croissance bactérienne en mesurant l’absorbance sur culture bactérienne au fil du temps.	6 - 14 mois
Taux de croissance bactérienne selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 20 souches : hémocultures Délai: 6 - 14 mois	Courbe de croissance bactérienne en mesurant l’absorbance sur culture bactérienne au fil du temps.	6 - 14 mois
Taux de croissance bactérienne selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 20 souches : portage nasal Délai: 6 - 14 mois	Courbe de croissance bactérienne en mesurant l’absorbance sur culture bactérienne au fil du temps.	6 - 14 mois
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : ostéite Délai: 6 - 14 mois	Le taux d'internalisation et de libération de LDH (signe de toxicité cellulaire de l'isolat bactérien) dans un modèle de culture cellulaire d'ostéoblastes in vitro (MC3T3-E1)	6 - 14 mois
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : multiplication bactérienne intracellulaire de souches de S. pettenkoferi issues d'ostéite Délai: 6 - 14 mois	La quantité de multiplication bactérienne intracellulaire sera évaluée dans un modèle de culture cellulaire de macrophages in vitro (RAW 264.7).	6 - 14 mois
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : plaies diabétiques Délai: 6 - 14 mois	Le taux d'internalisation et de libération de LDH (signe de toxicité cellulaire de l'isolat bactérien) dans un modèle de culture cellulaire d'ostéoblastes in vitro (MC3T3-E1)	6 - 14 mois
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : multiplication bactérienne intracellulaire de souches de S. pettenkoferi issues de plaies diabétiques Délai: 6 - 14 mois	La quantité de multiplication bactérienne intracellulaire sera évaluée dans un modèle de culture cellulaire de macrophages in vitro (RAW 264.7).	6 - 14 mois
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : hémocultures Délai: 6 - 14 mois	Le taux d'internalisation et de libération de LDH (signe de toxicité cellulaire de l'isolat bactérien) dans un modèle de culture cellulaire d'ostéoblastes in vitro (MC3T3-E1)	6 - 14 mois
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : multiplication bactérienne intracellulaire des souches de S. pettenkoferi à partir d'hémocultures Délai: 6 - 14 mois	La quantité de multiplication bactérienne intracellulaire sera évaluée dans un modèle de culture cellulaire de macrophages in vitro (RAW 264.7).	6 - 14 mois
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : portage nasal Délai: 6 - 14 mois	Le taux d'internalisation et de libération de LDH (signe de toxicité cellulaire de l'isolat bactérien) dans un modèle de culture cellulaire d'ostéoblastes in vitro (MC3T3-E1)	6 - 14 mois
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : multiplication bactérienne intracellulaire des souches de S. pettenkoferi à partir du portage nasal Délai: 6 - 14 mois	La quantité de multiplication bactérienne intracellulaire sera évaluée dans un modèle de culture cellulaire de macrophages in vitro (RAW 264.7).	6 - 14 mois
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : temps de survie de poissons zèbres diabétiques immergés dans des souches de S. pettenkoferi issues d'ostéite Délai: Jusqu'à 48 heures	Courbe de survie à 48 heures	Jusqu'à 48 heures
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : temps de survie de poissons zèbres diabétiques immergés dans des souches de S. pettenkoferi issues de plaies non diabétiques Délai: Jusqu'à 48 heures	Courbe de survie à 48 heures	Jusqu'à 48 heures
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : temps de survie de poissons zèbres diabétiques immergés dans des souches de S. pettenkoferi issues de plaies diabétiques Délai: Jusqu'à 48 heures	Courbe de survie à 48 heures	Jusqu'à 48 heures
Profils de virulence selon l'origine des échantillons dans un sous-échantillon de 3 souches : temps de survie de poissons zèbres diabétiques immergés dans des souches de S. pettenkoferi issues d'hémocultures Délai: Jusqu'à 48 heures	Courbe de survie à 48 heures	Jusqu'à 48 heures
Profils de virulence selon l'origine de l'échantillon dans un sous-échantillon de 3 souches : temps de survie de poissons zèbres diabétiques immergés dans des souches de S. pettenkoferi issues du portage nasal Délai: Jusqu'à 48 heures	Courbe de survie à 48 heures	Jusqu'à 48 heures

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Centre Hospitalier Universitaire de Nīmes

Collaborateurs

Charles University, Czech Republic

University Hospital Muenster

Rennes University Hospital

Nantes University Hospital

Örebro University, Sweden

Universität Tübingen

Staphylococcal National Reference Center, Lyon, France

Les enquêteurs

Chercheur principal: Chloé MAGNAN, Dr., Nîmes University Hospital, France

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 janvier 2024

Achèvement primaire (Estimé)

31 décembre 2025

Achèvement de l'étude (Estimé)

1 mai 2026

Dates d'inscription aux études

Première soumission

9 novembre 2024

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

12 novembre 2024

Première publication (Réel)

14 novembre 2024

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

17 novembre 2025

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

14 novembre 2025

Dernière vérification

1 novembre 2025

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

NIMAO/2023-2/CM-01

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

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