トータル・インフェクトームによる眼感染症の特徴付け
眼感染症のトータル・インフェクトーム特性評価: メタゲノム配列に基づく観察研究
調査の概要
詳細な説明
これは、メタゲノム シーケンスを使用して眼感染症の全感染トームを説明する研究者主導の観察研究です。 急性結膜炎、角膜炎、ぶどう膜炎、眼内炎などの眼感染症は、経験豊富な眼科医によって定期的な臨床検査に従って診断されます。
診断および治療プロセスとは別に追加の生物学的サンプルを収集するには、募集時に適格な対象者またはその法的保護者からの書面によるインフォームドコンセントが必要です。 臨床余剰サンプルの使用については、インフォームド・コンセントの免除申請が行われています。 インフォームドコンセント完了後、被験者からサンプリングが行われ、臨床情報が収集されます。
Illumina NovaSeq X Plus プラットフォームを使用したメタゲノム配列決定のために、結膜嚢スワブ (対象となる眼ごとに 1 つのスワブ) または眼内液 (100 μl 以上) を含む生体検体が収集されます。
参加者の臨床情報は、電子医療記録情報システムから照合されます。これには、(1) 人口統計的特徴: 年齢、性別、併存疾患。 (2)臨床検査:血液日常検査、免疫炎症因子、臨床微生物検査(PCR、血清学的検査、培養など)。 (3)画像検査:前眼部写真、角膜内皮細胞検査、角膜共焦点顕微鏡、眼底写真。
眼サンプルのメタトランスクリプトーム分析は、ウイルス、細菌、真菌、寄生虫を同定するために行われます。 病原体の存在量は RPKM (つまり、RPKM) として示されます。 100 万あたりの読み取り数を参照ゲノムの長さで割った値 (キロベース単位で測定)。
参加資格のある参加者は、上海総合病院眼科にて2024年8月から2026年12月まで連続して募集されます。 総研究期間は、最初の被験者の登録から最終分析まで 2 年間と予想されます。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Mei Kang, MPH
- 電話番号:021-36126064
- メール:mei.kang@shgh.cn
研究場所
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Shanghai
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Shanghai、Shanghai、中国、200030
- 募集
- Shanghai General Hospital
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コンタクト:
- Mei Kang, MPH
- 電話番号:02136126064
- メール:mei.kang@shgh.cn
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 1つ以上の種類の眼感染症(急性結膜炎、角膜炎、ぶどう膜炎、眼内炎を含む)の臨床診断を受けた患者。
- 生体サンプルは臨床微生物学的検査のために収集されているか、この研究への参加に同意されています。
除外基準:
1. 過去に臨床的に余剰の検体を持たない患者。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
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眼感染症コホート
1つ以上のタイプの眼感染症(急性結膜炎、角膜炎、ぶどう膜炎、眼内炎を含む)と診断された患者。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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病原体のプロフィール
時間枠:学習完了まで、平均2年
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眼球サンプルのメタゲノム技術を通じて特定された細菌、真菌、ウイルス、寄生虫。
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学習完了まで、平均2年
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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微生物の豊富さ
時間枠:学習完了まで、平均2年
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病原体の存在量は RPKM によって測定されます(つまり、
100 万あたりの読み取り数を参照ゲノムの長さで割った値 (キロベース単位で測定)。
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学習完了まで、平均2年
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協力者と研究者
捜査官
- スタディディレクター:Shuo Su, PhD、Fudan University
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Burton MJ, Ramke J, Marques AP, Bourne RRA, Congdon N, Jones I, Ah Tong BAM, Arunga S, Bachani D, Bascaran C, Bastawrous A, Blanchet K, Braithwaite T, Buchan JC, Cairns J, Cama A, Chagunda M, Chuluunkhuu C, Cooper A, Crofts-Lawrence J, Dean WH, Denniston AK, Ehrlich JR, Emerson PM, Evans JR, Frick KD, Friedman DS, Furtado JM, Gichangi MM, Gichuhi S, Gilbert SS, Gurung R, Habtamu E, Holland P, Jonas JB, Keane PA, Keay L, Khanna RC, Khaw PT, Kuper H, Kyari F, Lansingh VC, Mactaggart I, Mafwiri MM, Mathenge W, McCormick I, Morjaria P, Mowatt L, Muirhead D, Murthy GVS, Mwangi N, Patel DB, Peto T, Qureshi BM, Salomao SR, Sarah V, Shilio BR, Solomon AW, Swenor BK, Taylor HR, Wang N, Webson A, West SK, Wong TY, Wormald R, Yasmin S, Yusufu M, Silva JC, Resnikoff S, Ravilla T, Gilbert CE, Foster A, Faal HB. The Lancet Global Health Commission on Global Eye Health: vision beyond 2020. Lancet Glob Health. 2021 Apr;9(4):e489-e551. doi: 10.1016/S2214-109X(20)30488-5. Epub 2021 Feb 16. No abstract available.
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研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
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